MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	CTTTT	2	10	2361	2370	0 %	80 %	0 %	20 %	209395687
2	NC_011351	GATGA	2	10	2430	2439	40 %	20 %	40 %	0 %	209395687
3	NC_011351	AATAT	2	10	2477	2486	60 %	40 %	0 %	0 %	209395686
4	NC_011351	GTTTT	2	10	5015	5024	0 %	80 %	20 %	0 %	209395655
5	NC_011351	TTCTT	2	10	5822	5831	0 %	80 %	0 %	20 %	209395648
6	NC_011351	ATTTT	2	10	7509	7518	20 %	80 %	0 %	0 %	209395648
7	NC_011351	TGAAT	2	10	8122	8131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011351	AGCAA	2	10	8466	8475	60 %	0 %	20 %	20 %	209395679
9	NC_011351	ATGTC	2	10	8576	8585	20 %	40 %	20 %	20 %	209395679
10	NC_011351	TTACT	2	10	8690	8699	20 %	60 %	0 %	20 %	209395679
11	NC_011351	CAGAA	2	10	13159	13168	60 %	0 %	20 %	20 %	209395641
12	NC_011351	AAAAT	2	10	13570	13579	80 %	20 %	0 %	0 %	209395641
13	NC_011351	GTTCA	2	10	18081	18090	20 %	40 %	20 %	20 %	209395643
14	NC_011351	ATTGT	2	10	20826	20835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011351	ACAAT	2	10	20836	20845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011351	CCTTA	2	10	22734	22743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011351	TTCCC	2	10	22882	22891	0 %	40 %	0 %	60 %	209395640
18	NC_011351	TGCTC	2	10	22966	22975	0 %	40 %	20 %	40 %	209395640
19	NC_011351	CCTGC	2	10	23027	23036	0 %	20 %	20 %	60 %	209395653
20	NC_011351	AACAT	2	10	25063	25072	60 %	20 %	0 %	20 %	209395660
21	NC_011351	TTTTC	2	10	27935	27944	0 %	80 %	0 %	20 %	209395673
22	NC_011351	AAACC	2	10	28526	28535	60 %	0 %	0 %	40 %	209395673
23	NC_011351	CTTTT	2	10	28702	28711	0 %	80 %	0 %	20 %	209395673
24	NC_011351	TTGTT	2	10	29788	29797	0 %	80 %	20 %	0 %	209395644
25	NC_011351	GAAAA	2	10	30566	30575	80 %	0 %	20 %	0 %	209395661
26	NC_011351	CCTTT	2	10	33335	33344	0 %	60 %	0 %	40 %	209395658
27	NC_011351	AGTTA	2	10	34120	34129	40 %	40 %	20 %	0 %	209395669
28	NC_011351	GGGCG	2	10	34368	34377	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011351	CTTTA	2	10	34963	34972	20 %	60 %	0 %	20 %	209395668
30	NC_011351	AGTTA	2	10	36016	36025	40 %	40 %	20 %	0 %	209395662
31	NC_011351	GGGCG	2	10	36264	36273	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011351	GTTTT	2	10	37039	37048	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011351	TTGTT	2	10	37283	37292	0 %	80 %	20 %	0 %	209395684
34	NC_011351	GCTTG	2	10	37372	37381	0 %	40 %	40 %	20 %	209395684

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.