MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 chromosome

Total Repeats: 4079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011365	GCGGG	2	10	607	616	0 %	0 %	80 %	20 %	209542189
2	NC_011365	GACCC	2	10	2742	2751	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011365	CCTGG	2	10	2826	2835	0 %	20 %	40 %	40 %	209542191
4	NC_011365	GCGCG	2	10	2934	2943	0 %	0 %	60 %	40 %	209542191
5	NC_011365	GCCGG	2	10	3174	3183	0 %	0 %	60 %	40 %	209542191
6	NC_011365	CAATC	2	10	3951	3960	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011365	CCCGA	2	10	5022	5031	20 %	0 %	20 %	60 %	209542192
8	NC_011365	CTCGT	2	10	5058	5067	0 %	40 %	20 %	40 %	209542192
9	NC_011365	CCGCG	2	10	6384	6393	0 %	0 %	40 %	60 %	209542192
10	NC_011365	TTGGC	2	10	6543	6552	0 %	40 %	40 %	20 %	209542193
11	NC_011365	CTGGG	2	10	6731	6740	0 %	20 %	60 %	20 %	209542193
12	NC_011365	GCGCT	2	10	7115	7124	0 %	20 %	40 %	40 %	209542193
13	NC_011365	GCGCC	2	10	7596	7605	0 %	0 %	40 %	60 %	209542194
14	NC_011365	GCGAT	2	10	8008	8017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011365	CCGTC	2	10	8115	8124	0 %	20 %	20 %	60 %	209542195
16	NC_011365	CGGGC	2	10	8305	8314	0 %	0 %	60 %	40 %	209542195
17	NC_011365	GCCGC	2	10	8336	8345	0 %	0 %	40 %	60 %	209542195
18	NC_011365	CTGGC	2	10	8520	8529	0 %	20 %	40 %	40 %	209542195
19	NC_011365	CGGGC	2	10	8986	8995	0 %	0 %	60 %	40 %	209542195
20	NC_011365	GGGCC	2	10	9409	9418	0 %	0 %	60 %	40 %	209542195
21	NC_011365	GAGCA	2	10	10609	10618	40 %	0 %	40 %	20 %	209542196
22	NC_011365	CCGCC	2	10	11671	11680	0 %	0 %	20 %	80 %	209542197
23	NC_011365	GGGGT	2	10	12330	12339	0 %	20 %	80 %	0 %	209542197
24	NC_011365	TCGGG	2	10	13182	13191	0 %	20 %	60 %	20 %	209542199
25	NC_011365	GGGCG	2	10	13587	13596	0 %	0 %	80 %	20 %	209542200
26	NC_011365	GCGCG	2	10	15548	15557	0 %	0 %	60 %	40 %	209542201
27	NC_011365	TTGTT	2	10	17089	17098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011365	CGGCG	2	10	17170	17179	0 %	0 %	60 %	40 %	209542202
29	NC_011365	GGCGA	2	10	17821	17830	20 %	0 %	60 %	20 %	209542203
30	NC_011365	GCGCG	2	10	18335	18344	0 %	0 %	60 %	40 %	209542203
31	NC_011365	CCGGC	2	10	20616	20625	0 %	0 %	40 %	60 %	209542204
32	NC_011365	GATGC	2	10	21197	21206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011365	GCCGC	2	10	21280	21289	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011365	CTGCG	2	10	22301	22310	0 %	20 %	40 %	40 %	209542205
35	NC_011365	CGGCC	2	10	22634	22643	0 %	0 %	40 %	60 %	209542206
36	NC_011365	GAACG	2	10	24096	24105	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011365	GCGCC	2	10	24334	24343	0 %	0 %	40 %	60 %	209542207
38	NC_011365	TGGCG	2	10	24676	24685	0 %	20 %	60 %	20 %	209542207
39	NC_011365	GCGAT	2	10	25365	25374	20 %	20 %	40 %	20 %	209542208
40	NC_011365	GCCCA	2	10	25715	25724	20 %	0 %	20 %	60 %	209542208
41	NC_011365	GCGCC	2	10	27266	27275	0 %	0 %	40 %	60 %	209542210
42	NC_011365	TGCCG	2	10	27465	27474	0 %	20 %	40 %	40 %	209542210
43	NC_011365	GCCGG	2	10	27855	27864	0 %	0 %	60 %	40 %	209542211
44	NC_011365	TGCGC	2	10	28894	28903	0 %	20 %	40 %	40 %	209542212
45	NC_011365	GGGGC	2	10	29161	29170	0 %	0 %	80 %	20 %	209542212
46	NC_011365	GCCGG	2	10	29730	29739	0 %	0 %	60 %	40 %	209542213
47	NC_011365	GGCGT	2	10	30650	30659	0 %	20 %	60 %	20 %	209542214
