MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 67676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011353	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209397020
2	NC_011353	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
3	NC_011353	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
4	NC_011353	CAC	3	9	225	233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209397020
5	NC_011353	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209397020
6	NC_011353	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
7	NC_011353	TGG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
8	NC_011353	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
9	NC_011353	CGC	3	9	587	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
10	NC_011353	TCG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
11	NC_011353	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
12	NC_011353	CCG	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
13	NC_011353	CCG	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398223
14	NC_011353	TGG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
15	NC_011353	ACT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
16	NC_011353	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
17	NC_011353	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
18	NC_011353	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
19	NC_011353	TTC	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209398223
20	NC_011353	TGA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
21	NC_011353	AAT	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209398223
22	NC_011353	GGC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398223
23	NC_011353	TGC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
24	NC_011353	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
25	NC_011353	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
26	NC_011353	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
27	NC_011353	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398223
28	NC_011353	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209398223
29	NC_011353	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
30	NC_011353	TCA	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
31	NC_011353	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
32	NC_011353	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
33	NC_011353	GAA	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398223
34	NC_011353	ATC	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
35	NC_011353	TTG	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398223
36	NC_011353	TCG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
37	NC_011353	TAC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398223
38	NC_011353	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
39	NC_011353	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
40	NC_011353	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
41	NC_011353	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
42	NC_011353	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398223
43	NC_011353	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
44	NC_011353	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398223
45	NC_011353	TAT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209398223
46	NC_011353	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398223
47	NC_011353	GCG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395861
48	NC_011353	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395861
49	NC_011353	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395861
50	NC_011353	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395861
51	NC_011353	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395861
52	NC_011353	TGA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
53	NC_011353	GAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395861
54	NC_011353	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395861
55	NC_011353	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
56	NC_011353	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395861
57	NC_011353	TGA	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395861
58	NC_011353	CGG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395861
59	NC_011353	TGA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
60	NC_011353	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
61	NC_011353	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
62	NC_011353	GGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
63	NC_011353	TGA	3	9	4341	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
64	NC_011353	CTA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209396634
65	NC_011353	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209396634
66	NC_011353	CTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
67	NC_011353	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
68	NC_011353	AAC	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209396634
69	NC_011353	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209396634
70	NC_011353	CCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
71	NC_011353	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
72	NC_011353	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
73	NC_011353	CCG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209396634
74	NC_011353	TGC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396634
75	NC_011353	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396634
76	NC_011353	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209396634
77	NC_011353	TTA	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209399918
78	NC_011353	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209399918
79	NC_011353	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209399918
80	NC_011353	CCG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399918
81	NC_011353	CCG	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399918
82	NC_011353	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399918
83	NC_011353	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399918
84	NC_011353	CGG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209399918
85	NC_011353	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
86	NC_011353	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209400824
87	NC_011353	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209400824
88	NC_011353	AAG	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209400824
89	NC_011353	AAT	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209400824
90	NC_011353	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209400824
91	NC_011353	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400824
92	NC_011353	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400824
93	NC_011353	CAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209400824
94	NC_011353	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
95	NC_011353	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209400824
96	NC_011353	TGA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209400824
97	NC_011353	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400824
98	NC_011353	GTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209400824
99	NC_011353	CAT	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398740
100	NC_011353	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
101	NC_011353	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209398740
102	NC_011353	AGA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398740
103	NC_011353	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398740
104	NC_011353	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
105	NC_011353	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
106	NC_011353	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209398740
107	NC_011353	TTA	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209398740
108	NC_011353	CAG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398740
109	NC_011353	AAT	2	6	7425	7430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209398740
110	NC_011353	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398740
111	NC_011353	CAA	2	6	7897	7902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209398740
112	NC_011353	TAA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209398740
113	NC_011353	CGT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
114	NC_011353	ATC	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399547
115	NC_011353	ACC	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209399547
116	NC_011353	CAG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399547
117	NC_011353	CAG	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399547
118	NC_011353	TGC	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
119	NC_011353	AAG	2	6	8697	8702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209399547
120	NC_011353	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
121	NC_011353	TTG	2	6	8787	8792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209399547
122	NC_011353	AGA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209399547
123	NC_011353	TAC	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399547
124	NC_011353	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
125	NC_011353	GCA	2	6	9103	9108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399547
126	NC_011353	CTG	2	6	9200	9205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399547
127	NC_011353	TGA	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398876
128	NC_011353	GCG	2	6	9372	9377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398876
129	NC_011353	GAA	2	6	9407	9412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209398876
130	NC_011353	ATC	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398876
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377	NC_011353	GCA	2	6	31497	31502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398644
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385	NC_011353	TGG	2	6	32026	32031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209400346
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500	NC_011353	GAC	2	6	40598	40603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398425

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