MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	GGCG	2	8	1380	1387	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011366	GAGG	2	8	1474	1481	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011366	GAGG	2	8	1697	1704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011366	GGCG	2	8	2515	2522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011366	GTTT	2	8	15504	15511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011366	TTCA	2	8	17550	17557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011366	AATT	2	8	18747	18754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011366	TTGA	2	8	18816	18823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011366	GATG	2	8	18831	18838	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011366	ATCA	2	8	18945	18952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011366	CCGG	2	8	19112	19119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011366	CGGC	2	8	29124	29131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011366	GGGC	2	8	32378	32385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011366	AAAT	2	8	32418	32425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011366	ATCC	2	8	37769	37776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011366	ATTT	2	8	38488	38495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011366	GCAC	2	8	44540	44547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011366	CGGG	2	8	44671	44678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011366	CAAT	2	8	47740	47747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011366	CGAA	2	8	50388	50395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011366	CCGA	2	8	57099	57106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011366	GATC	2	8	58709	58716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011366	ATTA	2	8	59903	59910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011366	GCCC	2	8	59948	59955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011366	TTGA	2	8	60085	60092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011366	GAAC	2	8	84316	84323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011366	CGGC	2	8	84341	84348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011366	TGAT	2	8	86975	86982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011366	ATTT	2	8	89972	89979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011366	ATTT	2	8	90045	90052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011366	CCGG	2	8	90091	90098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011366	GCGG	2	8	99885	99892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011366	GGCC	2	8	99893	99900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011366	ACGA	2	8	106339	106346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011366	AACA	2	8	106432	106439	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011366	GGAG	2	8	112041	112048	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011366	CCCG	2	8	112051	112058	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011366	TCCA	2	8	113341	113348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011366	CATG	2	8	114761	114768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011366	GATG	2	8	118937	118944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011366	GTTC	2	8	122046	122053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011366	GTTC	2	8	122108	122115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011366	GTGA	2	8	122208	122215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011366	TGTT	2	8	122370	122377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011366	TCTG	2	8	124401	124408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011366	TGTC	2	8	130750	130757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011366	TCGA	2	8	132384	132391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011366	CCTG	2	8	139117	139124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011366	GCTG	2	8	141329	141336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011366	GAGG	2	8	146262	146269	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011366	CAGG	2	8	162234	162241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011366	GTCG	2	8	164141	164148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011366	AGGG	2	8	169604	169611	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011366	AACC	2	8	171813	171820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011366	CGAG	2	8	172571	172578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011366	TATT	2	8	186058	186065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011366	GCCC	2	8	186721	186728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_011366	CATC	2	8	189014	189021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011366	TCGA	2	8	189036	189043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011366	CAGC	2	8	189080	189087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011366	GTCG	2	8	198540	198547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011366	AGCC	2	8	202029	202036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011366	TTAC	2	8	205419	205426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011366	TTTC	2	8	211281	211288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011366	CCGG	2	8	214587	214594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011366	AAAT	2	8	218947	218954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011366	AGGG	2	8	227055	227062	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011366	GACA	2	8	238089	238096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011366	ATCG	2	8	239071	239078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011366	TTCC	2	8	243997	244004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011366	GACG	2	8	255091	255098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011366	GACT	2	8	255337	255344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011366	GTCG	2	8	271270	271277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011366	CCTG	2	8	271278	271285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011366	GCCC	2	8	275346	275353	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_011366	TCGA	2	8	276377	276384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011366	GAAC	2	8	281170	281177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011366	GGCA	2	8	290200	290207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011366	ATCG	2	8	294847	294854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011366	GATA	2	8	299775	299782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011366	GTTG	2	8	299851	299858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011366	GTCG	2	8	307353	307360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011366	ACCT	2	8	309440	309447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011366	TCGC	2	8	309811	309818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011366	TTCT	2	8	314446	314453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011366	GCCG	2	8	318229	318236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011366	GATG	2	8	318511	318518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011366	ATCA	2	8	321974	321981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011366	CGGC	2	8	324177	324184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011366	GGGA	2	8	324238	324245	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011366	TCCC	2	8	326422	326429	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_011366	TCAA	2	8	330162	330169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011366	CCGT	2	8	339870	339877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011366	TCTT	2	8	343947	343954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011366	CCAA	2	8	351835	351842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011366	CAGG	2	8	352030	352037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011366	TGTC	2	8	352285	352292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011366	GGTG	2	8	355316	355323	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011366	GACG	2	8	355369	355376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011366	GGTG	2	8	355517	355524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011366	CCCG	2	8	355668	355675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_011366	TGCG	2	8	359764	359771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011366	ACCA	2	8	369310	369317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011366	GCCG	2	8	370350	370357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011366	CCGG	2	8	373584	373591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011366	TCGA	2	8	379521	379528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011366	GGGC	2	8	383352	383359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011366	GCCG	2	8	383640	383647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011366	AATT	2	8	401012	401019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011366	TGCT	2	8	402853	402860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011366	ACCC	2	8	413675	413682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_011366	GAAC	2	8	417876	417883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011366	CCGC	2	8	418357	418364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_011366	AATG	2	8	418414	418421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011366	TCCC	2	8	419456	419463	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_011366	GATA	2	8	421914	421921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011366	TCAC	2	8	426191	426198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011366	GCCG	2	8	426287	426294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011366	TTCC	2	8	443455	443462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011366	GAAG	2	8	443509	443516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011366	CCGG	2	8	447257	447264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011366	GACC	2	8	448119	448126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011366	GCGA	2	8	455314	455321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011366	ATCC	2	8	455346	455353	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011366	GCCG	2	8	472812	472819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011366	GGCG	2	8	474260	474267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011366	GCTT	2	8	474270	474277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011366	GTGC	2	8	478633	478640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011366	AGAT	2	8	480491	480498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011366	CCCT	2	8	481842	481849	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_011366	CAAG	2	8	481850	481857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011366	CTGC	2	8	493353	493360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011366	TGCG	2	8	493958	493965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011366	GCTG	2	8	496737	496744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011366	GCGG	2	8	496755	496762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011366	ATAA	2	8	497143	497150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011366	CATA	2	8	498304	498311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011366	AGGC	2	8	498322	498329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011366	GACT	2	8	498443	498450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011366	AACC	2	8	498681	498688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011366	CCTC	2	8	501922	501929	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.