MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	TTTA	2	8	14	21	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011351	TCAA	2	8	137	144	50 %	25 %	0 %	25 %	209395651
3	NC_011351	AAAT	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	209395651
4	NC_011351	TGAA	2	8	769	776	50 %	25 %	25 %	0 %	209395651
5	NC_011351	AAAG	2	8	1077	1084	75 %	0 %	25 %	0 %	209395651
6	NC_011351	AGCG	2	8	1351	1358	25 %	0 %	50 %	25 %	209395646
7	NC_011351	AGCT	2	8	1407	1414	25 %	25 %	25 %	25 %	209395646
8	NC_011351	CTTT	2	8	1637	1644	0 %	75 %	0 %	25 %	209395678
9	NC_011351	TATG	2	8	2208	2215	25 %	50 %	25 %	0 %	209395687
10	NC_011351	TTAT	2	8	2321	2328	25 %	75 %	0 %	0 %	209395687
11	NC_011351	TGGT	2	8	2682	2689	0 %	50 %	50 %	0 %	209395686
12	NC_011351	GGTA	2	8	3004	3011	25 %	25 %	50 %	0 %	209395686
13	NC_011351	TTTA	2	8	3013	3020	25 %	75 %	0 %	0 %	209395686
14	NC_011351	GAAA	2	8	3993	4000	75 %	0 %	25 %	0 %	209395666
15	NC_011351	AAAT	2	8	4059	4066	75 %	25 %	0 %	0 %	209395666
16	NC_011351	GCGG	2	8	4099	4106	0 %	0 %	75 %	25 %	209395666
17	NC_011351	GCTA	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	209395685
18	NC_011351	AAGA	2	8	4800	4807	75 %	0 %	25 %	0 %	209395685
19	NC_011351	GAAT	2	8	4988	4995	50 %	25 %	25 %	0 %	209395685
20	NC_011351	TTTC	2	8	5371	5378	0 %	75 %	0 %	25 %	209395642
21	NC_011351	ATTT	2	8	5965	5972	25 %	75 %	0 %	0 %	209395648
22	NC_011351	TTAA	2	8	6186	6193	50 %	50 %	0 %	0 %	209395648
23	NC_011351	AATC	2	8	6238	6245	50 %	25 %	0 %	25 %	209395648
24	NC_011351	TTTG	2	8	6419	6426	0 %	75 %	25 %	0 %	209395648
25	NC_011351	AGGT	2	8	7432	7439	25 %	25 %	50 %	0 %	209395648
26	NC_011351	AGTC	2	8	7668	7675	25 %	25 %	25 %	25 %	209395648
27	NC_011351	TCTT	2	8	8068	8075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011351	AAAG	2	8	8232	8239	75 %	0 %	25 %	0 %	209395679
29	NC_011351	AAAG	2	8	9056	9063	75 %	0 %	25 %	0 %	209395671
30	NC_011351	TAAT	2	8	9352	9359	50 %	50 %	0 %	0 %	209395671
31	NC_011351	GCAA	2	8	9950	9957	50 %	0 %	25 %	25 %	209395657
32	NC_011351	AAAT	2	8	9998	10005	75 %	25 %	0 %	0 %	209395657
33	NC_011351	GCAA	2	8	10026	10033	50 %	0 %	25 %	25 %	209395657
34	NC_011351	GAAA	2	8	10092	10099	75 %	0 %	25 %	0 %	209395657
35	NC_011351	GCTG	2	8	10257	10264	0 %	25 %	50 %	25 %	209395657
36	NC_011351	TGGT	2	8	10940	10947	0 %	50 %	50 %	0 %	209395664
37	NC_011351	CATA	2	8	11766	11773	50 %	25 %	0 %	25 %	209395664
38	NC_011351	AATT	2	8	11831	11838	50 %	50 %	0 %	0 %	209395664
39	NC_011351	TTAT	2	8	12160	12167	25 %	75 %	0 %	0 %	209395641
40	NC_011351	AAGG	2	8	12304	12311	50 %	0 %	50 %	0 %	209395641
41	NC_011351	ACAG	2	8	12478	12485	50 %	0 %	25 %	25 %	209395641
42	NC_011351	GCTT	2	8	12710	12717	0 %	50 %	25 %	25 %	209395641
43	NC_011351	AGAA	2	8	12874	12881	75 %	0 %	25 %	0 %	209395641
44	NC_011351	ATTA	2	8	13088	13095	50 %	50 %	0 %	0 %	209395641
45	NC_011351	CTCA	2	8	13096	13103	25 %	25 %	0 %	50 %	209395641
46	NC_011351	AGTG	2	8	13998	14005	25 %	25 %	50 %	0 %	209395656
47	NC_011351	ACAG	2	8	15385	15392	50 %	0 %	25 %	25 %	209395645
48	NC_011351	TTGG	2	8	16126	16133	0 %	50 %	50 %	0 %	209395665
49	NC_011351	GTAA	2	8	16144	16151	50 %	25 %	25 %	0 %	209395665
50	NC_011351	TAAT	2	8	16364	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	209395691
51	NC_011351	TAAA	2	8	16691	16698	75 %	25 %	0 %	0 %	209395691
52	NC_011351	CTTC	2	8	16746	16753	0 %	50 %	0 %	50 %	209395691
53	NC_011351	TCTG	2	8	17441	17448	0 %	50 %	25 %	25 %	209395643
54	NC_011351	TGCT	2	8	18355	18362	0 %	50 %	25 %	25 %	209395643
