MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 3646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011353	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	209398223
2	NC_011353	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	209395861
3	NC_011353	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	209399547
4	NC_011353	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	209398876
5	NC_011353	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	209396480
6	NC_011353	TCTTT	2	10	11885	11894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011353	CCGAT	2	10	16509	16518	20 %	20 %	20 %	40 %	209397822
8	NC_011353	AGCGA	2	10	16897	16906	40 %	0 %	40 %	20 %	209397822
9	NC_011353	GTTTT	2	10	19315	19324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011353	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011353	AATGT	2	10	21847	21856	40 %	40 %	20 %	0 %	209397389
12	NC_011353	TGCAA	2	10	22060	22069	40 %	20 %	20 %	20 %	209397389
13	NC_011353	ATAAA	2	10	22131	22140	80 %	20 %	0 %	0 %	209397389
14	NC_011353	TAAAA	2	10	22404	22413	80 %	20 %	0 %	0 %	209397389
15	NC_011353	ATTGC	2	10	24146	24155	20 %	40 %	20 %	20 %	209398029
16	NC_011353	TTAAT	2	10	24781	24790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011353	ATTTA	2	10	33605	33614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011353	GCGAA	2	10	36843	36852	40 %	0 %	40 %	20 %	209396701
19	NC_011353	CCGTT	2	10	37737	37746	0 %	40 %	20 %	40 %	209396701
20	NC_011353	CACGG	2	10	38114	38123	20 %	0 %	40 %	40 %	209396701
21	NC_011353	GATGC	2	10	39105	39114	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011353	CGAAT	2	10	40856	40865	40 %	20 %	20 %	20 %	209400477
23	NC_011353	CCATG	2	10	42394	42403	20 %	20 %	20 %	40 %	209397439
24	NC_011353	CCGTA	2	10	44040	44049	20 %	20 %	20 %	40 %	209399530
25	NC_011353	GTACA	2	10	44530	44539	40 %	20 %	20 %	20 %	209399530
26	NC_011353	TTAAA	2	10	44778	44787	60 %	40 %	0 %	0 %	209399530
27	NC_011353	ACCCA	2	10	45521	45530	40 %	0 %	0 %	60 %	209399200
28	NC_011353	TGTTA	2	10	46552	46561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011353	TTTGA	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	209398664
30	NC_011353	CGGCG	2	10	47399	47408	0 %	0 %	60 %	40 %	209398664
31	NC_011353	AATCA	2	10	47681	47690	60 %	20 %	0 %	20 %	209400372
32	NC_011353	CGGTT	2	10	48636	48645	0 %	40 %	40 %	20 %	209399776
33	NC_011353	TGGCG	2	10	50327	50336	0 %	20 %	60 %	20 %	209398741
34	NC_011353	TGCAC	2	10	52089	52098	20 %	20 %	20 %	40 %	209400858
35	NC_011353	AGGGC	2	10	53174	53183	20 %	0 %	60 %	20 %	209399091
36	NC_011353	GGCGC	2	10	53208	53217	0 %	0 %	60 %	40 %	209399091
37	NC_011353	GAAAC	2	10	54021	54030	60 %	0 %	20 %	20 %	209399091
38	NC_011353	AACGT	2	10	56494	56503	40 %	20 %	20 %	20 %	209398324
39	NC_011353	GCGTC	2	10	59478	59487	0 %	20 %	40 %	40 %	209398433
40	NC_011353	ATGTT	2	10	60292	60301	20 %	60 %	20 %	0 %	209398538
41	NC_011353	CTTCG	2	10	60725	60734	0 %	40 %	20 %	40 %	209398538
42	NC_011353	TGCGT	2	10	61011	61020	0 %	40 %	40 %	20 %	209398538
43	NC_011353	AAAGT	2	10	68078	68087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011353	GTGCT	2	10	69341	69350	0 %	40 %	40 %	20 %	209398156
45	NC_011353	GGTGA	2	10	70325	70334	20 %	20 %	60 %	0 %	209398156
46	NC_011353	CAGCG	2	10	71693	71702	20 %	0 %	40 %	40 %	209396986
47	NC_011353	GGATC	2	10	74188	74197	20 %	20 %	40 %	20 %	209400593
