MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	G	6	6	657	662	0 %	0 %	100 %	0 %	209546000
2	NC_011366	C	6	6	2882	2887	0 %	0 %	0 %	100 %	209546002
3	NC_011366	G	6	6	3357	3362	0 %	0 %	100 %	0 %	209546002
4	NC_011366	A	8	8	3758	3765	100 %	0 %	0 %	0 %	209546002
5	NC_011366	C	6	6	5101	5106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_011366	G	6	6	18576	18581	0 %	0 %	100 %	0 %	209546016
7	NC_011366	A	6	6	19042	19047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011366	T	6	6	23746	23751	0 %	100 %	0 %	0 %	209546020
9	NC_011366	C	6	6	24905	24910	0 %	0 %	0 %	100 %	209546021
10	NC_011366	T	6	6	25618	25623	0 %	100 %	0 %	0 %	209546022
11	NC_011366	A	7	7	29090	29096	100 %	0 %	0 %	0 %	209546025
12	NC_011366	C	6	6	37922	37927	0 %	0 %	0 %	100 %	209546034
13	NC_011366	A	6	6	38524	38529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011366	A	6	6	39327	39332	100 %	0 %	0 %	0 %	209546035
15	NC_011366	A	6	6	44600	44605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011366	T	7	7	50890	50896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011366	T	6	6	59959	59964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011366	T	6	6	75039	75044	0 %	100 %	0 %	0 %	209546067
19	NC_011366	C	6	6	75136	75141	0 %	0 %	0 %	100 %	209546067
20	NC_011366	A	6	6	76173	76178	100 %	0 %	0 %	0 %	209546067
21	NC_011366	T	6	6	77899	77904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011366	T	6	6	87027	87032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011366	A	6	6	89995	90000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011366	A	6	6	90995	91000	100 %	0 %	0 %	0 %	209546076
25	NC_011366	T	6	6	93320	93325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011366	T	6	6	101273	101278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011366	A	6	6	102223	102228	100 %	0 %	0 %	0 %	209546089
28	NC_011366	A	7	7	103727	103733	100 %	0 %	0 %	0 %	209546090
29	NC_011366	T	6	6	108074	108079	0 %	100 %	0 %	0 %	209546092
30	NC_011366	C	6	6	108613	108618	0 %	0 %	0 %	100 %	209546093
31	NC_011366	G	6	6	112238	112243	0 %	0 %	100 %	0 %	209546097
32	NC_011366	A	7	7	114774	114780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011366	T	6	6	133662	133667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011366	C	6	6	134126	134131	0 %	0 %	0 %	100 %	209546118
35	NC_011366	T	6	6	147697	147702	0 %	100 %	0 %	0 %	209546129
36	NC_011366	T	6	6	152932	152937	0 %	100 %	0 %	0 %	209546133
37	NC_011366	C	6	6	155616	155621	0 %	0 %	0 %	100 %	209546136
38	NC_011366	T	6	6	172721	172726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011366	T	7	7	182124	182130	0 %	100 %	0 %	0 %	209546153
40	NC_011366	C	6	6	189320	189325	0 %	0 %	0 %	100 %	209546161
41	NC_011366	A	6	6	190035	190040	100 %	0 %	0 %	0 %	209546162
42	NC_011366	A	6	6	190801	190806	100 %	0 %	0 %	0 %	209546163
43	NC_011366	A	6	6	199522	199527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011366	T	6	6	203513	203518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011366	T	7	7	205362	205368	0 %	100 %	0 %	0 %	209546179
46	NC_011366	T	6	6	210770	210775	0 %	100 %	0 %	0 %	209546183
47	NC_011366	T	6	6	214524	214529	0 %	100 %	0 %	0 %	209546187
48	NC_011366	A	6	6	216313	216318	100 %	0 %	0 %	0 %	209546189
49	NC_011366	A	6	6	216675	216680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011366	A	6	6	219218	219223	100 %	0 %	0 %	0 %	209546191
51	NC_011366	C	6	6	226198	226203	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_011366	T	6	6	235284	235289	0 %	100 %	0 %	0 %	209546207
53	NC_011366	T	6	6	237114	237119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011366	G	6	6	238796	238801	0 %	0 %	100 %	0 %	209546211
55	NC_011366	T	6	6	260909	260914	0 %	100 %	0 %	0 %	209546231
56	NC_011366	T	6	6	261535	261540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011366	T	6	6	265859	265864	0 %	100 %	0 %	0 %	209546235
58	NC_011366	A	6	6	271767	271772	100 %	0 %	0 %	0 %	209546244
