MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011353	TCTTT	2	10	11885	11894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011353	GTTTT	2	10	19315	19324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011353	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011353	TTAAT	2	10	24781	24790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011353	ATTTA	2	10	33605	33614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011353	GATGC	2	10	39105	39114	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011353	TGTTA	2	10	46552	46561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011353	AAAGT	2	10	68078	68087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011353	TAGTG	2	10	80414	80423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011353	GTAAC	2	10	80555	80564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011353	ATTTT	2	10	83139	83148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011353	GGGAG	2	10	83303	83312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011353	CGCCA	2	10	83367	83376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_011353	GGCAT	2	10	146349	146358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011353	GTAAG	2	10	147113	147122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011353	TCCTC	2	10	148833	148842	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011353	TAAGA	2	10	161527	161536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011353	AAATA	2	10	161537	161546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011353	TTATC	2	10	171721	171730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011353	TACGT	2	10	186597	186606	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011353	TGGCC	2	10	188322	188331	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011353	GTCTG	2	10	196158	196167	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011353	CGGTT	2	10	226834	226843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011353	GCGCG	2	10	245583	245592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011353	CCAGA	2	10	245652	245661	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011353	ATCGC	2	10	248020	248029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011353	AAAAT	2	10	263513	263522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011353	CTAAT	2	10	263728	263737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011353	TTTGT	2	10	263755	263764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011353	CCTCA	2	10	275061	275070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_011353	CCTTT	2	10	288123	288132	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011353	TGCAT	2	10	288341	288350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011353	AATGG	2	10	293914	293923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011353	TTCGT	2	10	303725	303734	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011353	GGGCT	2	10	305753	305762	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011353	ATCCC	2	10	316155	316164	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_011353	ATTTT	2	10	316984	316993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011353	AATTT	2	10	317546	317555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011353	TTTCG	2	10	319191	319200	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011353	TCGCT	2	10	319351	319360	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011353	TGGCA	2	10	321367	321376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011353	TGCAA	2	10	321748	321757	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011353	ATCAA	2	10	326990	326999	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011353	TGTGT	2	10	347967	347976	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011353	TGTTA	2	10	349076	349085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011353	TTGAT	2	10	352414	352423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011353	GTTAA	2	10	354889	354898	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011353	CAAAA	2	10	366725	366734	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011353	ATTAG	2	10	366758	366767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011353	GACAA	2	10	371332	371341	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011353	ATAAA	2	10	371908	371917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011353	AAAAT	2	10	371970	371979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011353	GACAA	2	10	374945	374954	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011353	ATTGA	2	10	375400	375409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011353	AGCGA	2	10	376688	376697	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011353	TGTCA	2	10	383129	383138	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011353	ATTTT	2	10	383193	383202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011353	GGCTG	2	10	418035	418044	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011353	AAGCG	2	10	421594	421603	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011353	TTGCG	2	10	426792	426801	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011353	TAGCG	2	10	429703	429712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011353	CGGCG	2	10	449572	449581	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011353	ATGGA	2	10	449605	449614	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011353	CTTCT	2	10	462720	462729	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011353	AACAA	2	10	474553	474562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011353	GTTTC	2	10	499968	499977	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011353	CTTTT	2	10	503444	503453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011353	GGAGT	2	10	507939	507948	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011353	TCGAT	2	10	526910	526919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011353	GAAGA	2	10	531079	531088	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011353	TCAGG	2	10	538501	538510	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011353	TGAGT	2	10	544850	544859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011353	CAGGT	2	10	546139	546148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011353	TCAGG	2	10	574271	574280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011353	GCGCA	2	10	591537	591546	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011353	GCCTG	2	10	591745	591754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_011353	GGTCA	2	10	593021	593030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011353	GCCTG	2	10	595241	595250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011353	GTGCT	2	10	596940	596949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011353	GCCTG	2	10	597038	597047	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011353	GATCT	2	10	598092	598101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011353	GCCTG	2	10	598630	598639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_011353	GCGCC	2	10	599223	599232	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_011353	CGCAA	2	10	601624	601633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011353	GGGGC	2	10	602084	602093	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011353	TACGG	2	10	603160	603169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011353	GGGCG	2	10	603408	603417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011353	GCGGG	2	10	603593	603602	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011353	ATTTT	2	10	620265	620274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011353	TATTT	2	10	633427	633436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011353	GTCTG	2	10	635059	635068	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_011353	AAGCG	2	10	638941	638950	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011353	GTTTC	2	10	653536	653545	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011353	GTCAG	2	10	694304	694313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011353	GTTAA	2	10	714521	714530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011353	TGCTA	2	10	741142	741151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011353	ATTTG	2	10	742583	742592	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011353	TCAAT	2	10	744888	744897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011353	GGAAC	2	10	746078	746087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011353	CGTAA	2	10	747286	747295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011353	GCATA	2	10	759482	759491	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011353	AGCAA	2	10	759589	759598	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011353	CGTTG	2	10	765371	765380	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011353	CAGGG	2	10	786092	786101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011353	TCGCG	2	10	791508	791517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011353	AATGT	2	10	816169	816178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011353	GAAAA	2	10	816277	816286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011353	TTAAT	2	10	817145	817154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011353	GGTTG	2	10	826386	826395	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011353	TACGC	2	10	826479	826488	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011353	ATAAC	2	10	858615	858624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011353	GTCGT	2	10	868211	868220	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011353	AAGCG	2	10	868877	868886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011353	GATGC	2	10	893042	893051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011353	AAAAT	2	10	894545	894554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011353	GTTGG	2	10	896157	896166	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011353	AATTC	2	10	901243	901252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011353	ATTTT	2	10	902414	902423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011353	TGATT	2	10	904793	904802	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011353	TAACT	2	10	906610	906619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011353	GGTGG	2	10	906957	906966	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011353	AACGA	2	10	911425	911434	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011353	GGGGA	2	10	932337	932346	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011353	GTTGG	2	10	932493	932502	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011353	ACATA	2	10	964132	964141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011353	GATGC	2	10	969407	969416	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011353	CAAAA	2	10	976005	976014	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011353	TATAT	2	10	980738	980747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011353	TGATG	2	10	986746	986755	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011353	CGGCG	2	10	989946	989955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011353	CGGTG	2	10	994546	994555	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011353	CATGG	2	10	994664	994673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011353	CAGGG	2	10	1006718	1006727	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011353	AGTAA	2	10	1018578	1018587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011353	CAAAT	2	10	1028407	1028416	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011353	GCTGT	2	10	1083241	1083250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011353	GCAAC	2	10	1090629	1090638	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_011353	TTCAC	2	10	1104598	1104607	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011353	TTGTT	2	10	1130366	1130375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011353	AATCG	2	10	1134269	1134278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011353	AACGT	2	10	1134300	1134309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011353	CGAAT	2	10	1134846	1134855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011353	ACGTC	2	10	1135501	1135510	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011353	AGCGA	2	10	1138724	1138733	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011353	TAGGG	2	10	1138760	1138769	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011353	ATGAC	2	10	1140464	1140473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_011353	TTATT	2	10	1149312	1149321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011353	GTTCT	2	10	1191603	1191612	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_011353	TCGCT	2	10	2016692	2016701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_011353	ATCGA	2	10	2023628	2023637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_011353	CCCTT	2	10	2032274	2032283	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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500	NC_011353	AGGAT	2	10	3850228	3850237	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

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