MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011352	TA	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	209401053
2	NC_011352	TA	3	6	1831	1836	50 %	50 %	0 %	0 %	209401011
3	NC_011352	AT	3	6	1909	1914	50 %	50 %	0 %	0 %	209401012
4	NC_011352	AG	3	6	2402	2407	50 %	0 %	50 %	0 %	209401012
5	NC_011352	AT	3	6	3810	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	209401015
6	NC_011352	GA	3	6	6684	6689	50 %	0 %	50 %	0 %	209401018
7	NC_011352	AT	3	6	8109	8114	50 %	50 %	0 %	0 %	209401021
8	NC_011352	AT	3	6	13281	13286	50 %	50 %	0 %	0 %	209401025
9	NC_011352	AG	4	8	15568	15575	50 %	0 %	50 %	0 %	209401028
10	NC_011352	AT	3	6	15663	15668	50 %	50 %	0 %	0 %	209401029
11	NC_011352	AC	3	6	15986	15991	50 %	0 %	0 %	50 %	209401029
12	NC_011352	TG	3	6	16550	16555	0 %	50 %	50 %	0 %	209401030
13	NC_011352	TA	3	6	17169	17174	50 %	50 %	0 %	0 %	209401031
14	NC_011352	TA	3	6	17872	17877	50 %	50 %	0 %	0 %	209401032
15	NC_011352	CA	3	6	18675	18680	50 %	0 %	0 %	50 %	209401032
16	NC_011352	AT	3	6	23378	23383	50 %	50 %	0 %	0 %	209401037
17	NC_011352	TC	3	6	23406	23411	0 %	50 %	0 %	50 %	209401037
18	NC_011352	CT	3	6	23537	23542	0 %	50 %	0 %	50 %	209401037
19	NC_011352	CT	3	6	24346	24351	0 %	50 %	0 %	50 %	209401039
20	NC_011352	AT	3	6	26655	26660	50 %	50 %	0 %	0 %	209401040
21	NC_011352	TA	3	6	27484	27489	50 %	50 %	0 %	0 %	209401040
22	NC_011352	AT	3	6	28630	28635	50 %	50 %	0 %	0 %	209401042
23	NC_011352	TG	3	6	29721	29726	0 %	50 %	50 %	0 %	209401043
24	NC_011352	AT	3	6	30877	30882	50 %	50 %	0 %	0 %	209401044
25	NC_011352	AC	3	6	34884	34889	50 %	0 %	0 %	50 %	209401050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.