MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011352	A	6	6	268	273	100 %	0 %	0 %	0 %	209401053
2	NC_011352	A	7	7	913	919	100 %	0 %	0 %	0 %	209401053
3	NC_011352	T	6	6	1737	1742	0 %	100 %	0 %	0 %	209401011
4	NC_011352	A	6	6	2530	2535	100 %	0 %	0 %	0 %	209401012
5	NC_011352	T	6	6	2786	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	209401013
6	NC_011352	T	7	7	2999	3005	0 %	100 %	0 %	0 %	209401014
7	NC_011352	T	6	6	3015	3020	0 %	100 %	0 %	0 %	209401014
8	NC_011352	A	6	6	3896	3901	100 %	0 %	0 %	0 %	209401015
9	NC_011352	A	6	6	3903	3908	100 %	0 %	0 %	0 %	209401015
10	NC_011352	A	7	7	3960	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	209401015
11	NC_011352	A	6	6	4361	4366	100 %	0 %	0 %	0 %	209401015
12	NC_011352	A	6	6	4406	4411	100 %	0 %	0 %	0 %	209401015
13	NC_011352	A	7	7	5673	5679	100 %	0 %	0 %	0 %	209401016
14	NC_011352	T	8	8	5817	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011352	T	6	6	6154	6159	0 %	100 %	0 %	0 %	209401017
16	NC_011352	A	6	6	7855	7860	100 %	0 %	0 %	0 %	209401021
17	NC_011352	A	6	6	8083	8088	100 %	0 %	0 %	0 %	209401021
18	NC_011352	A	6	6	10648	10653	100 %	0 %	0 %	0 %	209401022
19	NC_011352	A	6	6	10781	10786	100 %	0 %	0 %	0 %	209401022
20	NC_011352	A	7	7	11202	11208	100 %	0 %	0 %	0 %	209401022
21	NC_011352	A	6	6	14441	14446	100 %	0 %	0 %	0 %	209401028
22	NC_011352	A	8	8	15498	15505	100 %	0 %	0 %	0 %	209401028
23	NC_011352	A	6	6	15649	15654	100 %	0 %	0 %	0 %	209401029
24	NC_011352	T	6	6	16537	16542	0 %	100 %	0 %	0 %	209401030
25	NC_011352	A	6	6	16944	16949	100 %	0 %	0 %	0 %	209401031
26	NC_011352	T	6	6	17102	17107	0 %	100 %	0 %	0 %	209401031
27	NC_011352	A	7	7	17396	17402	100 %	0 %	0 %	0 %	209401032
28	NC_011352	A	6	6	17580	17585	100 %	0 %	0 %	0 %	209401032
29	NC_011352	A	6	6	20657	20662	100 %	0 %	0 %	0 %	209401034
30	NC_011352	A	6	6	20704	20709	100 %	0 %	0 %	0 %	209401034
31	NC_011352	A	6	6	20797	20802	100 %	0 %	0 %	0 %	209401034
32	NC_011352	T	6	6	21076	21081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011352	A	6	6	22534	22539	100 %	0 %	0 %	0 %	209401035
34	NC_011352	A	6	6	23513	23518	100 %	0 %	0 %	0 %	209401037
35	NC_011352	T	6	6	23965	23970	0 %	100 %	0 %	0 %	209401038
36	NC_011352	T	6	6	25293	25298	0 %	100 %	0 %	0 %	209401040
37	NC_011352	A	6	6	26430	26435	100 %	0 %	0 %	0 %	209401040
38	NC_011352	T	6	6	28151	28156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011352	A	6	6	28436	28441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011352	T	7	7	28637	28643	0 %	100 %	0 %	0 %	209401042
41	NC_011352	T	6	6	28745	28750	0 %	100 %	0 %	0 %	209401042
42	NC_011352	A	7	7	28869	28875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011352	A	7	7	29233	29239	100 %	0 %	0 %	0 %	209401043
44	NC_011352	A	6	6	29889	29894	100 %	0 %	0 %	0 %	209401043
45	NC_011352	T	8	8	30434	30441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011352	A	8	8	30667	30674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011352	T	7	7	30920	30926	0 %	100 %	0 %	0 %	209401044
48	NC_011352	A	7	7	31099	31105	100 %	0 %	0 %	0 %	209401044
49	NC_011352	A	6	6	31502	31507	100 %	0 %	0 %	0 %	209401045
50	NC_011352	T	6	6	31983	31988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011352	G	6	6	33531	33536	0 %	0 %	100 %	0 %	209401047
52	NC_011352	T	7	7	33779	33785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011352	T	6	6	33945	33950	0 %	100 %	0 %	0 %	209401048
54	NC_011352	T	6	6	34064	34069	0 %	100 %	0 %	0 %	209401048
55	NC_011352	A	6	6	34111	34116	100 %	0 %	0 %	0 %	209401049
56	NC_011352	A	6	6	34449	34454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011352	T	6	6	35253	35258	0 %	100 %	0 %	0 %	209401050
58	NC_011352	A	7	7	35355	35361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011352	A	6	6	35562	35567	100 %	0 %	0 %	0 %	209401051
60	NC_011352	T	6	6	35635	35640	0 %	100 %	0 %	0 %	209401052
61	NC_011352	T	6	6	35657	35662	0 %	100 %	0 %	0 %	209401052
62	NC_011352	T	6	6	36286	36291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011352	A	6	6	36305	36310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.