59	NC_011366	A	6	6	277868	277873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011366	A	6	6	280408	280413	100 %	0 %	0 %	0 %	209546254
61	NC_011366	T	6	6	285884	285889	0 %	100 %	0 %	0 %	209546260
62	NC_011366	T	6	6	291556	291561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011366	G	7	7	297277	297283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011366	C	6	6	298280	298285	0 %	0 %	0 %	100 %	209546271
65	NC_011366	T	6	6	312175	312180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011366	G	6	6	317076	317081	0 %	0 %	100 %	0 %	209546283
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68	NC_011366	T	6	6	329938	329943	0 %	100 %	0 %	0 %	209546291
69	NC_011366	A	6	6	330700	330705	100 %	0 %	0 %	0 %	209546293
70	NC_011366	A	6	6	334925	334930	100 %	0 %	0 %	0 %	209546297
71	NC_011366	A	6	6	334993	334998	100 %	0 %	0 %	0 %	209546297
72	NC_011366	C	6	6	343343	343348	0 %	0 %	0 %	100 %	209546306
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74	NC_011366	C	6	6	346965	346970	0 %	0 %	0 %	100 %	209546309
75	NC_011366	G	6	6	346999	347004	0 %	0 %	100 %	0 %	209546309
76	NC_011366	A	6	6	350128	350133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011366	A	6	6	351713	351718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011366	A	6	6	351729	351734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011366	T	6	6	365558	365563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011366	T	6	6	369231	369236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011366	T	6	6	373759	373764	0 %	100 %	0 %	0 %	209546340
82	NC_011366	A	7	7	383442	383448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011366	G	6	6	386971	386976	0 %	0 %	100 %	0 %	209546350
84	NC_011366	T	7	7	395493	395499	0 %	100 %	0 %	0 %	209546357
85	NC_011366	T	6	6	396607	396612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011366	A	6	6	396946	396951	100 %	0 %	0 %	0 %	209546360
87	NC_011366	G	6	6	399690	399695	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011366	A	6	6	402783	402788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011366	T	6	6	408239	408244	0 %	100 %	0 %	0 %	209546370
90	NC_011366	A	6	6	412692	412697	100 %	0 %	0 %	0 %	209546372
91	NC_011366	G	6	6	412994	412999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011366	A	6	6	413851	413856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011366	A	6	6	418349	418354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011366	A	6	6	418451	418456	100 %	0 %	0 %	0 %	209546377
95	NC_011366	A	6	6	419157	419162	100 %	0 %	0 %	0 %	209546377
96	NC_011366	A	6	6	424756	424761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011366	A	6	6	424876	424881	100 %	0 %	0 %	0 %	209546383
98	NC_011366	A	6	6	425118	425123	100 %	0 %	0 %	0 %	209546383
99	NC_011366	G	6	6	426322	426327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011366	T	7	7	426372	426378	0 %	100 %	0 %	0 %	209546385
101	NC_011366	T	7	7	434747	434753	0 %	100 %	0 %	0 %	209546387
102	NC_011366	T	7	7	440078	440084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011366	T	6	6	444073	444078	0 %	100 %	0 %	0 %	209546395
104	NC_011366	T	6	6	444816	444821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011366	T	6	6	444944	444949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011366	T	6	6	445161	445166	0 %	100 %	0 %	0 %	209546396
107	NC_011366	G	7	7	451654	451660	0 %	0 %	100 %	0 %	209546402
108	NC_011366	C	6	6	468393	468398	0 %	0 %	0 %	100 %	209546418
109	NC_011366	T	6	6	469843	469848	0 %	100 %	0 %	0 %	209546420
110	NC_011366	T	7	7	474276	474282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011366	C	6	6	476484	476489	0 %	0 %	0 %	100 %	209546425
112	NC_011366	A	7	7	481748	481754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011366	A	6	6	499147	499152	100 %	0 %	0 %	0 %	209546446
114	NC_011366	G	6	6	500017	500022	0 %	0 %	100 %	0 %	209546447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.