MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	ACCCA	2	10	4107	4116	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011355	ACACC	2	10	4814	4823	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011355	TGGAT	2	10	11335	11344	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011355	ACGCC	2	10	13016	13025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011355	CTCGG	2	10	13224	13233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011355	GCGCC	2	10	14150	14159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011355	TTTCG	2	10	29131	29140	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011355	CGTGG	2	10	30502	30511	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011355	GCGCG	2	10	30512	30521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011355	CAAAC	2	10	33346	33355	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011355	TGCGC	2	10	33625	33634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011355	TGTGG	2	10	33936	33945	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011355	TCGGG	2	10	34054	34063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011355	CGCTG	2	10	34903	34912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011355	GCATC	2	10	35182	35191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011355	TCCGA	2	10	35698	35707	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011355	CGCTG	2	10	45073	45082	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011355	GCATC	2	10	45352	45361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011355	TCCGA	2	10	45868	45877	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011355	ATCGG	2	10	49062	49071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011355	GATGC	2	10	49578	49587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011355	CAGCG	2	10	49857	49866	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011355	CGCTG	2	10	89267	89276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011355	GCATC	2	10	89546	89555	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011355	TCCGA	2	10	90062	90071	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011355	TCCGA	2	10	95465	95474	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011355	GATGC	2	10	157356	157365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011355	CAGCG	2	10	157646	157655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011355	CGCTG	2	10	160631	160640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011355	GCATC	2	10	160910	160919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011355	TCCGA	2	10	161426	161435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011355	ATCGG	2	10	164762	164771	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011355	GATGC	2	10	165279	165288	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011355	CAGCG	2	10	165558	165567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011355	CGATG	2	10	169672	169681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011355	CGGCG	2	10	169759	169768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011355	CGGGG	2	10	169848	169857	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011355	TGGCG	2	10	172141	172150	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011355	CTGTG	2	10	177003	177012	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011355	TGTGT	2	10	181121	181130	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011355	CAACC	2	10	184410	184419	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_011355	CGCTG	2	10	185604	185613	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011355	CGGCG	2	10	190511	190520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.