48	NC_011365	GCCGG	2	10	32768	32777	0 %	0 %	60 %	40 %	209542216
49	NC_011365	GCGCA	2	10	34196	34205	20 %	0 %	40 %	40 %	209542217
50	NC_011365	TGGCG	2	10	34543	34552	0 %	20 %	60 %	20 %	209542217
51	NC_011365	CGGGG	2	10	35587	35596	0 %	0 %	80 %	20 %	209542219
52	NC_011365	CGCGC	2	10	36120	36129	0 %	0 %	40 %	60 %	209542219
53	NC_011365	CCCCG	2	10	36558	36567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_011365	AGGGC	2	10	38890	38899	20 %	0 %	60 %	20 %	209542221
55	NC_011365	AGGGC	2	10	38911	38920	20 %	0 %	60 %	20 %	209542221
56	NC_011365	GGCCT	2	10	40207	40216	0 %	20 %	40 %	40 %	209542222
57	NC_011365	ACGGC	2	10	40422	40431	20 %	0 %	40 %	40 %	209542222
58	NC_011365	GGGGC	2	10	42268	42277	0 %	0 %	80 %	20 %	209542223
59	NC_011365	ACGAC	2	10	42460	42469	40 %	0 %	20 %	40 %	209542223
60	NC_011365	GGACC	2	10	44005	44014	20 %	0 %	40 %	40 %	209542226
61	NC_011365	CATCC	2	10	45028	45037	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011365	CTGCG	2	10	45849	45858	0 %	20 %	40 %	40 %	209542228
63	NC_011365	GGCCA	2	10	47032	47041	20 %	0 %	40 %	40 %	209542229
64	NC_011365	GGCGA	2	10	47155	47164	20 %	0 %	60 %	20 %	209542229
65	NC_011365	GGATG	2	10	47886	47895	20 %	20 %	60 %	0 %	209542229
66	NC_011365	CCATC	2	10	48254	48263	20 %	20 %	0 %	60 %	209542230
67	NC_011365	GGGGC	2	10	48813	48822	0 %	0 %	80 %	20 %	209542230
68	NC_011365	CGCGC	2	10	49100	49109	0 %	0 %	40 %	60 %	209542230
69	NC_011365	TTCGC	2	10	49238	49247	0 %	40 %	20 %	40 %	209542230
70	NC_011365	CCGCT	2	10	49978	49987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_011365	ATGCA	2	10	50530	50539	40 %	20 %	20 %	20 %	209542231
72	NC_011365	GCATC	2	10	51832	51841	20 %	20 %	20 %	40 %	209542233
73	NC_011365	GCGCG	2	10	54505	54514	0 %	0 %	60 %	40 %	209542234
74	NC_011365	GGGAT	2	10	55291	55300	20 %	20 %	60 %	0 %	209542235
75	NC_011365	CGCGG	2	10	56573	56582	0 %	0 %	60 %	40 %	209542238
76	NC_011365	GCCTG	2	10	58952	58961	0 %	20 %	40 %	40 %	209542239
77	NC_011365	CGGCA	2	10	59000	59009	20 %	0 %	40 %	40 %	209542240
78	NC_011365	GCACC	2	10	59180	59189	20 %	0 %	20 %	60 %	209542240
79	NC_011365	TCGTG	2	10	59599	59608	0 %	40 %	40 %	20 %	209542240
80	NC_011365	CGCGC	2	10	60362	60371	0 %	0 %	40 %	60 %	209542241
81	NC_011365	ATGGC	2	10	62378	62387	20 %	20 %	40 %	20 %	209542243
82	NC_011365	CATTG	2	10	63667	63676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011365	CCGGT	2	10	64245	64254	0 %	20 %	40 %	40 %	209542246
84	NC_011365	GCGCC	2	10	66056	66065	0 %	0 %	40 %	60 %	209542247
85	NC_011365	GCCGC	2	10	66384	66393	0 %	0 %	40 %	60 %	209542248
86	NC_011365	CCGCC	2	10	67119	67128	0 %	0 %	20 %	80 %	209542249
87	NC_011365	AGAGA	2	10	67996	68005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011365	CGTCC	2	10	68532	68541	0 %	20 %	20 %	60 %	209542251
89	NC_011365	GCGTC	2	10	69023	69032	0 %	20 %	40 %	40 %	209542251
90	NC_011365	ATCAC	2	10	69362	69371	40 %	20 %	0 %	40 %	209542251
91	NC_011365	GGCGC	2	10	70966	70975	0 %	0 %	60 %	40 %	209542252
92	NC_011365	CGCGC	2	10	71302	71311	0 %	0 %	40 %	60 %	209542252
93	NC_011365	CCGGT	2	10	71820	71829	0 %	20 %	40 %	40 %	209542252
94	NC_011365	GCGCG	2	10	72544	72553	0 %	0 %	60 %	40 %	209542252
95	NC_011365	GTCCG	2	10	72586	72595	0 %	20 %	40 %	40 %	209542252
96	NC_011365	CGGGC	2	10	73720	73729	0 %	0 %	60 %	40 %	209542252
