MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	TGCTT	2	10	35	44	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011366	ATAGA	2	10	15859	15868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011366	AGGGA	2	10	17302	17311	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011366	CTCTT	2	10	37781	37790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011366	AAAGT	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011366	TCCGA	2	10	50293	50302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011366	GCTTT	2	10	50654	50663	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011366	CGAGA	2	10	67704	67713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011366	GTCAT	2	10	72303	72312	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011366	TGGAA	2	10	77808	77817	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011366	CGACG	2	10	84280	84289	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011366	AGGGG	2	10	85708	85717	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011366	GGGAG	2	10	113264	113273	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011366	AAAAT	2	10	143793	143802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011366	GGCAG	2	10	160550	160559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011366	GCCGC	2	10	170581	170590	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011366	TAGAT	2	10	172672	172681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011366	GGCGC	2	10	242935	242944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011366	TGTCT	2	10	245012	245021	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011366	GACGC	2	10	249960	249969	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011366	ATCCA	2	10	261479	261488	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011366	AAAGG	2	10	288808	288817	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011366	GGTTC	2	10	301479	301488	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011366	GCCGC	2	10	343934	343943	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011366	AGCTG	2	10	355715	355724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011366	CACCT	2	10	365497	365506	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_011366	TGATG	2	10	368290	368299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011366	CTTGT	2	10	379484	379493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011366	CTGGC	2	10	402733	402742	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011366	GAACA	2	10	408074	408083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011366	CGTGC	2	10	415822	415831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011366	CGATG	2	10	415907	415916	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011366	CGATC	2	10	419508	419517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011366	GCGCG	2	10	421922	421931	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011366	GCACA	2	10	470018	470027	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011366	CGAAA	2	10	471902	471911	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011366	CATGC	2	10	496603	496612	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.