MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011352	TA	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	209401053
2	NC_011352	TA	3	6	1831	1836	50 %	50 %	0 %	0 %	209401011
3	NC_011352	AT	3	6	1909	1914	50 %	50 %	0 %	0 %	209401012
4	NC_011352	AG	3	6	2402	2407	50 %	0 %	50 %	0 %	209401012
5	NC_011352	AC	3	6	3233	3238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011352	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	209401015
7	NC_011352	GA	3	6	6684	6689	50 %	0 %	50 %	0 %	209401018
8	NC_011352	AT	3	6	8109	8114	50 %	50 %	0 %	0 %	209401021
9	NC_011352	AT	3	6	13281	13286	50 %	50 %	0 %	0 %	209401025
10	NC_011352	AG	4	8	15568	15575	50 %	0 %	50 %	0 %	209401028
11	NC_011352	AT	3	6	15663	15668	50 %	50 %	0 %	0 %	209401029
12	NC_011352	AC	3	6	15986	15991	50 %	0 %	0 %	50 %	209401029
13	NC_011352	TG	3	6	16550	16555	0 %	50 %	50 %	0 %	209401030
14	NC_011352	AT	3	6	16898	16903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011352	TA	3	6	17169	17174	50 %	50 %	0 %	0 %	209401031
16	NC_011352	TA	3	6	17872	17877	50 %	50 %	0 %	0 %	209401032
17	NC_011352	CA	3	6	18675	18680	50 %	0 %	0 %	50 %	209401032
18	NC_011352	AT	3	6	23378	23383	50 %	50 %	0 %	0 %	209401037
19	NC_011352	TC	3	6	23406	23411	0 %	50 %	0 %	50 %	209401037
20	NC_011352	CT	3	6	23537	23542	0 %	50 %	0 %	50 %	209401037
21	NC_011352	CT	3	6	24346	24351	0 %	50 %	0 %	50 %	209401039
22	NC_011352	AT	3	6	26655	26660	50 %	50 %	0 %	0 %	209401040
23	NC_011352	TA	3	6	27484	27489	50 %	50 %	0 %	0 %	209401040
24	NC_011352	AT	3	6	28630	28635	50 %	50 %	0 %	0 %	209401042
25	NC_011352	TA	3	6	28968	28973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011352	TG	3	6	29721	29726	0 %	50 %	50 %	0 %	209401043
27	NC_011352	AT	3	6	30877	30882	50 %	50 %	0 %	0 %	209401044
28	NC_011352	AC	3	6	34884	34889	50 %	0 %	0 %	50 %	209401050
29	NC_011352	AT	3	6	35316	35321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011352	AT	3	6	35326	35331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011352	CT	3	6	36441	36446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011352	GT	3	6	36458	36463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.