MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	GGCTG	2	10	2810	2819	0 %	20 %	60 %	20 %	209418041
2	NC_011355	CCAGC	2	10	3854	3863	20 %	0 %	20 %	60 %	209418042
3	NC_011355	CCTGG	2	10	5953	5962	0 %	20 %	40 %	40 %	209418043
4	NC_011355	ACCCC	2	10	10122	10131	20 %	0 %	0 %	80 %	209418049
5	NC_011355	GCCGC	2	10	17319	17328	0 %	0 %	40 %	60 %	209418051
6	NC_011355	CGGTG	2	10	18750	18759	0 %	20 %	60 %	20 %	209418051
7	NC_011355	CGGCC	2	10	20367	20376	0 %	0 %	40 %	60 %	209418053
8	NC_011355	CGGCC	2	10	20784	20793	0 %	0 %	40 %	60 %	209418054
9	NC_011355	GGCTG	2	10	22395	22404	0 %	20 %	60 %	20 %	209418056
10	NC_011355	CAAAT	2	10	25169	25178	60 %	20 %	0 %	20 %	209418057
11	NC_011355	CGACA	2	10	25546	25555	40 %	0 %	20 %	40 %	209418057
12	NC_011355	TGCGA	2	10	25643	25652	20 %	20 %	40 %	20 %	209418058
13	NC_011355	CGCAG	2	10	25923	25932	20 %	0 %	40 %	40 %	209418058
14	NC_011355	GCCCG	2	10	27845	27854	0 %	0 %	40 %	60 %	209418060
15	NC_011355	TGGTG	2	10	30169	30178	0 %	40 %	60 %	0 %	209418063
16	NC_011355	CACAC	2	10	30992	31001	40 %	0 %	0 %	60 %	209418064
17	NC_011355	CGCAA	2	10	32363	32372	40 %	0 %	20 %	40 %	209418067
18	NC_011355	GAATG	2	10	32781	32790	40 %	20 %	40 %	0 %	209418068
19	NC_011355	GTGTC	2	10	33005	33014	0 %	40 %	40 %	20 %	209418068
20	NC_011355	TCGCC	2	10	37750	37759	0 %	20 %	20 %	60 %	209418071
21	NC_011355	ACCAA	2	10	42554	42563	60 %	0 %	0 %	40 %	209418075
22	NC_011355	CCACC	2	10	43028	43037	20 %	0 %	0 %	80 %	209418075
23	NC_011355	CAGAT	2	10	46605	46614	40 %	20 %	20 %	20 %	209418077
24	NC_011355	GGGGT	2	10	47198	47207	0 %	20 %	80 %	0 %	209418078
25	NC_011355	TTGGT	2	10	47674	47683	0 %	60 %	40 %	0 %	209418078
26	NC_011355	GCGAG	2	10	51332	51341	20 %	0 %	60 %	20 %	209418080
27	NC_011355	GGCTG	2	10	51721	51730	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
28	NC_011355	CAGGC	2	10	52109	52118	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
29	NC_011355	CCGCG	2	10	52526	52535	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
30	NC_011355	GTGAG	2	10	54436	54445	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
31	NC_011355	GCAAC	2	10	55131	55140	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
32	NC_011355	GGCTG	2	10	57136	57145	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
33	NC_011355	CAGGC	2	10	57524	57533	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
34	NC_011355	CCGCG	2	10	57941	57950	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
35	NC_011355	GTGAG	2	10	59851	59860	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
36	NC_011355	GGCTG	2	10	62551	62560	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
37	NC_011355	CAGGC	2	10	62939	62948	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
38	NC_011355	CCGCG	2	10	63356	63365	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
39	NC_011355	GTGAG	2	10	65266	65275	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
40	NC_011355	GGCTG	2	10	67966	67975	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
41	NC_011355	CAGGC	2	10	68354	68363	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
42	NC_011355	CCGCG	2	10	68771	68780	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
43	NC_011355	GTGAG	2	10	70687	70696	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
44	NC_011355	AGCCA	2	10	75034	75043	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
45	NC_011355	TCGGC	2	10	75318	75327	0 %	20 %	40 %	40 %	209418080
46	NC_011355	CGAGC	2	10	75555	75564	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
47	NC_011355	AGCCA	2	10	79657	79666	40 %	0 %	20 %	40 %	209418080
48	NC_011355	TCGGC	2	10	79941	79950	0 %	20 %	40 %	40 %	209418080
49	NC_011355	CGAGC	2	10	80178	80187	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
50	NC_011355	GGCTG	2	10	82630	82639	0 %	20 %	60 %	20 %	209418080
51	NC_011355	CAGGC	2	10	83018	83027	20 %	0 %	40 %	40 %	209418080
52	NC_011355	CCGCG	2	10	83435	83444	0 %	0 %	40 %	60 %	209418080
53	NC_011355	GTGAG	2	10	85345	85354	20 %	20 %	60 %	0 %	209418080
54	NC_011355	GCCCC	2	10	91255	91264	0 %	0 %	20 %	80 %	209418082
55	NC_011355	GCGGT	2	10	91413	91422	0 %	20 %	60 %	20 %	209418082
56	NC_011355	GGGGT	2	10	92670	92679	0 %	20 %	80 %	0 %	209418083
57	NC_011355	TTGGT	2	10	93146	93155	0 %	60 %	40 %	0 %	209418083
58	NC_011355	CGCTG	2	10	94671	94680	0 %	20 %	40 %	40 %	209418084
59	NC_011355	GCATC	2	10	94950	94959	20 %	20 %	20 %	40 %	209418084
60	NC_011355	GCCGG	2	10	96972	96981	0 %	0 %	60 %	40 %	209418085
61	NC_011355	CGCCA	2	10	97143	97152	20 %	0 %	20 %	60 %	209418085
