MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 9086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	GGC	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546000
2	NC_011366	CGC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
3	NC_011366	TCG	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
4	NC_011366	GTC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
5	NC_011366	GCC	2	6	385	390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
6	NC_011366	GCC	2	6	620	625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
7	NC_011366	AAG	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
8	NC_011366	AAG	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
9	NC_011366	CGT	2	6	834	839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
10	NC_011366	GTC	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
11	NC_011366	GCC	2	6	971	976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
12	NC_011366	GCA	2	6	999	1004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546000
13	NC_011366	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
14	NC_011366	CAT	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011366	GCT	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011366	CCA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011366	TCG	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011366	CGA	2	6	1258	1263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011366	ATC	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011366	GGA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011366	AAG	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011366	GCG	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011366	GGA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011366	CAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011366	GGA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011366	AAG	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011366	GCG	2	6	1650	1655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011366	GGA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011366	CAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011366	TCG	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011366	GCA	2	6	1854	1859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011366	TAA	2	6	1869	1874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011366	GAG	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011366	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011366	CCT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546001
36	NC_011366	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546001
37	NC_011366	TAG	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546001
38	NC_011366	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
39	NC_011366	TCG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
40	NC_011366	AAG	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546001
41	NC_011366	CAA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011366	TGC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011366	GGC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011366	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011366	CGC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011366	CGA	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011366	GCC	2	6	2643	2648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011366	GGC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011366	TGG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546002
50	NC_011366	GAG	3	9	2937	2945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
51	NC_011366	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546002
52	NC_011366	CGC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
53	NC_011366	GCG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
54	NC_011366	TAC	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
55	NC_011366	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
56	NC_011366	ATC	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
57	NC_011366	TTG	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546002
58	NC_011366	GCA	2	6	3690	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
59	NC_011366	GGA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
60	NC_011366	GAG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
61	NC_011366	CGA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
62	NC_011366	TCT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
63	NC_011366	CAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
64	NC_011366	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
65	NC_011366	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
66	NC_011366	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
67	NC_011366	CGA	3	9	4805	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
68	NC_011366	TGA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546002
69	NC_011366	CAA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546002
70	NC_011366	ACG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
71	NC_011366	GGC	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011366	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
73	NC_011366	CGG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
74	NC_011366	CTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
75	NC_011366	TTG	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546003
76	NC_011366	TGC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
77	NC_011366	CGA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
78	NC_011366	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
79	NC_011366	CGG	2	6	5362	5367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
80	NC_011366	GCC	2	6	5414	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
81	NC_011366	CGG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
82	NC_011366	TGC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
83	NC_011366	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
84	NC_011366	GCT	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
85	NC_011366	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
86	NC_011366	CTT	2	6	5636	5641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546003
87	NC_011366	GTC	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
88	NC_011366	CCT	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
89	NC_011366	CCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
90	NC_011366	GGC	3	9	5690	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
91	NC_011366	GAC	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
92	NC_011366	GCA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
93	NC_011366	CGC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
94	NC_011366	GCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
95	NC_011366	GCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
96	NC_011366	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546003
97	NC_011366	GCC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
98	NC_011366	TCG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
99	NC_011366	ACG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
100	NC_011366	CGC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
101	NC_011366	GCC	2	6	5957	5962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
102	NC_011366	AAG	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546003
103	NC_011366	CAT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
104	NC_011366	ACG	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
105	NC_011366	ATC	3	9	6089	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
106	NC_011366	GCG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
107	NC_011366	TGC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
108	NC_011366	CCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546004
109	NC_011366	CGG	2	6	6258	6263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
110	NC_011366	TCA	2	6	6348	6353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
111	NC_011366	GAC	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
112	NC_011366	GTC	2	6	6487	6492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
113	NC_011366	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
114	NC_011366	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
115	NC_011366	GAT	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546004
116	NC_011366	GAC	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
117	NC_011366	CGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
118	NC_011366	GCA	3	9	6732	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
119	NC_011366	CGA	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
120	NC_011366	CGG	3	9	6784	6792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
121	NC_011366	CGC	3	9	6798	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
122	NC_011366	CAC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
123	NC_011366	TGC	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
124	NC_011366	CCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
125	NC_011366	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
126	NC_011366	GAC	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
127	NC_011366	TCA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546005
128	NC_011366	AGA	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
129	NC_011366	CGA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
130	NC_011366	GAA	2	6	7047	7052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
131	NC_011366	GAC	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
132	NC_011366	CGA	3	9	7113	7121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
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144	NC_011366	TTC	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_011366	GAT	2	6	13341	13346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546010
257	NC_011366	TTG	2	6	13357	13362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546010
258	NC_011366	ATG	2	6	13468	13473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546010
259	NC_011366	CCG	2	6	13474	13479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546010
260	NC_011366	CGG	2	6	13518	13523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546010
261	NC_011366	CGG	2	6	13527	13532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546010
262	NC_011366	CCG	2	6	13616	13621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546010
263	NC_011366	GAG	2	6	13669	13674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546010
264	NC_011366	GTT	2	6	13680	13685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546010
265	NC_011366	ATG	2	6	13693	13698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546010
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268	NC_011366	ATC	2	6	13807	13812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546010
269	NC_011366	TCG	2	6	13864	13869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546010
270	NC_011366	TGA	2	6	13883	13888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546010
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272	NC_011366	GCG	2	6	14029	14034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546011
273	NC_011366	GGC	2	6	14045	14050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546011
274	NC_011366	TTC	2	6	14139	14144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546011
275	NC_011366	CTT	2	6	14179	14184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546011
276	NC_011366	CGG	2	6	14186	14191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546011
277	NC_011366	GCC	2	6	14364	14369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546011
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285	NC_011366	GCG	2	6	14762	14767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546012
286	NC_011366	ATG	2	6	14788	14793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546012
287	NC_011366	GCG	2	6	14819	14824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546012
288	NC_011366	CGG	2	6	14835	14840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546012
289	NC_011366	CGC	2	6	14894	14899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546012
290	NC_011366	CGC	2	6	14922	14927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546012
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297	NC_011366	GCC	3	9	15221	15229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546012
298	NC_011366	AGC	2	6	15373	15378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546013
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300	NC_011366	CGG	2	6	15612	15617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_011366	TTG	2	6	15625	15630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011366	TGA	2	6	15723	15728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_011366	CGG	2	6	15740	15745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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323	NC_011366	GAC	2	6	16614	16619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546015
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336	NC_011366	CGA	2	6	17328	17333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_011366	GTT	2	6	17415	17420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_011366	ATG	2	6	17469	17474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
340	NC_011366	TCA	2	6	17597	17602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546016
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348	NC_011366	ACG	2	6	17983	17988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546016
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370	NC_011366	CGT	4	12	20531	20542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
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378	NC_011366	GCG	2	6	20881	20886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
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380	NC_011366	CGG	2	6	20986	20991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
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384	NC_011366	CGA	2	6	21160	21165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
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490	NC_011366	TTC	2	6	26794	26799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546023
491	NC_011366	TCG	3	9	26804	26812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546023
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497	NC_011366	CGG	2	6	27259	27264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546024
498	NC_011366	ATG	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546024
499	NC_011366	GTC	2	6	27326	27331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546024
500	NC_011366	CGG	2	6	27373	27378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546024

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