48	NC_011353	TAGTG	2	10	80414	80423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011353	GTAAC	2	10	80555	80564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011353	GGCAA	2	10	80840	80849	40 %	0 %	40 %	20 %	209398238
51	NC_011353	TTGCT	2	10	81575	81584	0 %	60 %	20 %	20 %	209397844
52	NC_011353	GATGG	2	10	82311	82320	20 %	20 %	60 %	0 %	209397844
53	NC_011353	ATTTT	2	10	83139	83148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011353	GGGAG	2	10	83303	83312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011353	CGCCA	2	10	83367	83376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_011353	GCTTC	2	10	83456	83465	0 %	40 %	20 %	40 %	209397741
57	NC_011353	CCTGG	2	10	84564	84573	0 %	20 %	40 %	40 %	209397303
58	NC_011353	GACCG	2	10	86831	86840	20 %	0 %	40 %	40 %	209398496
59	NC_011353	ATGTT	2	10	89378	89387	20 %	60 %	20 %	0 %	209396725
60	NC_011353	TGCAT	2	10	90320	90329	20 %	40 %	20 %	20 %	209398207
61	NC_011353	ATTCC	2	10	90490	90499	20 %	40 %	0 %	40 %	209398207
62	NC_011353	TTACG	2	10	91382	91391	20 %	40 %	20 %	20 %	209398207
63	NC_011353	AGTTC	2	10	95583	95592	20 %	40 %	20 %	20 %	209400403
64	NC_011353	CGTGG	2	10	96956	96965	0 %	20 %	60 %	20 %	209397671
65	NC_011353	GGGCT	2	10	101335	101344	0 %	20 %	60 %	20 %	209398077
66	NC_011353	GCCTG	2	10	101795	101804	0 %	20 %	40 %	40 %	209398858
67	NC_011353	ACCGT	2	10	103708	103717	20 %	20 %	20 %	40 %	209398089
68	NC_011353	ATCAG	2	10	105481	105490	40 %	20 %	20 %	20 %	209400617
69	NC_011353	TGACG	2	10	106953	106962	20 %	20 %	40 %	20 %	209399854
70	NC_011353	AGCCG	2	10	107249	107258	20 %	0 %	40 %	40 %	209399854
71	NC_011353	GCGCA	2	10	109577	109586	20 %	0 %	40 %	40 %	209396843
72	NC_011353	TGGCG	2	10	110571	110580	0 %	20 %	60 %	20 %	209396274
73	NC_011353	CCGGC	2	10	113541	113550	0 %	0 %	40 %	60 %	209399217
74	NC_011353	CGCGG	2	10	116750	116759	0 %	0 %	60 %	40 %	209399348
75	NC_011353	ATCCC	2	10	118994	119003	20 %	20 %	0 %	60 %	209397106
76	NC_011353	CATCG	2	10	119007	119016	20 %	20 %	20 %	40 %	209397106
77	NC_011353	TAACG	2	10	119701	119710	40 %	20 %	20 %	20 %	209397106
78	NC_011353	ATGCC	2	10	120160	120169	20 %	20 %	20 %	40 %	209397106
79	NC_011353	AATGC	2	10	121443	121452	40 %	20 %	20 %	20 %	209396061
80	NC_011353	TCTGT	2	10	122389	122398	0 %	60 %	20 %	20 %	209398277
81	NC_011353	GCATG	2	10	123482	123491	20 %	20 %	40 %	20 %	209396354
82	NC_011353	AGCAG	2	10	124820	124829	40 %	0 %	40 %	20 %	209397094
83	NC_011353	CGAAG	2	10	126735	126744	40 %	0 %	40 %	20 %	209400019
84	NC_011353	ACACG	2	10	126868	126877	40 %	0 %	20 %	40 %	209400019
85	NC_011353	TCGCG	2	10	127129	127138	0 %	20 %	40 %	40 %	209400019
86	NC_011353	GCATC	2	10	127219	127228	20 %	20 %	20 %	40 %	209400019
87	NC_011353	GACTG	2	10	128537	128546	20 %	20 %	40 %	20 %	209398489
88	NC_011353	AGAGC	2	10	128947	128956	40 %	0 %	40 %	20 %	209398489
89	NC_011353	AGGCG	2	10	134102	134111	20 %	0 %	60 %	20 %	209398273
90	NC_011353	GGTTG	2	10	134855	134864	0 %	40 %	60 %	0 %	209398273
91	NC_011353	TCTGG	2	10	137501	137510	0 %	40 %	40 %	20 %	209396098
92	NC_011353	GGGCA	2	10	138913	138922	20 %	0 %	60 %	20 %	209396818
93	NC_011353	CAGCG	2	10	139192	139201	20 %	0 %	40 %	40 %	209397177
94	NC_011353	ACGAC	2	10	140472	140481	40 %	0 %	20 %	40 %	209395821
95	NC_011353	CCGTC	2	10	146177	146186	0 %	20 %	20 %	60 %	209400257
96	NC_011353	GTGAA	2	10	146187	146196	40 %	20 %	40 %	0 %	209400257
97	NC_011353	GGCAT	2	10	146349	146358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011353	GTTCA	2	10	146574	146583	20 %	40 %	20 %	20 %	209399514
99	NC_011353	ATCCA	2	10	146900	146909	40 %	20 %	0 %	40 %	209399514