97	NC_011365	CGGCG	2	10	73870	73879	0 %	0 %	60 %	40 %	209542252
98	NC_011365	CAGCG	2	10	74055	74064	20 %	0 %	40 %	40 %	209542252
99	NC_011365	CGACG	2	10	75233	75242	20 %	0 %	40 %	40 %	209542254
100	NC_011365	GCCTG	2	10	78082	78091	0 %	20 %	40 %	40 %	209542257
101	NC_011365	GCGCC	2	10	78109	78118	0 %	0 %	40 %	60 %	209542257
102	NC_011365	CCGTC	2	10	78796	78805	0 %	20 %	20 %	60 %	209542258
103	NC_011365	CGGGG	2	10	78910	78919	0 %	0 %	80 %	20 %	209542258
104	NC_011365	CGCGG	2	10	80603	80612	0 %	0 %	60 %	40 %	209542259
105	NC_011365	GGGCT	2	10	81605	81614	0 %	20 %	60 %	20 %	209542259
106	NC_011365	CGGCG	2	10	82261	82270	0 %	0 %	60 %	40 %	209542259
107	NC_011365	CTGGA	2	10	84422	84431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011365	GGGCC	2	10	85649	85658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011365	GAACG	2	10	85669	85678	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011365	CCGCT	2	10	86791	86800	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_011365	GCGAC	2	10	87110	87119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_011365	GCCGG	2	10	88390	88399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011365	TCCAG	2	10	88452	88461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011365	ACCGG	2	10	88979	88988	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011365	CACGG	2	10	90044	90053	20 %	0 %	40 %	40 %	209542261
116	NC_011365	GCTCG	2	10	90181	90190	0 %	20 %	40 %	40 %	209542262
117	NC_011365	CGGCG	2	10	90775	90784	0 %	0 %	60 %	40 %	209542263
118	NC_011365	CATCG	2	10	91100	91109	20 %	20 %	20 %	40 %	209542263
119	NC_011365	CCAGC	2	10	91413	91422	20 %	0 %	20 %	60 %	209542264
120	NC_011365	ATCCG	2	10	92060	92069	20 %	20 %	20 %	40 %	209542264
121	NC_011365	TCGGC	2	10	93248	93257	0 %	20 %	40 %	40 %	209542265
122	NC_011365	AGGGC	2	10	94171	94180	20 %	0 %	60 %	20 %	209542266
123	NC_011365	GTCGG	2	10	94534	94543	0 %	20 %	60 %	20 %	209542267
124	NC_011365	TCGGC	2	10	94772	94781	0 %	20 %	40 %	40 %	209542268
125	NC_011365	CGGAT	2	10	95127	95136	20 %	20 %	40 %	20 %	209542268
126	NC_011365	CCAGC	2	10	95454	95463	20 %	0 %	20 %	60 %	209542268
127	NC_011365	GTCCG	2	10	95767	95776	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011365	AGGCC	2	10	96114	96123	20 %	0 %	40 %	40 %	209542269
129	NC_011365	AGGTC	2	10	97104	97113	20 %	20 %	40 %	20 %	209542270
130	NC_011365	GGCGA	2	10	97791	97800	20 %	0 %	60 %	20 %	209542271
131	NC_011365	TGGGC	2	10	98324	98333	0 %	20 %	60 %	20 %	209542271
132	NC_011365	TCGGG	2	10	99301	99310	0 %	20 %	60 %	20 %	209542272
133	NC_011365	TGTTC	2	10	101757	101766	0 %	60 %	20 %	20 %	209542273
134	NC_011365	ATCGG	2	10	103494	103503	20 %	20 %	40 %	20 %	209542277
135	NC_011365	CCGCT	2	10	104463	104472	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_011365	TGGCG	2	10	104640	104649	0 %	20 %	60 %	20 %	209542278
137	NC_011365	GCCGG	2	10	104877	104886	0 %	0 %	60 %	40 %	209542278
138	NC_011365	GCCGC	2	10	104972	104981	0 %	0 %	40 %	60 %	209542278
139	NC_011365	CGCGG	2	10	105088	105097	0 %	0 %	60 %	40 %	209542278
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402	NC_011365	TGCGC	2	10	326209	326218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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