MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	TGCT	2	8	809	816	0 %	50 %	25 %	25 %	209418038
2	NC_011355	AAAC	2	8	913	920	75 %	0 %	0 %	25 %	209418038
3	NC_011355	GCCG	2	8	955	962	0 %	0 %	50 %	50 %	209418038
4	NC_011355	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	209418038
5	NC_011355	GATC	2	8	1174	1181	25 %	25 %	25 %	25 %	209418038
6	NC_011355	TTAC	2	8	1710	1717	25 %	50 %	0 %	25 %	209418040
7	NC_011355	TCAC	2	8	1958	1965	25 %	25 %	0 %	50 %	209418040
8	NC_011355	CTCG	2	8	2076	2083	0 %	25 %	25 %	50 %	209418040
9	NC_011355	TCCT	2	8	2309	2316	0 %	50 %	0 %	50 %	209418041
10	NC_011355	GGCC	2	8	2681	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	209418041
11	NC_011355	TGCG	2	8	2694	2701	0 %	25 %	50 %	25 %	209418041
12	NC_011355	GACG	2	8	3548	3555	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
13	NC_011355	CGGA	2	8	3585	3592	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
14	NC_011355	GTGG	2	8	5320	5327	0 %	25 %	75 %	0 %	209418043
15	NC_011355	GGCC	2	8	5379	5386	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
16	NC_011355	ATGG	2	8	5656	5663	25 %	25 %	50 %	0 %	209418043
17	NC_011355	GCGT	2	8	5730	5737	0 %	25 %	50 %	25 %	209418043
18	NC_011355	CACC	2	8	5982	5989	25 %	0 %	0 %	75 %	209418043
19	NC_011355	CCGG	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
20	NC_011355	GACC	2	8	6481	6488	25 %	0 %	25 %	50 %	209418044
21	NC_011355	AGGC	2	8	6500	6507	25 %	0 %	50 %	25 %	209418044
22	NC_011355	CGCT	2	8	7617	7624	0 %	25 %	25 %	50 %	209418045
23	NC_011355	GCAC	2	8	7703	7710	25 %	0 %	25 %	50 %	209418045
24	NC_011355	GAGC	2	8	7722	7729	25 %	0 %	50 %	25 %	209418045
25	NC_011355	GCAC	2	8	7830	7837	25 %	0 %	25 %	50 %	209418046
26	NC_011355	CCTA	2	8	7970	7977	25 %	25 %	0 %	50 %	209418046
27	NC_011355	CCTC	2	8	8003	8010	0 %	25 %	0 %	75 %	209418046
28	NC_011355	ACCG	2	8	8364	8371	25 %	0 %	25 %	50 %	209418047
29	NC_011355	TTGT	2	8	8391	8398	0 %	75 %	25 %	0 %	209418047
30	NC_011355	ACTT	2	8	8457	8464	25 %	50 %	0 %	25 %	209418047
31	NC_011355	TGGC	2	8	8700	8707	0 %	25 %	50 %	25 %	209418047
32	NC_011355	GCAA	2	8	9260	9267	50 %	0 %	25 %	25 %	209418048
33	NC_011355	GATC	2	8	9718	9725	25 %	25 %	25 %	25 %	209418049
34	NC_011355	CACC	2	8	16646	16653	25 %	0 %	0 %	75 %	209418050
35	NC_011355	ACAA	2	8	17863	17870	75 %	0 %	0 %	25 %	209418051
36	NC_011355	CTGC	2	8	18076	18083	0 %	25 %	25 %	50 %	209418051
37	NC_011355	GGCC	2	8	18369	18376	0 %	0 %	50 %	50 %	209418051
38	NC_011355	TGCG	2	8	19285	19292	0 %	25 %	50 %	25 %	209418052
39	NC_011355	TTGA	2	8	20091	20098	25 %	50 %	25 %	0 %	209418053
40	NC_011355	ACGC	2	8	20153	20160	25 %	0 %	25 %	50 %	209418053
41	NC_011355	CAGT	2	8	20246	20253	25 %	25 %	25 %	25 %	209418053
42	NC_011355	CGCC	2	8	20732	20739	0 %	0 %	25 %	75 %	209418054
43	NC_011355	GGCT	2	8	20751	20758	0 %	25 %	50 %	25 %	209418054
44	NC_011355	GACC	2	8	20804	20811	25 %	0 %	25 %	50 %	209418054
45	NC_011355	AGCA	2	8	21419	21426	50 %	0 %	25 %	25 %	209418055
46	NC_011355	GCCG	2	8	21930	21937	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
47	NC_011355	GCAC	2	8	21955	21962	25 %	0 %	25 %	50 %	209418055
48	NC_011355	GCTG	2	8	22254	22261	0 %	25 %	50 %	25 %	209418055
