MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 8410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	GGC	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546000
2	NC_011366	CGC	2	6	195	200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
3	NC_011366	TCG	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
4	NC_011366	GTC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
5	NC_011366	GCC	2	6	385	390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
6	NC_011366	GCC	2	6	620	625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
7	NC_011366	AAG	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
8	NC_011366	AAG	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546000
9	NC_011366	CGT	2	6	834	839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
10	NC_011366	GTC	2	6	943	948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546000
11	NC_011366	GCC	2	6	971	976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
12	NC_011366	GCA	2	6	999	1004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546000
13	NC_011366	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546000
14	NC_011366	CCT	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546001
15	NC_011366	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546001
16	NC_011366	TAG	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546001
17	NC_011366	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
18	NC_011366	TCG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546001
19	NC_011366	AAG	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546001
20	NC_011366	TGG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546002
21	NC_011366	GAG	3	9	2937	2945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
22	NC_011366	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546002
23	NC_011366	CGC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
24	NC_011366	GCG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
25	NC_011366	TAC	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
26	NC_011366	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
27	NC_011366	ATC	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546002
28	NC_011366	TTG	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546002
29	NC_011366	GCA	2	6	3690	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
30	NC_011366	GGA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
31	NC_011366	GAG	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546002
32	NC_011366	CGA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
33	NC_011366	TCT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
34	NC_011366	CAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
35	NC_011366	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546002
36	NC_011366	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546002
37	NC_011366	TCT	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546002
38	NC_011366	CGA	3	9	4805	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
39	NC_011366	TGA	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546002
40	NC_011366	CAA	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546002
41	NC_011366	ACG	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546002
42	NC_011366	CCG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
43	NC_011366	CGG	2	6	5153	5158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
44	NC_011366	CTG	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
45	NC_011366	TTG	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546003
46	NC_011366	TGC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
47	NC_011366	CGA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
48	NC_011366	GCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
49	NC_011366	CGG	2	6	5362	5367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
50	NC_011366	GCC	2	6	5414	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
51	NC_011366	CGG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
52	NC_011366	TGC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
53	NC_011366	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
54	NC_011366	GCT	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
55	NC_011366	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
56	NC_011366	CTT	2	6	5636	5641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546003
57	NC_011366	GTC	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
58	NC_011366	CCT	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
59	NC_011366	CCT	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546003
60	NC_011366	GGC	3	9	5690	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
61	NC_011366	GAC	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
62	NC_011366	GCA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
63	NC_011366	CGC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
64	NC_011366	GCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
65	NC_011366	GCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546003
66	NC_011366	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546003
67	NC_011366	GCC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
68	NC_011366	TCG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546003
69	NC_011366	ACG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546003
70	NC_011366	CGC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
71	NC_011366	GCC	2	6	5957	5962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546003
72	NC_011366	AAG	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546003
73	NC_011366	CAT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
74	NC_011366	ACG	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
75	NC_011366	ATC	3	9	6089	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
76	NC_011366	GCG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
77	NC_011366	TGC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
78	NC_011366	CCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546004
79	NC_011366	CGG	2	6	6258	6263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
80	NC_011366	TCA	2	6	6348	6353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546004
81	NC_011366	GAC	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
82	NC_011366	GTC	2	6	6487	6492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
83	NC_011366	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
84	NC_011366	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
85	NC_011366	GAT	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546004
86	NC_011366	GAC	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
87	NC_011366	CGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
88	NC_011366	GCA	3	9	6732	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
89	NC_011366	CGA	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
90	NC_011366	CGG	3	9	6784	6792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
91	NC_011366	CGC	3	9	6798	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546004
92	NC_011366	CAC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
93	NC_011366	TGC	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546004
94	NC_011366	CCA	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546004
95	NC_011366	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546004
96	NC_011366	GAC	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546004
97	NC_011366	TCA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546005
98	NC_011366	AGA	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
99	NC_011366	CGA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
100	NC_011366	GAA	2	6	7047	7052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
101	NC_011366	GAC	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
102	NC_011366	CGA	3	9	7113	7121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
103	NC_011366	GGT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546005
104	NC_011366	TCT	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546005
105	NC_011366	CGC	2	6	7196	7201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
106	NC_011366	CCG	2	6	7406	7411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
107	NC_011366	GAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546005
108	NC_011366	ACC	2	6	7558	7563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546005
109	NC_011366	GAC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
110	NC_011366	ATC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546005
111	NC_011366	AGC	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
112	NC_011366	AGC	2	6	7723	7728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546005
113	NC_011366	CCG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546005
114	NC_011366	CGA	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
115	NC_011366	CGA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
116	NC_011366	GCC	2	6	7941	7946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
117	NC_011366	CGA	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
118	NC_011366	ACG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
119	NC_011366	CGG	2	6	8081	8086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546006
120	NC_011366	CTG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546006
121	NC_011366	GCA	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
122	NC_011366	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546006
123	NC_011366	GCG	2	6	8171	8176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546006
124	NC_011366	CGT	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546006
125	NC_011366	GCA	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
126	NC_011366	CGA	2	6	8264	8269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
127	NC_011366	CCG	2	6	8339	8344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
128	NC_011366	GAC	2	6	8367	8372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
129	NC_011366	ACG	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
130	NC_011366	CGT	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546006
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132	NC_011366	GAC	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546006
133	NC_011366	CCG	2	6	8519	8524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
134	NC_011366	GCC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546006
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144	NC_011366	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546006
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254	NC_011366	GCG	2	6	14762	14767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546012
255	NC_011366	ATG	2	6	14788	14793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546012
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257	NC_011366	CGG	2	6	14835	14840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546012
258	NC_011366	CGC	2	6	14894	14899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546012
259	NC_011366	CGC	2	6	14922	14927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546012
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500	NC_011366	GGC	2	6	30627	30632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546027

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