MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	AT	3	6	567	572	50 %	50 %	0 %	0 %	209395651
2	NC_011351	AC	3	6	1244	1249	50 %	0 %	0 %	50 %	209395646
3	NC_011351	AG	4	8	2255	2262	50 %	0 %	50 %	0 %	209395687
4	NC_011351	TC	3	6	3494	3499	0 %	50 %	0 %	50 %	209395663
5	NC_011351	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	209395685
6	NC_011351	AT	4	8	5981	5988	50 %	50 %	0 %	0 %	209395648
7	NC_011351	AC	3	6	6885	6890	50 %	0 %	0 %	50 %	209395648
8	NC_011351	AG	3	6	7265	7270	50 %	0 %	50 %	0 %	209395648
9	NC_011351	TG	3	6	7945	7950	0 %	50 %	50 %	0 %	209395648
10	NC_011351	AC	3	6	9224	9229	50 %	0 %	0 %	50 %	209395671
11	NC_011351	AT	3	6	10550	10555	50 %	50 %	0 %	0 %	209395657
12	NC_011351	CA	3	6	10623	10628	50 %	0 %	0 %	50 %	209395657
13	NC_011351	AT	3	6	10734	10739	50 %	50 %	0 %	0 %	209395657
14	NC_011351	TC	3	6	11129	11134	0 %	50 %	0 %	50 %	209395664
15	NC_011351	CA	3	6	11220	11225	50 %	0 %	0 %	50 %	209395664
16	NC_011351	AT	5	10	12323	12332	50 %	50 %	0 %	0 %	209395641
17	NC_011351	TG	3	6	12408	12413	0 %	50 %	50 %	0 %	209395641
18	NC_011351	CT	3	6	12816	12821	0 %	50 %	0 %	50 %	209395641
19	NC_011351	AT	3	6	13062	13067	50 %	50 %	0 %	0 %	209395641
20	NC_011351	AT	3	6	13764	13769	50 %	50 %	0 %	0 %	209395641
21	NC_011351	AC	3	6	13821	13826	50 %	0 %	0 %	50 %	209395641
22	NC_011351	TA	3	6	16497	16502	50 %	50 %	0 %	0 %	209395691
23	NC_011351	AT	3	6	16531	16536	50 %	50 %	0 %	0 %	209395691
24	NC_011351	TA	3	6	16552	16557	50 %	50 %	0 %	0 %	209395691
25	NC_011351	AG	3	6	16759	16764	50 %	0 %	50 %	0 %	209395691
26	NC_011351	TA	3	6	19245	19250	50 %	50 %	0 %	0 %	209395688
27	NC_011351	AT	3	6	19257	19262	50 %	50 %	0 %	0 %	209395688
28	NC_011351	TA	3	6	19513	19518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011351	AT	3	6	19624	19629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011351	GA	3	6	19700	19705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011351	TC	3	6	20011	20016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011351	GA	3	6	20389	20394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011351	TG	4	8	21649	21656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011351	TC	3	6	23246	23251	0 %	50 %	0 %	50 %	209395650
35	NC_011351	TC	3	6	23340	23345	0 %	50 %	0 %	50 %	209395650
36	NC_011351	AC	3	6	24015	24020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011351	AC	3	6	24087	24092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011351	TG	4	8	24185	24192	0 %	50 %	50 %	0 %	209395639
39	NC_011351	AC	3	6	24787	24792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011351	GT	3	6	25033	25038	0 %	50 %	50 %	0 %	209395660
41	NC_011351	TG	3	6	25148	25153	0 %	50 %	50 %	0 %	209395660
42	NC_011351	GT	3	6	25440	25445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011351	AC	3	6	25452	25457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011351	AC	3	6	25794	25799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011351	TA	3	6	26025	26030	50 %	50 %	0 %	0 %	209395689
46	NC_011351	TA	3	6	26148	26153	50 %	50 %	0 %	0 %	209395692
47	NC_011351	AT	3	6	28120	28125	50 %	50 %	0 %	0 %	209395673
48	NC_011351	AC	3	6	30145	30150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011351	AC	4	8	30157	30164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011351	AC	3	6	30178	30183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011351	CA	3	6	30191	30196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011351	AC	4	8	30202	30209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011351	CA	3	6	30215	30220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011351	CA	3	6	30235	30240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011351	AC	4	8	30246	30253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011351	CA	3	6	30259	30264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011351	AC	4	8	30270	30277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011351	AT	3	6	30317	30322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011351	AT	3	6	30478	30483	50 %	50 %	0 %	0 %	209395661
60	NC_011351	AG	3	6	30679	30684	50 %	0 %	50 %	0 %	209395661
61	NC_011351	TC	3	6	32141	32146	0 %	50 %	0 %	50 %	209395652
62	NC_011351	CG	3	6	32265	32270	0 %	0 %	50 %	50 %	209395659
63	NC_011351	AC	4	8	32916	32923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011351	AC	3	6	32926	32931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011351	AT	3	6	33402	33407	50 %	50 %	0 %	0 %	209395658
66	NC_011351	GT	3	6	34645	34650	0 %	50 %	50 %	0 %	209395670
67	NC_011351	TC	3	6	34721	34726	0 %	50 %	0 %	50 %	209395672
68	NC_011351	GT	3	6	36518	36523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011351	AG	3	6	36679	36684	50 %	0 %	50 %	0 %	209395680
70	NC_011351	GA	3	6	36819	36824	50 %	0 %	50 %	0 %	209395680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.