100	NC_011353	GTAAG	2	10	147113	147122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011353	CTTTA	2	10	148163	148172	20 %	60 %	0 %	20 %	209396497
102	NC_011353	TGGCG	2	10	148390	148399	0 %	20 %	60 %	20 %	209396497
103	NC_011353	TCCTC	2	10	148833	148842	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_011353	TTTCA	2	10	150703	150712	20 %	60 %	0 %	20 %	209396925
105	NC_011353	CCGCA	2	10	153439	153448	20 %	0 %	20 %	60 %	209399403
106	NC_011353	CCTTT	2	10	155404	155413	0 %	60 %	0 %	40 %	209396930
107	NC_011353	TTTAA	2	10	156964	156973	40 %	60 %	0 %	0 %	209400978
108	NC_011353	TGGTT	2	10	157326	157335	0 %	60 %	40 %	0 %	209396258
109	NC_011353	TAAGA	2	10	161527	161536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011353	AAATA	2	10	161537	161546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011353	GCGAG	2	10	162726	162735	20 %	0 %	60 %	20 %	209398537
112	NC_011353	GGCGT	2	10	163164	163173	0 %	20 %	60 %	20 %	209398537
113	NC_011353	ACCAC	2	10	166067	166076	40 %	0 %	0 %	60 %	209400335
114	NC_011353	GGCGT	2	10	167770	167779	0 %	20 %	60 %	20 %	209396555
115	NC_011353	CGACG	2	10	168809	168818	20 %	0 %	40 %	40 %	209396555
116	NC_011353	CTGCG	2	10	170945	170954	0 %	20 %	40 %	40 %	209400125
117	NC_011353	TTATC	2	10	171721	171730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011353	AAAAC	2	10	172796	172805	80 %	0 %	0 %	20 %	209398761
119	NC_011353	TGGTT	2	10	173053	173062	0 %	60 %	40 %	0 %	209398761
120	NC_011353	AACCT	2	10	175134	175143	40 %	20 %	0 %	40 %	209400721
121	NC_011353	TGGTC	2	10	175176	175185	0 %	40 %	40 %	20 %	209400721
122	NC_011353	TGGCG	2	10	176421	176430	0 %	20 %	60 %	20 %	209396292
123	NC_011353	GGTCC	2	10	181985	181994	0 %	20 %	40 %	40 %	209397803
124	NC_011353	ACGGG	2	10	183902	183911	20 %	0 %	60 %	20 %	209396609
125	NC_011353	GTGAT	2	10	186061	186070	20 %	40 %	40 %	0 %	209395925
126	NC_011353	GTGAT	2	10	186352	186361	20 %	40 %	40 %	0 %	209395925
127	NC_011353	TACGT	2	10	186597	186606	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011353	TGGCC	2	10	188322	188331	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011353	GCCAG	2	10	190071	190080	20 %	0 %	40 %	40 %	209399551
130	NC_011353	GTTCT	2	10	191512	191521	0 %	60 %	20 %	20 %	209399551
131	NC_011353	CTGAA	2	10	193504	193513	40 %	20 %	20 %	20 %	209399355
132	NC_011353	AAGCG	2	10	193568	193577	40 %	0 %	40 %	20 %	209399355
133	NC_011353	TGGTG	2	10	195474	195483	0 %	40 %	60 %	0 %	209397446
134	NC_011353	TGCAC	2	10	195600	195609	20 %	20 %	20 %	40 %	209397446
135	NC_011353	TGCGC	2	10	195993	196002	0 %	20 %	40 %	40 %	209397446
136	NC_011353	GTCTG	2	10	196158	196167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011353	CATGG	2	10	197694	197703	20 %	20 %	40 %	20 %	209395740
138	NC_011353	CAGAT	2	10	198733	198742	40 %	20 %	20 %	20 %	209396854
139	NC_011353	ACTTT	2	10	198866	198875	20 %	60 %	0 %	20 %	209396854
140	NC_011353	GACGT	2	10	202786	202795	20 %	20 %	40 %	20 %	209400867
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143	NC_011353	ATGCC	2	10	207180	207189	20 %	20 %	20 %	40 %	209399982
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145	NC_011353	ACCGC	2	10	208519	208528	20 %	0 %	20 %	60 %	209398477
146	NC_011353	GTAAC	2	10	209249	209258	40 %	20 %	20 %	20 %	209398477
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148	NC_011353	GGTGG	2	10	209986	209995	0 %	20 %	80 %	0 %	209398477
149	NC_011353	TTAGT	2	10	216947	216956	20 %	60 %	20 %	0 %	209399704
150	NC_011353	ACGGT	2	10	221030	221039	20 %	20 %	40 %	20 %	209398549