49	NC_011355	CGAT	2	8	23416	23423	25 %	25 %	25 %	25 %	209418056
50	NC_011355	GGAG	2	8	23477	23484	25 %	0 %	75 %	0 %	209418056
51	NC_011355	GGTC	2	8	24313	24320	0 %	25 %	50 %	25 %	209418057
52	NC_011355	GGTT	2	8	24663	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	209418057
53	NC_011355	CCGG	2	8	24790	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	209418057
54	NC_011355	GCTG	2	8	24894	24901	0 %	25 %	50 %	25 %	209418057
55	NC_011355	AACA	2	8	25161	25168	75 %	0 %	0 %	25 %	209418057
56	NC_011355	ACCG	2	8	25406	25413	25 %	0 %	25 %	50 %	209418057
57	NC_011355	CAAG	2	8	25446	25453	50 %	0 %	25 %	25 %	209418057
58	NC_011355	ATCG	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	209418058
59	NC_011355	TGCG	2	8	26102	26109	0 %	25 %	50 %	25 %	209418058
60	NC_011355	CTGG	2	8	26651	26658	0 %	25 %	50 %	25 %	209418059
61	NC_011355	GACG	2	8	26895	26902	25 %	0 %	50 %	25 %	209418059
62	NC_011355	GCGG	2	8	27343	27350	0 %	0 %	75 %	25 %	209418060
63	NC_011355	GGCG	2	8	27363	27370	0 %	0 %	75 %	25 %	209418060
64	NC_011355	TCGG	2	8	27473	27480	0 %	25 %	50 %	25 %	209418060
65	NC_011355	CGGC	2	8	27561	27568	0 %	0 %	50 %	50 %	209418060
66	NC_011355	CAGC	2	8	27720	27727	25 %	0 %	25 %	50 %	209418060
67	NC_011355	CCAA	2	8	28315	28322	50 %	0 %	0 %	50 %	209418061
68	NC_011355	GCTG	2	8	29442	29449	0 %	25 %	50 %	25 %	209418063
69	NC_011355	CGGT	2	8	29494	29501	0 %	25 %	50 %	25 %	209418063
70	NC_011355	CAGC	2	8	29891	29898	25 %	0 %	25 %	50 %	209418063
71	NC_011355	GCGG	2	8	30193	30200	0 %	0 %	75 %	25 %	209418063
72	NC_011355	GTCG	2	8	30637	30644	0 %	25 %	50 %	25 %	209418064
73	NC_011355	ACCC	2	8	30697	30704	25 %	0 %	0 %	75 %	209418064
74	NC_011355	GCAC	2	8	31328	31335	25 %	0 %	25 %	50 %	209418064
75	NC_011355	CGCA	2	8	31525	31532	25 %	0 %	25 %	50 %	209418064
76	NC_011355	CCGA	2	8	31665	31672	25 %	0 %	25 %	50 %	209418065
77	NC_011355	CGCT	2	8	32081	32088	0 %	25 %	25 %	50 %	209418066
78	NC_011355	GCAC	2	8	32167	32174	25 %	0 %	25 %	50 %	209418066
79	NC_011355	GAGC	2	8	32186	32193	25 %	0 %	50 %	25 %	209418066
80	NC_011355	ATCT	2	8	32295	32302	25 %	50 %	0 %	25 %	209418067
81	NC_011355	GGGT	2	8	32547	32554	0 %	25 %	75 %	0 %	209418067
82	NC_011355	CTTG	2	8	32611	32618	0 %	50 %	25 %	25 %	209418067
83	NC_011355	CCCG	2	8	37721	37728	0 %	0 %	25 %	75 %	209418071
84	NC_011355	GTTG	2	8	37789	37796	0 %	50 %	50 %	0 %	209418071
85	NC_011355	GGGT	2	8	39752	39759	0 %	25 %	75 %	0 %	209418073
86	NC_011355	CGTT	2	8	40699	40706	0 %	50 %	25 %	25 %	209418074
87	NC_011355	GCAC	2	8	41599	41606	25 %	0 %	25 %	50 %	209418075
88	NC_011355	CACC	2	8	42297	42304	25 %	0 %	0 %	75 %	209418075
89	NC_011355	TGCG	2	8	43552	43559	0 %	25 %	50 %	25 %	209418076
90	NC_011355	GGCA	2	8	43591	43598	25 %	0 %	50 %	25 %	209418076
91	NC_011355	ACCG	2	8	43760	43767	25 %	0 %	25 %	50 %	209418076
92	NC_011355	CCCG	2	8	43797	43804	0 %	0 %	25 %	75 %	209418076
93	NC_011355	CCGG	2	8	43876	43883	0 %	0 %	50 %	50 %	209418076
94	NC_011355	CTGG	2	8	43972	43979	0 %	25 %	50 %	25 %	209418076
95	NC_011355	AAGG	2	8	44326	44333	50 %	0 %	50 %	0 %	209418076
96	NC_011355	AGGT	2	8	46371	46378	25 %	25 %	50 %	0 %	209418077
97	NC_011355	GCCC	2	8	46499	46506	0 %	0 %	25 %	75 %	209418077
