MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	GGCTG	2	10	2810	2819	0 %	20 %	60 %	20 %	209418041
2	NC_011355	CCAGC	2	10	3854	3863	20 %	0 %	20 %	60 %	209418042
3	NC_011355	ACCCA	2	10	4107	4116	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_011355	ACACC	2	10	4814	4823	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011355	CCTGG	2	10	5953	5962	0 %	20 %	40 %	40 %	209418043
6	NC_011355	ACCCC	2	10	10122	10131	20 %	0 %	0 %	80 %	209418049
7	NC_011355	TGGAT	2	10	11335	11344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011355	ACGCC	2	10	13016	13025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_011355	CTCGG	2	10	13224	13233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011355	GCGCC	2	10	14150	14159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011355	GCCGC	2	10	17319	17328	0 %	0 %	40 %	60 %	209418051
12	NC_011355	CGGTG	2	10	18750	18759	0 %	20 %	60 %	20 %	209418051
13	NC_011355	CGGCC	2	10	20367	20376	0 %	0 %	40 %	60 %	209418053
14	NC_011355	CGGCC	2	10	20784	20793	0 %	0 %	40 %	60 %	209418054
15	NC_011355	GGCTG	2	10	22395	22404	0 %	20 %	60 %	20 %	209418056
16	NC_011355	CAAAT	2	10	25169	25178	60 %	20 %	0 %	20 %	209418057
17	NC_011355	CGACA	2	10	25546	25555	40 %	0 %	20 %	40 %	209418057
18	NC_011355	TGCGA	2	10	25643	25652	20 %	20 %	40 %	20 %	209418058
19	NC_011355	CGCAG	2	10	25923	25932	20 %	0 %	40 %	40 %	209418058
20	NC_011355	GCCCG	2	10	27845	27854	0 %	0 %	40 %	60 %	209418060
21	NC_011355	TTTCG	2	10	29131	29140	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011355	TGGTG	2	10	30169	30178	0 %	40 %	60 %	0 %	209418063
23	NC_011355	CGTGG	2	10	30502	30511	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011355	GCGCG	2	10	30512	30521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011355	CACAC	2	10	30992	31001	40 %	0 %	0 %	60 %	209418064
26	NC_011355	CGCAA	2	10	32363	32372	40 %	0 %	20 %	40 %	209418067
27	NC_011355	GAATG	2	10	32781	32790	40 %	20 %	40 %	0 %	209418068
28	NC_011355	GTGTC	2	10	33005	33014	0 %	40 %	40 %	20 %	209418068
29	NC_011355	CAAAC	2	10	33346	33355	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011355	TGCGC	2	10	33625	33634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011355	TGTGG	2	10	33936	33945	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011355	TCGGG	2	10	34054	34063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011355	CGCTG	2	10	34903	34912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011355	GCATC	2	10	35182	35191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011355	TCCGA	2	10	35698	35707	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011355	TCGCC	2	10	37750	37759	0 %	20 %	20 %	60 %	209418071
37	NC_011355	ACCAA	2	10	42554	42563	60 %	0 %	0 %	40 %	209418075
38	NC_011355	CCACC	2	10	43028	43037	20 %	0 %	0 %	80 %	209418075
39	NC_011355	CGCTG	2	10	45073	45082	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011355	GCATC	2	10	45352	45361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011355	TCCGA	2	10	45868	45877	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011355	CAGAT	2	10	46605	46614	40 %	20 %	20 %	20 %	209418077
43	NC_011355	GGGGT	2	10	47198	47207	0 %	20 %	80 %	0 %	209418078
44	NC_011355	TTGGT	2	10	47674	47683	0 %	60 %	40 %	0 %	209418078
45	NC_011355	ATCGG	2	10	49062	49071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011355	GATGC	2	10	49578	49587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011355	CAGCG	2	10	49857	49866	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011355	GCGAG	2	10	51332	51341	20 %	0 %	60 %	20 %	209418080
49	NC_011355	GGCTG	2	10	51721	51730	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
50	NC_011355	CAGGC	2	10	52109	52118	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
51	NC_011355	CCGCG	2	10	52526	52535	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
52	NC_011355	GTGAG	2	10	54436	54445	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
53	NC_011355	GCAAC	2	10	55131	55140	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
54	NC_011355	GGCTG	2	10	57136	57145	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
55	NC_011355	CAGGC	2	10	57524	57533	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
56	NC_011355	CCGCG	2	10	57941	57950	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