151	NC_011353	TGATT	2	10	223871	223880	20 %	60 %	20 %	0 %	209400462
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153	NC_011353	CGGTT	2	10	226834	226843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_011353	GTGAA	2	10	235703	235712	40 %	20 %	40 %	0 %	209398090
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156	NC_011353	ACTGG	2	10	238825	238834	20 %	20 %	40 %	20 %	209400502
157	NC_011353	CGCGG	2	10	239870	239879	0 %	0 %	60 %	40 %	209400894
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160	NC_011353	ATCGC	2	10	248020	248029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_011353	GGTCA	2	10	255103	255112	20 %	20 %	40 %	20 %	209398751
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174	NC_011353	CGGGG	2	10	267489	267498	0 %	0 %	80 %	20 %	209400273
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190	NC_011353	TGCAT	2	10	288341	288350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_011353	TCAAC	2	10	288805	288814	40 %	20 %	0 %	40 %	209397087
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196	NC_011353	GATGC	2	10	297584	297593	20 %	20 %	40 %	20 %	209400884
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201	NC_011353	TTCGT	2	10	303725	303734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
202	NC_011353	GGGCT	2	10	305753	305762	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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236	NC_011353	TGTTA	2	10	349076	349085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_011353	TTGAT	2	10	352414	352423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
238	NC_011353	TCAAT	2	10	352734	352743	40 %	40 %	0 %	20 %	209400765
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243	NC_011353	GTTAA	2	10	354889	354898	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_011353	TACCG	2	10	362440	362449	20 %	20 %	20 %	40 %	209400009
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249	NC_011353	CAAAA	2	10	366725	366734	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_011353	ATTAG	2	10	366758	366767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_011353	ATGTT	2	10	370518	370527	20 %	60 %	20 %	0 %	209400756
252	NC_011353	AATGC	2	10	370668	370677	40 %	20 %	20 %	20 %	209400756
253	NC_011353	TTCCC	2	10	371228	371237	0 %	40 %	0 %	60 %	209396270
254	NC_011353	GACAA	2	10	371332	371341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
255	NC_011353	ATAAA	2	10	371908	371917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_011353	AAAAT	2	10	371970	371979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_011353	GACAA	2	10	374945	374954	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
258	NC_011353	ATTGA	2	10	375400	375409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_011353	TTTAT	2	10	376369	376378	20 %	80 %	0 %	0 %	209397028
260	NC_011353	AGCGA	2	10	376688	376697	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_011353	GCAGG	2	10	377837	377846	20 %	0 %	60 %	20 %	209399344
262	NC_011353	ACCGC	2	10	382546	382555	20 %	0 %	20 %	60 %	209395783
263	NC_011353	TGTCA	2	10	383129	383138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_011353	ATTTT	2	10	383193	383202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_011353	TCTGA	2	10	387593	387602	20 %	40 %	20 %	20 %	209399058
266	NC_011353	TTATT	2	10	391861	391870	20 %	80 %	0 %	0 %	209397182
267	NC_011353	ATGGC	2	10	392107	392116	20 %	20 %	40 %	20 %	209397182
268	NC_011353	GGGCA	2	10	393819	393828	20 %	0 %	60 %	20 %	209399124
