MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	GTT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011351	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011351	TAA	2	6	1126	1131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011351	CCG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011351	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011351	AGG	2	6	1216	1221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011351	CCA	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011351	GGC	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011351	TAA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011351	AGG	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011351	GGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011351	TTA	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011351	ACA	2	6	8132	8137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011351	TGA	2	6	14241	14246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011351	TCA	2	6	16152	16157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011351	AAC	2	6	16206	16211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011351	TAA	2	6	16236	16241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011351	ATA	2	6	16867	16872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011351	ATT	2	6	19041	19046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011351	GGT	2	6	19101	19106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011351	TAA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011351	TGG	2	6	20112	20117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011351	GTG	2	6	20212	20217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011351	GGT	2	6	20333	20338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011351	AGG	3	9	20359	20367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011351	TCC	2	6	20435	20440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011351	GAT	2	6	20459	20464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011351	ATC	2	6	20475	20480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011351	TGA	2	6	20553	20558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011351	CGG	2	6	20699	20704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011351	TTG	2	6	20715	20720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011351	CTT	2	6	20808	20813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011351	CGC	2	6	20815	20820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011351	GCA	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011351	TGC	2	6	20973	20978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011351	ACT	2	6	21084	21089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011351	GCA	2	6	21151	21156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011351	GTG	2	6	21183	21188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011351	AGG	2	6	21259	21264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011351	TAT	2	6	21295	21300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011351	GTG	2	6	21303	21308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011351	ATT	2	6	21386	21391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011351	TGA	2	6	21421	21426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011351	TTA	2	6	21462	21467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011351	ATA	2	6	21510	21515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011351	CAA	2	6	21567	21572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011351	TAA	2	6	21685	21690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011351	ATT	2	6	21692	21697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011351	ATC	2	6	22463	22468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011351	TAT	2	6	22613	22618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011351	GGT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011351	CTG	2	6	22786	22791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011351	TAA	2	6	24008	24013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011351	TCA	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011351	TAT	2	6	24780	24785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011351	ACG	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011351	CAC	2	6	30170	30175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011351	ACA	2	6	30231	30236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011351	CGG	2	6	32696	32701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011351	TCC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011351	GCG	2	6	33033	33038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011351	ATG	2	6	33056	33061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011351	AAT	2	6	33090	33095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011351	CAG	2	6	34277	34282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011351	GCA	2	6	34362	34367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011351	CAA	2	6	34414	34419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011351	TAT	2	6	35275	35280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011351	TCC	2	6	35518	35523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011351	CAG	2	6	36173	36178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011351	GCA	2	6	36258	36263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011351	GGT	2	6	36429	36434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011351	CGA	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011351	AAG	2	6	36562	36567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011351	CCA	2	6	36604	36609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.