MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	TAAG	2	8	1636	1643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011355	CGCA	2	8	4764	4771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011355	CAGC	2	8	10406	10413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011355	CAGC	2	8	10446	10453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011355	CATT	2	8	10861	10868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011355	TCCG	2	8	10946	10953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011355	CCGC	2	8	11587	11594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_011355	CTGC	2	8	12935	12942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011355	CACC	2	8	12962	12969	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_011355	AACA	2	8	13513	13520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011355	CAAG	2	8	14673	14680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011355	CTAC	2	8	14840	14847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011355	CGCA	2	8	14912	14919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011355	AAAC	2	8	14964	14971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011355	CTGG	2	8	15587	15594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011355	CAGG	2	8	15759	15766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011355	GCAC	2	8	16041	16048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011355	CGCC	2	8	16184	16191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011355	GCAG	2	8	17153	17160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011355	GCGT	2	8	20854	20861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011355	TGGA	2	8	20904	20911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011355	GCCT	2	8	30257	30264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011355	CAAA	2	8	30288	30295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011355	TGCA	2	8	30564	30571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011355	TTGA	2	8	30572	30579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011355	ACTG	2	8	33167	33174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011355	AACG	2	8	33316	33323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011355	TGTT	2	8	33542	33549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011355	GGGC	2	8	33571	33578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011355	GGCT	2	8	33688	33695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011355	CGCC	2	8	34542	34549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_011355	GGGC	2	8	34854	34861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011355	TTGG	2	8	35105	35112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011355	CGTC	2	8	36971	36978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011355	CAGG	2	8	37339	37346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011355	CCGA	2	8	37433	37440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011355	GCGG	2	8	38278	38285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011355	CCGA	2	8	38432	38439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011355	GCGA	2	8	38750	38757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011355	CAGA	2	8	44593	44600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011355	GGGC	2	8	45024	45031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011355	TTGG	2	8	45275	45282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011355	GAAC	2	8	47011	47018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011355	CCAA	2	8	49657	49664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011355	CGCC	2	8	49907	49914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011355	TCAC	2	8	87885	87892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011355	TTAA	2	8	87914	87921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011355	CACC	2	8	88363	88370	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011355	CCAC	2	8	88408	88415	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_011355	GGGC	2	8	89218	89225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011355	TTGG	2	8	89469	89476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011355	CTGT	2	8	90328	90335	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011355	AGGA	2	8	90985	90992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011355	CGGC	2	8	92114	92121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011355	GCCC	2	8	94327	94334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011355	CGGC	2	8	96197	96204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011355	GCCG	2	8	96244	96251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011355	AAAT	2	8	97329	97336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011355	TTAA	2	8	155658	155665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011355	CACC	2	8	156107	156114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011355	CCAC	2	8	156152	156159	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_011355	CTGT	2	8	156695	156702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011355	CCAA	2	8	157435	157442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011355	CGCC	2	8	157696	157703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_011355	AGTG	2	8	159277	159284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011355	TGAT	2	8	159436	159443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011355	AAGG	2	8	160009	160016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011355	CAGA	2	8	160276	160283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011355	GGGC	2	8	160582	160589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011355	TTGG	2	8	160833	160840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011355	GCTG	2	8	161676	161683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011355	GTAG	2	8	161984	161991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011355	GGTT	2	8	163288	163295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011355	CCAA	2	8	165358	165365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011355	CGCC	2	8	165608	165615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_011355	GCCA	2	8	167965	167972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011355	GCGG	2	8	168055	168062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011355	CCGC	2	8	168207	168214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_011355	CGGC	2	8	168918	168925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011355	GCGG	2	8	168957	168964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011355	TGAT	2	8	169422	169429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011355	GCTC	2	8	169873	169880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011355	GCGG	2	8	170363	170370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011355	CGGC	2	8	170558	170565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011355	ATCC	2	8	170631	170638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011355	GATA	2	8	170983	170990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011355	GGCG	2	8	171557	171564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011355	ACCA	2	8	173239	173246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011355	CTCG	2	8	173859	173866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011355	GCAC	2	8	173986	173993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011355	GCGA	2	8	176922	176929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011355	CGGG	2	8	176973	176980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011355	TCGC	2	8	177519	177526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011355	CTGG	2	8	177654	177661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011355	CGAT	2	8	184044	184051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011355	CCGG	2	8	184486	184493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011355	AGAA	2	8	190169	190176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.