MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	ATG	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
2	NC_011351	TGA	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
3	NC_011351	ACA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395651
4	NC_011351	TTG	2	6	268	273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
5	NC_011351	GAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
6	NC_011351	AAG	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
7	NC_011351	GAA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395651
8	NC_011351	CTC	2	6	550	555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395651
9	NC_011351	TCA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
10	NC_011351	GTT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395651
11	NC_011351	ATC	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395651
12	NC_011351	GGC	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395651
13	NC_011351	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395651
14	NC_011351	TAG	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
15	NC_011351	TAT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395651
16	NC_011351	GGA	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395651
17	NC_011351	ATG	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395651
18	NC_011351	TCT	2	6	1449	1454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395646
19	NC_011351	ACT	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395646
20	NC_011351	AAT	2	6	1663	1668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395678
21	NC_011351	GTT	2	6	1731	1736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395678
22	NC_011351	ATG	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
23	NC_011351	ACT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395682
24	NC_011351	GTT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395682
25	NC_011351	CTT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395682
26	NC_011351	GAA	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395682
27	NC_011351	TGA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395682
28	NC_011351	AAT	2	6	2029	2034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395682
29	NC_011351	AAG	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395687
30	NC_011351	ACA	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
31	NC_011351	GCA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
32	NC_011351	TAT	2	6	2596	2601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
33	NC_011351	TTG	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
34	NC_011351	ATA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395686
35	NC_011351	ATT	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
36	NC_011351	TCT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395686
37	NC_011351	AGG	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
38	NC_011351	TAC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395686
39	NC_011351	GTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395686
40	NC_011351	ACA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395686
41	NC_011351	TTA	2	6	3197	3202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395686
42	NC_011351	GCA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395686
43	NC_011351	GCT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395686
44	NC_011351	AGT	2	6	3403	3408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395686
45	NC_011351	AGG	2	6	3442	3447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395686
46	NC_011351	GTT	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395663
47	NC_011351	ATG	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395663
48	NC_011351	ATT	3	9	3529	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395663
49	NC_011351	AGA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395663
50	NC_011351	AAT	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395663
51	NC_011351	TGT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395666
52	NC_011351	GCT	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395666
53	NC_011351	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395666
54	NC_011351	TAG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
55	NC_011351	ATG	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
56	NC_011351	ATT	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395666
57	NC_011351	CGC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395666
58	NC_011351	TGA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395666
59	NC_011351	TCT	2	6	4479	4484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395685
60	NC_011351	CTG	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395685
61	NC_011351	GGA	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395685
62	NC_011351	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
63	NC_011351	TAA	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395685
64	NC_011351	GAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395685
65	NC_011351	TGT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395685
66	NC_011351	CAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395685
67	NC_011351	ATT	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395685
68	NC_011351	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395655
69	NC_011351	CTA	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395655
70	NC_011351	TTG	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395655
71	NC_011351	AGT	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395655
72	NC_011351	CGG	2	6	5250	5255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209395655
73	NC_011351	TAA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395655
74	NC_011351	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
75	NC_011351	GTC	2	6	5365	5370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395642
76	NC_011351	GAT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395642
77	NC_011351	TGG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395642
78	NC_011351	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395642
79	NC_011351	CAT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395642
80	NC_011351	ATT	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395642
81	NC_011351	GTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
82	NC_011351	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
83	NC_011351	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
84	NC_011351	TGA	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
85	NC_011351	GAT	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
86	NC_011351	ATG	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
87	NC_011351	ATT	2	6	6087	6092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
88	NC_011351	GTT	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
89	NC_011351	ATT	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
90	NC_011351	ATC	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395648
91	NC_011351	TAA	2	6	6290	6295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395648
92	NC_011351	TGA	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
93	NC_011351	TGC	2	6	6491	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395648
94	NC_011351	CAA	2	6	6504	6509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395648
95	NC_011351	GAA	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
96	NC_011351	ACG	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395648
97	NC_011351	GAA	2	6	6748	6753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
98	NC_011351	ATT	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
99	NC_011351	TAT	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
100	NC_011351	TAA	2	6	6902	6907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395648
101	NC_011351	ATT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
102	NC_011351	TGG	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395648
103	NC_011351	ATC	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395648
104	NC_011351	ACA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395648
105	NC_011351	CTG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209395648
106	NC_011351	GAG	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395648
107	NC_011351	ATG	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
108	NC_011351	TTG	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
109	NC_011351	TTG	2	6	7789	7794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395648
110	NC_011351	TAA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395648
111	NC_011351	TGA	2	6	7898	7903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395648
112	NC_011351	TTC	2	6	7906	7911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395648
113	NC_011351	ACG	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395648
114	NC_011351	GAA	2	6	7962	7967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395648
115	NC_011351	TTA	2	6	8005	8010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395648
116	NC_011351	AGA	2	6	8202	8207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395679
117	NC_011351	TTA	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395679
118	NC_011351	TGT	2	6	8331	8336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395679
119	NC_011351	GCA	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395679
120	NC_011351	AGG	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209395679
121	NC_011351	TTA	2	6	8519	8524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395679
122	NC_011351	TAA	2	6	8586	8591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395679
123	NC_011351	CGC	2	6	8636	8641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209395679
124	NC_011351	TAA	2	6	8811	8816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395679
125	NC_011351	GAA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395679
126	NC_011351	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395679
127	NC_011351	CAA	2	6	8962	8967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209395671
128	NC_011351	GTT	2	6	9018	9023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395671
129	NC_011351	TGT	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209395671
130	NC_011351	TCT	2	6	9163	9168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395671
131	NC_011351	AGA	2	6	9182	9187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395671
132	NC_011351	TGG	2	6	9344	9349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209395671
133	NC_011351	GAC	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395671
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140	NC_011351	TCC	2	6	9739	9744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209395657
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382	NC_011351	CAC	2	6	31698	31703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209395652
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384	NC_011351	AAG	2	6	31808	31813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209395652
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386	NC_011351	ATA	2	6	31882	31887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209395652
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.