57	NC_011355	GTGAG	2	10	59851	59860	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
58	NC_011355	GGCTG	2	10	62551	62560	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
59	NC_011355	CAGGC	2	10	62939	62948	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
60	NC_011355	CCGCG	2	10	63356	63365	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
61	NC_011355	GTGAG	2	10	65266	65275	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
62	NC_011355	GGCTG	2	10	67966	67975	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
63	NC_011355	CAGGC	2	10	68354	68363	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
64	NC_011355	CCGCG	2	10	68771	68780	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
65	NC_011355	GTGAG	2	10	70687	70696	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
66	NC_011355	AGCCA	2	10	75034	75043	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
67	NC_011355	TCGGC	2	10	75318	75327	0 %	20 %	40 %	40 %	209418080
68	NC_011355	CGAGC	2	10	75555	75564	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
69	NC_011355	AGCCA	2	10	79657	79666	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
70	NC_011355	TCGGC	2	10	79941	79950	0 %	20 %	40 %	40 %	209418080
71	NC_011355	CGAGC	2	10	80178	80187	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
72	NC_011355	GGCTG	2	10	82630	82639	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
73	NC_011355	CAGGC	2	10	83018	83027	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
74	NC_011355	CCGCG	2	10	83435	83444	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
75	NC_011355	GTGAG	2	10	85345	85354	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
76	NC_011355	CGCTG	2	10	89267	89276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011355	GCATC	2	10	89546	89555	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011355	TCCGA	2	10	90062	90071	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011355	GCCCC	2	10	91255	91264	0 %	0 %	20 %	80 %	209418082
80	NC_011355	GCGGT	2	10	91413	91422	0 %	20 %	60 %	20 %	209418082
81	NC_011355	GGGGT	2	10	92670	92679	0 %	20 %	80 %	0 %	209418083
82	NC_011355	TTGGT	2	10	93146	93155	0 %	60 %	40 %	0 %	209418083
83	NC_011355	CGCTG	2	10	94671	94680	0 %	20 %	40 %	40 %	209418084
84	NC_011355	GCATC	2	10	94950	94959	20 %	20 %	20 %	40 %	209418084
85	NC_011355	TCCGA	2	10	95465	95474	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011355	GCCGG	2	10	96972	96981	0 %	0 %	60 %	40 %	209418085
87	NC_011355	CGCCA	2	10	97143	97152	20 %	0 %	20 %	60 %	209418085
88	NC_011355	CCTCA	2	10	97350	97359	20 %	20 %	0 %	60 %	209418086
89	NC_011355	GCGAG	2	10	97938	97947	20 %	0 %	60 %	20 %	209418086
90	NC_011355	GGCTG	2	10	98327	98336	0 %	20 %	60 %	20 %	209418086
91	NC_011355	CAGGC	2	10	98715	98724	20 %	0 %	40 %	40 %	209418086
92	NC_011355	CCGCG	2	10	99132	99141	0 %	0 %	40 %	60 %	209418086
93	NC_011355	GTGAG	2	10	101990	101999	20 %	20 %	60 %	0 %	209418086
94	NC_011355	GCAAC	2	10	102685	102694	40 %	0 %	20 %	40 %	209418086
95	NC_011355	GGCTG	2	10	105009	105018	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
96	NC_011355	CAGGC	2	10	105397	105406	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
97	NC_011355	CCGCG	2	10	105814	105823	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
98	NC_011355	GTGAG	2	10	107724	107733	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
99	NC_011355	GCAAC	2	10	108419	108428	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
100	NC_011355	GGCTG	2	10	110421	110430	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
101	NC_011355	CAGGC	2	10	110809	110818	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
102	NC_011355	CCGCG	2	10	111226	111235	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
103	NC_011355	GTGAG	2	10	114102	114111	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
104	NC_011355	GGCTG	2	10	116802	116811	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
105	NC_011355	CAGGC	2	10	117190	117199	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
106	NC_011355	CCGCG	2	10	117607	117616	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
107	NC_011355	GTGAG	2	10	119517	119526	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
108	NC_011355	AGCCA	2	10	123882	123891	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