269	NC_011353	TCGCC	2	10	396128	396137	0 %	20 %	20 %	60 %	209395980
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282	NC_011353	GGCTG	2	10	418035	418044	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_011353	GGTGG	2	10	420658	420667	0 %	20 %	80 %	0 %	209396585
284	NC_011353	AAGCG	2	10	421594	421603	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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310	NC_011353	ATGGA	2	10	449605	449614	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_011353	CGACC	2	10	539251	539260	20 %	0 %	20 %	60 %	209397378
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366	NC_011353	TGAGT	2	10	544850	544859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
367	NC_011353	CAACA	2	10	545143	545152	60 %	0 %	0 %	40 %	209398328
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371	NC_011353	CCGCA	2	10	551148	551157	20 %	0 %	20 %	60 %	209396368
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380	NC_011353	CCAGC	2	10	572280	572289	20 %	0 %	20 %	60 %	209397749
381	NC_011353	TCAGG	2	10	574271	574280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
382	NC_011353	GGCGT	2	10	574308	574317	0 %	20 %	60 %	20 %	209397585
383	NC_011353	GAAGC	2	10	574872	574881	40 %	0 %	40 %	20 %	209397585
384	NC_011353	AGGTG	2	10	575921	575930	20 %	20 %	60 %	0 %	209397585
385	NC_011353	ATCGG	2	10	576190	576199	20 %	20 %	40 %	20 %	209399446
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387	NC_011353	ACCAG	2	10	584373	584382	40 %	0 %	20 %	40 %	209398272
388	NC_011353	CGTTA	2	10	587068	587077	20 %	40 %	20 %	20 %	209395885
389	NC_011353	AGGCC	2	10	587755	587764	20 %	0 %	40 %	40 %	209395885
390	NC_011353	GCCTG	2	10	588350	588359	0 %	20 %	40 %	40 %	209395885
391	NC_011353	GCGCA	2	10	591537	591546	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
392	NC_011353	GCCTG	2	10	591745	591754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
393	NC_011353	GGTCA	2	10	593021	593030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_011353	GCCTG	2	10	595241	595250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
395	NC_011353	GTGCT	2	10	596940	596949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
396	NC_011353	GCCTG	2	10	597038	597047	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
397	NC_011353	GATCT	2	10	598092	598101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
398	NC_011353	GCCTG	2	10	598630	598639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
399	NC_011353	GCGCC	2	10	599223	599232	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
400	NC_011353	CGCAA	2	10	601624	601633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
401	NC_011353	GGGGC	2	10	602084	602093	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
402	NC_011353	TACGG	2	10	603160	603169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_011353	GGGCG	2	10	603408	603417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
404	NC_011353	GCGGG	2	10	603593	603602	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
405	NC_011353	GTTCA	2	10	605383	605392	20 %	40 %	20 %	20 %	209400615
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424	NC_011353	GTCTG	2	10	635059	635068	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_011353	TGCTA	2	10	741142	741151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
500	NC_011353	ATTTG	2	10	742583	742592	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

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