62	NC_011355	CCTCA	2	10	97350	97359	20 %	20 %	0 %	60 %	209418086
63	NC_011355	GCGAG	2	10	97938	97947	20 %	0 %	60 %	20 %	209418086
64	NC_011355	GGCTG	2	10	98327	98336	0 %	20 %	60 %	20 %	209418086
65	NC_011355	CAGGC	2	10	98715	98724	20 %	0 %	40 %	40 %	209418086
66	NC_011355	CCGCG	2	10	99132	99141	0 %	0 %	40 %	60 %	209418086
67	NC_011355	GTGAG	2	10	101990	101999	20 %	20 %	60 %	0 %	209418086
68	NC_011355	GCAAC	2	10	102685	102694	40 %	0 %	20 %	40 %	209418086
69	NC_011355	GGCTG	2	10	105009	105018	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
70	NC_011355	CAGGC	2	10	105397	105406	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
71	NC_011355	CCGCG	2	10	105814	105823	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
72	NC_011355	GTGAG	2	10	107724	107733	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
73	NC_011355	GCAAC	2	10	108419	108428	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
74	NC_011355	GGCTG	2	10	110421	110430	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
75	NC_011355	CAGGC	2	10	110809	110818	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
76	NC_011355	CCGCG	2	10	111226	111235	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
77	NC_011355	GTGAG	2	10	114102	114111	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
78	NC_011355	GGCTG	2	10	116802	116811	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
79	NC_011355	CAGGC	2	10	117190	117199	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
80	NC_011355	CCGCG	2	10	117607	117616	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
81	NC_011355	GTGAG	2	10	119517	119526	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
82	NC_011355	AGCCA	2	10	123882	123891	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
83	NC_011355	TCGGC	2	10	124166	124175	0 %	20 %	40 %	40 %	209418087
84	NC_011355	CGAGC	2	10	124403	124412	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
85	NC_011355	GGCTG	2	10	126855	126864	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
86	NC_011355	CAGGC	2	10	127243	127252	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
87	NC_011355	CCGCG	2	10	127660	127669	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
88	NC_011355	GTGAG	2	10	130518	130527	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
89	NC_011355	GGCTG	2	10	133197	133206	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
90	NC_011355	CAGGC	2	10	133585	133594	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
91	NC_011355	CCGCG	2	10	134002	134011	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
92	NC_011355	GTGAG	2	10	135918	135927	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
93	NC_011355	GGCTG	2	10	138618	138627	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
94	NC_011355	CAGGC	2	10	139006	139015	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
95	NC_011355	CCGCG	2	10	139423	139432	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
96	NC_011355	GTGAG	2	10	142281	142290	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
97	NC_011355	GGCTG	2	10	144978	144987	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
98	NC_011355	CAGGC	2	10	145366	145375	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
99	NC_011355	CCGCG	2	10	145783	145792	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
100	NC_011355	GTGAG	2	10	147693	147702	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
101	NC_011355	GCAAC	2	10	148388	148397	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
102	NC_011355	GGCTG	2	10	150390	150399	0 %	20 %	60 %	20 %	209418087
103	NC_011355	CAGGC	2	10	150778	150787	20 %	0 %	40 %	40 %	209418087
104	NC_011355	CCGCG	2	10	151195	151204	0 %	0 %	40 %	60 %	209418087
105	NC_011355	GTGAG	2	10	153105	153114	20 %	20 %	60 %	0 %	209418087
106	NC_011355	GCAAC	2	10	153800	153809	40 %	0 %	20 %	40 %	209418087
107	NC_011355	GGTAT	2	10	158681	158690	20 %	40 %	40 %	0 %	209418089
108	NC_011355	GGGGT	2	10	159134	159143	0 %	20 %	80 %	0 %	209418089
109	NC_011355	CTGCA	2	10	166712	166721	20 %	20 %	20 %	40 %	209418092
110	NC_011355	GGCTG	2	10	176236	176245	0 %	20 %	60 %	20 %	209418096
111	NC_011355	AGCCG	2	10	178873	178882	20 %	0 %	40 %	40 %	209418097
112	NC_011355	CGCCA	2	10	178985	178994	20 %	0 %	20 %	60 %	209418097
113	NC_011355	GTCGA	2	10	185049	185058	20 %	20 %	40 %	20 %	209418102
114	NC_011355	GGTTG	2	10	188907	188916	0 %	40 %	60 %	0 %	209418107
115	NC_011355	GCCGG	2	10	189135	189144	0 %	0 %	60 %	40 %	209418107

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.