MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pEC4115

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011351	T	6	6	463	468	0 %	100 %	0 %	0 %	209395651
2	NC_011351	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011351	A	8	8	1384	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395646
4	NC_011351	T	7	7	1540	1546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011351	A	6	6	1562	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011351	A	8	8	1593	1600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011351	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	209395678
8	NC_011351	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	209395682
9	NC_011351	A	6	6	2282	2287	100 %	0 %	0 %	0 %	209395687
10	NC_011351	T	6	6	2573	2578	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
11	NC_011351	T	6	6	2946	2951	0 %	100 %	0 %	0 %	209395686
12	NC_011351	A	6	6	3386	3391	100 %	0 %	0 %	0 %	209395686
13	NC_011351	A	6	6	3456	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
14	NC_011351	A	6	6	3557	3562	100 %	0 %	0 %	0 %	209395663
15	NC_011351	A	7	7	3873	3879	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
16	NC_011351	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	209395666
17	NC_011351	A	7	7	4536	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
18	NC_011351	A	6	6	4706	4711	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
19	NC_011351	A	6	6	4722	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	209395685
20	NC_011351	G	6	6	5195	5200	0 %	0 %	100 %	0 %	209395655
21	NC_011351	T	7	7	5429	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	209395642
22	NC_011351	A	6	6	6309	6314	100 %	0 %	0 %	0 %	209395648
23	NC_011351	T	6	6	6702	6707	0 %	100 %	0 %	0 %	209395648
24	NC_011351	T	6	6	6998	7003	0 %	100 %	0 %	0 %	209395648
25	NC_011351	A	7	7	7776	7782	100 %	0 %	0 %	0 %	209395648
26	NC_011351	A	6	6	8175	8180	100 %	0 %	0 %	0 %	209395679
27	NC_011351	A	7	7	8218	8224	100 %	0 %	0 %	0 %	209395679
28	NC_011351	T	6	6	8376	8381	0 %	100 %	0 %	0 %	209395679
29	NC_011351	A	6	6	9324	9329	100 %	0 %	0 %	0 %	209395671
30	NC_011351	A	6	6	9624	9629	100 %	0 %	0 %	0 %	209395671
31	NC_011351	A	6	6	9852	9857	100 %	0 %	0 %	0 %	209395657
32	NC_011351	A	6	6	9989	9994	100 %	0 %	0 %	0 %	209395657
33	NC_011351	A	6	6	11214	11219	100 %	0 %	0 %	0 %	209395664
34	NC_011351	G	6	6	11563	11568	0 %	0 %	100 %	0 %	209395664
35	NC_011351	T	6	6	11757	11762	0 %	100 %	0 %	0 %	209395664
36	NC_011351	A	7	7	11803	11809	100 %	0 %	0 %	0 %	209395664
37	NC_011351	A	7	7	11889	11895	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
38	NC_011351	T	7	7	11908	11914	0 %	100 %	0 %	0 %	209395641
39	NC_011351	A	6	6	12060	12065	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
40	NC_011351	A	7	7	12152	12158	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
41	NC_011351	A	6	6	12552	12557	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
42	NC_011351	A	6	6	12634	12639	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
43	NC_011351	A	6	6	13311	13316	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
44	NC_011351	A	6	6	13671	13676	100 %	0 %	0 %	0 %	209395641
45	NC_011351	T	6	6	14025	14030	0 %	100 %	0 %	0 %	209395656
46	NC_011351	A	6	6	15465	15470	100 %	0 %	0 %	0 %	209395645
47	NC_011351	A	6	6	15919	15924	100 %	0 %	0 %	0 %	209395665
48	NC_011351	A	7	7	16058	16064	100 %	0 %	0 %	0 %	209395665
49	NC_011351	T	6	6	16228	16233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011351	A	6	6	16474	16479	100 %	0 %	0 %	0 %	209395691
51	NC_011351	A	6	6	16825	16830	100 %	0 %	0 %	0 %	209395691
52	NC_011351	A	7	7	17703	17709	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
53	NC_011351	A	6	6	17782	17787	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
54	NC_011351	A	6	6	18405	18410	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
55	NC_011351	A	6	6	18435	18440	100 %	0 %	0 %	0 %	209395643
56	NC_011351	T	6	6	19206	19211	0 %	100 %	0 %	0 %	209395688
57	NC_011351	A	7	7	19821	19827	100 %	0 %	0 %	0 %	209395677
58	NC_011351	A	6	6	20062	20067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011351	T	6	6	20087	20092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011351	A	7	7	20627	20633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011351	A	6	6	20897	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011351	T	7	7	20944	20950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011351	A	7	7	21172	21178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011351	A	6	6	21213	21218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011351	A	8	8	22165	22172	100 %	0 %	0 %	0 %	209395683
