MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011352	AAGCG	2	10	1546	1555	40 %	0 %	40 %	20 %	209401010
2	NC_011352	ACAAA	2	10	1980	1989	80 %	0 %	0 %	20 %	209401012
3	NC_011352	CTCAA	2	10	2151	2160	40 %	20 %	0 %	40 %	209401012
4	NC_011352	CGGAT	2	10	3972	3981	20 %	20 %	40 %	20 %	209401015
5	NC_011352	TAGCT	2	10	5514	5523	20 %	40 %	20 %	20 %	209401016
6	NC_011352	AAAGA	2	10	9583	9592	80 %	0 %	20 %	0 %	209401021
7	NC_011352	TAAAC	2	10	9829	9838	60 %	20 %	0 %	20 %	209401021
8	NC_011352	CGAAT	2	10	12970	12979	40 %	20 %	20 %	20 %	209401024
9	NC_011352	GTTCT	2	10	13159	13168	0 %	60 %	20 %	20 %	209401025
10	NC_011352	AACAA	2	10	13821	13830	80 %	0 %	0 %	20 %	209401026
11	NC_011352	GCAAG	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	209401032
12	NC_011352	TACCT	2	10	19292	19301	20 %	40 %	0 %	40 %	209401032
13	NC_011352	ATTTA	2	10	19950	19959	40 %	60 %	0 %	0 %	209401034
14	NC_011352	TAAAT	2	10	20803	20812	60 %	40 %	0 %	0 %	209401034
15	NC_011352	AATTT	2	10	21525	21534	40 %	60 %	0 %	0 %	209401035
16	NC_011352	ATTAT	2	10	22070	22079	40 %	60 %	0 %	0 %	209401035
17	NC_011352	ATCCT	2	10	24594	24603	20 %	40 %	0 %	40 %	209401039
18	NC_011352	TATAA	2	10	26329	26338	60 %	40 %	0 %	0 %	209401040
19	NC_011352	CCTCA	2	10	28288	28297	20 %	20 %	0 %	60 %	209401041
20	NC_011352	TAAAA	2	10	31123	31132	80 %	20 %	0 %	0 %	209401044
21	NC_011352	TTGTA	2	10	35646	35655	20 %	60 %	20 %	0 %	209401052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.