109	NC_011355	TCGGC	2	10	124166	124175	0 %	20 %	40 %	40 %	209418087
110	NC_011355	CGAGC	2	10	124403	124412	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
111	NC_011355	GGCTG	2	10	126855	126864	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
112	NC_011355	CAGGC	2	10	127243	127252	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
113	NC_011355	CCGCG	2	10	127660	127669	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
114	NC_011355	GTGAG	2	10	130518	130527	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
115	NC_011355	GGCTG	2	10	133197	133206	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
116	NC_011355	CAGGC	2	10	133585	133594	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
117	NC_011355	CCGCG	2	10	134002	134011	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
118	NC_011355	GTGAG	2	10	135918	135927	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
119	NC_011355	GGCTG	2	10	138618	138627	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
120	NC_011355	CAGGC	2	10	139006	139015	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
121	NC_011355	CCGCG	2	10	139423	139432	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
122	NC_011355	GTGAG	2	10	142281	142290	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
123	NC_011355	GGCTG	2	10	144978	144987	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
124	NC_011355	CAGGC	2	10	145366	145375	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
125	NC_011355	CCGCG	2	10	145783	145792	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
126	NC_011355	GTGAG	2	10	147693	147702	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
127	NC_011355	GCAAC	2	10	148388	148397	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
128	NC_011355	GGCTG	2	10	150390	150399	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
129	NC_011355	CAGGC	2	10	150778	150787	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
130	NC_011355	CCGCG	2	10	151195	151204	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
131	NC_011355	GTGAG	2	10	153105	153114	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
132	NC_011355	GCAAC	2	10	153800	153809	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
133	NC_011355	GATGC	2	10	157356	157365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011355	CAGCG	2	10	157646	157655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011355	GGTAT	2	10	158681	158690	20 %	40 %	40 %	0 %	209418089
136	NC_011355	GGGGT	2	10	159134	159143	0 %	20 %	80 %	0 %	209418089
137	NC_011355	CGCTG	2	10	160631	160640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011355	GCATC	2	10	160910	160919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011355	TCCGA	2	10	161426	161435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011355	ATCGG	2	10	164762	164771	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011355	GATGC	2	10	165279	165288	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011355	CAGCG	2	10	165558	165567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_011355	CTGCA	2	10	166712	166721	20 %	20 %	20 %	40 %	209418092
144	NC_011355	CGATG	2	10	169672	169681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011355	CGGCG	2	10	169759	169768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011355	CGGGG	2	10	169848	169857	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011355	TGGCG	2	10	172141	172150	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011355	GGCTG	2	10	176236	176245	0 %	20 %	60 %	20 %	209418096
149	NC_011355	CTGTG	2	10	177003	177012	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_011355	AGCCG	2	10	178873	178882	20 %	0 %	40 %	40 %	209418097
151	NC_011355	CGCCA	2	10	178985	178994	20 %	0 %	20 %	60 %	209418097
152	NC_011355	TGTGT	2	10	181121	181130	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011355	CAACC	2	10	184410	184419	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
154	NC_011355	GTCGA	2	10	185049	185058	20 %	20 %	40 %	20 %	209418102
155	NC_011355	CGCTG	2	10	185604	185613	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_011355	GGTTG	2	10	188907	188916	0 %	40 %	60 %	0 %	209418107
157	NC_011355	GCCGG	2	10	189135	189144	0 %	0 %	60 %	40 %	209418107
158	NC_011355	CGGCG	2	10	190511	190520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.