66	NC_011351	A	7	7	22404	22410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011351	T	7	7	22860	22866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011351	A	6	6	23072	23077	100 %	0 %	0 %	0 %	209395653
69	NC_011351	T	7	7	23088	23094	0 %	100 %	0 %	0 %	209395653
70	NC_011351	A	7	7	23158	23164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011351	T	6	6	23906	23911	0 %	100 %	0 %	0 %	209395650
72	NC_011351	A	6	6	24668	24673	100 %	0 %	0 %	0 %	209395639
73	NC_011351	T	6	6	24822	24827	0 %	100 %	0 %	0 %	209395660
74	NC_011351	T	7	7	24980	24986	0 %	100 %	0 %	0 %	209395660
75	NC_011351	T	6	6	27496	27501	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
76	NC_011351	T	6	6	27548	27553	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
77	NC_011351	T	7	7	27977	27983	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
78	NC_011351	T	6	6	28052	28057	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
79	NC_011351	A	6	6	28132	28137	100 %	0 %	0 %	0 %	209395673
80	NC_011351	T	6	6	28369	28374	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
81	NC_011351	T	6	6	28645	28650	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
82	NC_011351	T	6	6	28665	28670	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
83	NC_011351	T	6	6	28690	28695	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
84	NC_011351	T	6	6	28905	28910	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
85	NC_011351	T	6	6	29050	29055	0 %	100 %	0 %	0 %	209395673
86	NC_011351	A	6	6	29882	29887	100 %	0 %	0 %	0 %	209395644
87	NC_011351	T	6	6	29970	29975	0 %	100 %	0 %	0 %	209395644
88	NC_011351	T	6	6	30120	30125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011351	A	6	6	30220	30225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011351	A	6	6	30544	30549	100 %	0 %	0 %	0 %	209395661
91	NC_011351	T	6	6	30658	30663	0 %	100 %	0 %	0 %	209395661
92	NC_011351	A	8	8	30843	30850	100 %	0 %	0 %	0 %	209395690
93	NC_011351	T	6	6	31277	31282	0 %	100 %	0 %	0 %	209395690
94	NC_011351	A	7	7	31284	31290	100 %	0 %	0 %	0 %	209395690
95	NC_011351	A	7	7	31357	31363	100 %	0 %	0 %	0 %	209395690
96	NC_011351	A	6	6	31655	31660	100 %	0 %	0 %	0 %	209395652
97	NC_011351	A	6	6	31908	31913	100 %	0 %	0 %	0 %	209395652
98	NC_011351	A	6	6	31962	31967	100 %	0 %	0 %	0 %	209395652
99	NC_011351	A	6	6	32165	32170	100 %	0 %	0 %	0 %	209395652
100	NC_011351	A	7	7	32213	32219	100 %	0 %	0 %	0 %	209395652
101	NC_011351	A	7	7	32671	32677	100 %	0 %	0 %	0 %	209395659
102	NC_011351	T	6	6	32756	32761	0 %	100 %	0 %	0 %	209395681
103	NC_011351	A	6	6	32938	32943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011351	A	6	6	32983	32988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011351	A	7	7	33046	33052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011351	A	7	7	33075	33081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011351	G	6	6	33082	33087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011351	C	6	6	33098	33103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_011351	C	7	7	33303	33309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_011351	A	7	7	33310	33316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011351	T	6	6	33551	33556	0 %	100 %	0 %	0 %	209395658
112	NC_011351	T	6	6	33570	33575	0 %	100 %	0 %	0 %	209395658
113	NC_011351	T	7	7	33863	33869	0 %	100 %	0 %	0 %	209395654
114	NC_011351	A	6	6	34098	34103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011351	T	6	6	34615	34620	0 %	100 %	0 %	0 %	209395670
116	NC_011351	T	6	6	34663	34668	0 %	100 %	0 %	0 %	209395670
117	NC_011351	T	6	6	35095	35100	0 %	100 %	0 %	0 %	209395668
118	NC_011351	T	6	6	35186	35191	0 %	100 %	0 %	0 %	209395668
119	NC_011351	G	6	6	35530	35535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011351	C	6	6	35539	35544	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_011351	A	6	6	35994	35999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011351	A	6	6	36958	36963	100 %	0 %	0 %	0 %	209395680
123	NC_011351	T	6	6	37033	37038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011351	T	6	6	37230	37235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.