55	NC_011351	GCAG	2	8	18623	18630	25 %	0 %	50 %	25 %	209395643
56	NC_011351	TTCT	2	8	18871	18878	0 %	75 %	0 %	25 %	209395643
57	NC_011351	ATTG	2	8	18977	18984	25 %	50 %	25 %	0 %	209395643
58	NC_011351	GTTG	2	8	19470	19477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011351	TGTT	2	8	19573	19580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011351	TCAG	2	8	20244	20251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011351	CTGG	2	8	20318	20325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011351	CAGC	2	8	20766	20773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011351	GCTG	2	8	21807	21814	0 %	25 %	50 %	25 %	209395647
64	NC_011351	AGAT	2	8	21917	21924	50 %	25 %	25 %	0 %	209395647
65	NC_011351	CTTC	2	8	22371	22378	0 %	50 %	0 %	50 %	209395675
66	NC_011351	AATT	2	8	22625	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011351	TGAA	2	8	23408	23415	50 %	25 %	25 %	0 %	209395650
68	NC_011351	AGAA	2	8	23517	23524	75 %	0 %	25 %	0 %	209395650
69	NC_011351	GACA	2	8	23708	23715	50 %	0 %	25 %	25 %	209395650
70	NC_011351	TGTT	2	8	24366	24373	0 %	75 %	25 %	0 %	209395639
71	NC_011351	CATT	2	8	24438	24445	25 %	50 %	0 %	25 %	209395639
72	NC_011351	AATA	2	8	25049	25056	75 %	25 %	0 %	0 %	209395660
73	NC_011351	GTAT	2	8	25782	25789	25 %	50 %	25 %	0 %	209395649
74	NC_011351	GGCT	2	8	25882	25889	0 %	25 %	50 %	25 %	209395689
75	NC_011351	TTTG	2	8	26012	26019	0 %	75 %	25 %	0 %	209395689
76	NC_011351	AGAA	2	8	26038	26045	75 %	0 %	25 %	0 %	209395689
77	NC_011351	TTAT	2	8	26133	26140	25 %	75 %	0 %	0 %	209395692
78	NC_011351	TCTA	2	8	26374	26381	25 %	50 %	0 %	25 %	209395692
79	NC_011351	TTAT	2	8	26388	26395	25 %	75 %	0 %	0 %	209395692
80	NC_011351	TAAA	2	8	26405	26412	75 %	25 %	0 %	0 %	209395692
81	NC_011351	CTTT	2	8	26452	26459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011351	TTCT	2	8	27399	27406	0 %	75 %	0 %	25 %	209395673
83	NC_011351	AGAA	2	8	28245	28252	75 %	0 %	25 %	0 %	209395673
84	NC_011351	TTTC	2	8	28269	28276	0 %	75 %	0 %	25 %	209395673
85	NC_011351	AATA	2	8	28760	28767	75 %	25 %	0 %	0 %	209395673
86	NC_011351	ACCT	2	8	29243	29250	25 %	25 %	0 %	50 %	209395673
87	NC_011351	GCTG	2	8	30505	30512	0 %	25 %	50 %	25 %	209395661
88	NC_011351	TCAA	2	8	30761	30768	50 %	25 %	0 %	25 %	209395690
89	NC_011351	AAAC	2	8	31269	31276	75 %	0 %	0 %	25 %	209395690
90	NC_011351	ACTG	2	8	31384	31391	25 %	25 %	25 %	25 %	209395690
91	NC_011351	AGAA	2	8	32072	32079	75 %	0 %	25 %	0 %	209395652
92	NC_011351	GATC	2	8	32726	32733	25 %	25 %	25 %	25 %	209395681
93	NC_011351	GAAA	2	8	34164	34171	75 %	0 %	25 %	0 %	209395669
94	NC_011351	TTCT	2	8	34595	34602	0 %	75 %	0 %	25 %	209395670
95	NC_011351	ATTT	2	8	35310	35317	25 %	75 %	0 %	0 %	209395667
96	NC_011351	AAAC	2	8	35588	35595	75 %	0 %	0 %	25 %	209395676
97	NC_011351	GTAT	2	8	35678	35685	25 %	50 %	25 %	0 %	209395676
98	NC_011351	CATT	2	8	35722	35729	25 %	50 %	0 %	25 %	209395676
99	NC_011351	GAAG	2	8	35739	35746	50 %	0 %	50 %	0 %	209395676
100	NC_011351	GAAA	2	8	36060	36067	75 %	0 %	25 %	0 %	209395662
101	NC_011351	AATG	2	8	36489	36496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011351	GAGC	2	8	36864	36871	25 %	0 %	50 %	25 %	209395680
103	NC_011351	ACTT	2	8	37182	37189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011351	TAAG	2	8	37207	37214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011351	TTGA	2	8	37270	37277	25 %	50 %	25 %	0 %	209395684
106	NC_011351	TAAC	2	8	37441	37448	50 %	25 %	0 %	25 %	209395684

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.