MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	ATTTTA	2	12	680	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209395592
2	NC_011350	TTTATG	2	12	3204	3215	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209395598
3	NC_011350	TTCTGT	2	12	7118	7129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209395593
4	NC_011350	TATCCA	2	12	10185	10196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209395582
5	NC_011350	GTGTCA	2	12	10383	10394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209395582
6	NC_011350	GCAGCG	2	12	11796	11807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209395535
7	NC_011350	CTCTTT	2	12	12346	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395568
8	NC_011350	GACAGC	2	12	12810	12821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395634
9	NC_011350	TTCTGC	2	12	13100	13111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209395601
10	NC_011350	ACCGGA	2	12	24527	24538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209395636
11	NC_011350	TCCTCT	2	12	26769	26780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011350	TCAGCA	2	12	28698	28709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209395615
13	NC_011350	GCAGAA	2	12	29104	29115	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209395615
14	NC_011350	TACCGC	2	12	29128	29139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209395615
15	NC_011350	TGCTAC	9	54	30008	30061	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011350	TCAGCC	2	12	31071	31082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209395627
17	NC_011350	GGCGCT	2	12	32083	32094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209395612
18	NC_011350	CAGGTG	2	12	32114	32125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209395612
19	NC_011350	GCCGGA	2	12	32455	32466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209395612
20	NC_011350	CACTGG	2	12	33849	33860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209395620
21	NC_011350	TGGCAG	2	12	34525	34536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209395549
22	NC_011350	GGAAAA	2	12	37546	37557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011350	CTTATC	2	12	38747	38758	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011350	TGGATT	2	12	46305	46316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209395580
25	NC_011350	ATAAAA	2	12	46836	46847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	209395580
26	NC_011350	CGTATT	2	12	48621	48632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209395580
27	NC_011350	CGGGAG	2	12	51162	51173	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	209395617
28	NC_011350	AACACG	2	12	51313	51324	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209395573
29	NC_011350	TGGGGA	2	12	51580	51591	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	209395573
30	NC_011350	ATAGAT	2	12	58682	58693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209395631
31	NC_011350	GCAGAA	2	12	64073	64084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209395561
32	NC_011350	AAAGCA	2	12	66467	66478	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209395572
33	NC_011350	AAGGAC	2	12	67892	67903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209395572
34	NC_011350	GCACCT	2	12	76838	76849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209395571
35	NC_011350	GAAGAC	2	12	77119	77130	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209395571
36	NC_011350	GTTTTT	2	12	78214	78225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	209395569
37	NC_011350	CAAAGA	2	12	79501	79512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209395628
38	NC_011350	AAATAA	2	12	82142	82153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	209395545
39	NC_011350	GCGAAG	2	12	83038	83049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209395621
40	NC_011350	TTTTCC	2	12	84225	84236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209395608
41	NC_011350	ATGGAC	2	12	85395	85406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209395608
42	NC_011350	AGGGGG	2	12	85534	85545	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	209395608
43	NC_011350	ATAAGG	2	12	87041	87052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209395575
44	NC_011350	TAGAGG	2	12	88209	88220	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209395599

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.