98	NC_011355	ACCG	2	8	46738	46745	25 %	0 %	25 %	50 %	209418077
99	NC_011355	GCGT	2	8	48629	48636	0 %	25 %	50 %	25 %	209418078
100	NC_011355	GCAG	2	8	48757	48764	25 %	0 %	50 %	25 %	209418078
101	NC_011355	TCAG	2	8	50514	50521	25 %	25 %	25 %	25 %	209418079
102	NC_011355	CTCA	2	8	50787	50794	25 %	25 %	0 %	50 %	209418079
103	NC_011355	AGCT	2	8	51157	51164	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
104	NC_011355	TGAA	2	8	51313	51320	50 %	25 %	25 %	0 %	209418080
105	NC_011355	ATCG	2	8	51514	51521	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
106	NC_011355	GGTG	2	8	51601	51608	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
107	NC_011355	GTGA	2	8	52945	52952	25 %	25 %	50 %	0 %	209418080
108	NC_011355	GTGG	2	8	53407	53414	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
109	NC_011355	CCGG	2	8	54106	54113	0 %	0 %	50 %	50 %	209418080
110	NC_011355	GGGC	2	8	54260	54267	0 %	0 %	75 %	25 %	209418080
111	NC_011355	GGCG	2	8	54558	54565	0 %	0 %	75 %	25 %	209418080
112	NC_011355	GGGT	2	8	54597	54604	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
113	NC_011355	TGAC	2	8	54680	54687	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
114	NC_011355	ATCG	2	8	55456	55463	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
115	NC_011355	GTGA	2	8	58360	58367	25 %	25 %	50 %	0 %	209418080
116	NC_011355	GTGG	2	8	58822	58829	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
117	NC_011355	CCGG	2	8	59521	59528	0 %	0 %	50 %	50 %	209418080
118	NC_011355	GGGC	2	8	59675	59682	0 %	0 %	75 %	25 %	209418080
119	NC_011355	GGTC	2	8	60309	60316	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
120	NC_011355	ATCG	2	8	60871	60878	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
121	NC_011355	GTGA	2	8	63775	63782	25 %	25 %	50 %	0 %	209418080
122	NC_011355	GTGG	2	8	64237	64244	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
123	NC_011355	CCGG	2	8	64936	64943	0 %	0 %	50 %	50 %	209418080
124	NC_011355	GGGC	2	8	65090	65097	0 %	0 %	75 %	25 %	209418080
125	NC_011355	GGTC	2	8	65724	65731	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
126	NC_011355	ATCG	2	8	66286	66293	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
127	NC_011355	GTGA	2	8	69190	69197	25 %	25 %	50 %	0 %	209418080
128	NC_011355	GTCG	2	8	69454	69461	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
129	NC_011355	GTGG	2	8	69658	69665	0 %	25 %	75 %	0 %	209418080
130	NC_011355	CCGG	2	8	70357	70364	0 %	0 %	50 %	50 %	209418080
131	NC_011355	GGGC	2	8	70511	70518	0 %	0 %	75 %	25 %	209418080
132	NC_011355	GGTC	2	8	71145	71152	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
133	NC_011355	ATCG	2	8	71707	71714	25 %	25 %	25 %	25 %	209418080
134	NC_011355	GGTC	2	8	73311	73318	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
135	NC_011355	TTGC	2	8	73650	73657	0 %	50 %	25 %	25 %	209418080
136	NC_011355	GCGA	2	8	73826	73833	25 %	0 %	50 %	25 %	209418080
137	NC_011355	TTGC	2	8	74622	74629	0 %	50 %	25 %	25 %	209418080
138	NC_011355	GCTG	2	8	75364	75371	0 %	25 %	50 %	25 %	209418080
139	NC_011355	ATGA	2	8	75594	75601	50 %	25 %	25 %	0 %	209418080
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.