MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	TGTTA	2	10	4665	4674	20 %	60 %	20 %	0 %	209395565
2	NC_011350	CAGGT	2	10	5008	5017	20 %	20 %	40 %	20 %	209395565
3	NC_011350	AGAAC	2	10	5716	5725	60 %	0 %	20 %	20 %	209395565
4	NC_011350	TCTCT	2	10	6093	6102	0 %	60 %	0 %	40 %	209395593
5	NC_011350	CAGAA	2	10	6480	6489	60 %	0 %	20 %	20 %	209395593
6	NC_011350	AATGG	2	10	7437	7446	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011350	CACAC	2	10	8938	8947	40 %	0 %	0 %	60 %	209395547
8	NC_011350	ACATA	2	10	9201	9210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011350	CAGCT	2	10	9317	9326	20 %	20 %	20 %	40 %	209395567
10	NC_011350	CAGCA	2	10	12425	12434	40 %	0 %	20 %	40 %	209395568
11	NC_011350	GGCGT	2	10	21799	21808	0 %	20 %	60 %	20 %	209395534
12	NC_011350	CGCGG	2	10	22603	22612	0 %	0 %	60 %	40 %	209395540
13	NC_011350	ACGGG	2	10	22655	22664	20 %	0 %	60 %	20 %	209395540
14	NC_011350	GCTGG	2	10	23301	23310	0 %	20 %	60 %	20 %	209395564
15	NC_011350	CCGCC	2	10	24974	24983	0 %	0 %	20 %	80 %	209395636
16	NC_011350	GGCAC	2	10	25444	25453	20 %	0 %	40 %	40 %	209395542
17	NC_011350	ACCGT	2	10	25734	25743	20 %	20 %	20 %	40 %	209395626
18	NC_011350	TGTAC	2	10	25969	25978	20 %	40 %	20 %	20 %	209395597
19	NC_011350	GGAAG	2	10	26645	26654	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011350	GGCGG	2	10	26835	26844	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011350	CCGGG	2	10	28057	28066	0 %	0 %	60 %	40 %	209395615
22	NC_011350	GGCGG	2	10	30140	30149	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011350	AAGTG	2	10	32197	32206	40 %	20 %	40 %	0 %	209395612
24	NC_011350	CCGCC	2	10	33461	33470	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_011350	ACTGA	2	10	33509	33518	40 %	20 %	20 %	20 %	209395620
26	NC_011350	TTACG	2	10	36425	36434	20 %	40 %	20 %	20 %	209395548
27	NC_011350	AAGGT	2	10	38120	38129	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011350	TCTAC	2	10	39917	39926	20 %	40 %	0 %	40 %	209395580
29	NC_011350	GACTT	2	10	40773	40782	20 %	40 %	20 %	20 %	209395580
30	NC_011350	ATCAG	2	10	41005	41014	40 %	20 %	20 %	20 %	209395580
31	NC_011350	AAACG	2	10	42749	42758	60 %	0 %	20 %	20 %	209395580
32	NC_011350	TGCAT	2	10	43675	43684	20 %	40 %	20 %	20 %	209395580
33	NC_011350	GAAAG	2	10	43831	43840	60 %	0 %	40 %	0 %	209395580
34	NC_011350	AAAAT	2	10	44523	44532	80 %	20 %	0 %	0 %	209395580
35	NC_011350	CATTC	2	10	44711	44720	20 %	40 %	0 %	40 %	209395580
36	NC_011350	AATTA	2	10	45271	45280	60 %	40 %	0 %	0 %	209395580
37	NC_011350	ATATT	2	10	46590	46599	40 %	60 %	0 %	0 %	209395580
38	NC_011350	GATGT	2	10	46683	46692	20 %	40 %	40 %	0 %	209395580
39	NC_011350	TTTAT	2	10	46915	46924	20 %	80 %	0 %	0 %	209395580
40	NC_011350	TAAAT	2	10	47356	47365	60 %	40 %	0 %	0 %	209395580
41	NC_011350	AGAAA	2	10	47368	47377	80 %	0 %	20 %	0 %	209395580
42	NC_011350	ATTGT	2	10	48242	48251	20 %	60 %	20 %	0 %	209395580
43	NC_011350	TGATT	2	10	48592	48601	20 %	60 %	20 %	0 %	209395580
44	NC_011350	CGCCC	2	10	50160	50169	0 %	0 %	20 %	80 %	209395617
45	NC_011350	ACCGG	2	10	50429	50438	20 %	0 %	40 %	40 %	209395617
46	NC_011350	ACCTG	2	10	51038	51047	20 %	20 %	20 %	40 %	209395617
47	NC_011350	CTGGT	2	10	51376	51385	0 %	40 %	40 %	20 %	209395573
48	NC_011350	GAACG	2	10	51827	51836	40 %	0 %	40 %	20 %	209395573
49	NC_011350	CCGGG	2	10	54536	54545	0 %	0 %	60 %	40 %	209395616
50	NC_011350	CCTGT	2	10	57305	57314	0 %	40 %	20 %	40 %	209395552
51	NC_011350	GCCCC	2	10	57461	57470	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_011350	GGGTT	2	10	57988	57997	0 %	40 %	60 %	0 %	209395544
53	NC_011350	GAAGA	2	10	60982	60991	60 %	0 %	40 %	0 %	209395537
54	NC_011350	GTCTT	2	10	65409	65418	0 %	60 %	20 %	20 %	209395572
55	NC_011350	AAAAC	2	10	66133	66142	80 %	0 %	0 %	20 %	209395572
56	NC_011350	ATGCG	2	10	67032	67041	20 %	20 %	40 %	20 %	209395572
57	NC_011350	TGGTA	2	10	72033	72042	20 %	40 %	40 %	0 %	209395585
58	NC_011350	GTTCC	2	10	73872	73881	0 %	40 %	20 %	40 %	209395618
59	NC_011350	GTTTT	2	10	78233	78242	0 %	80 %	20 %	0 %	209395569
60	NC_011350	GATGG	2	10	79980	79989	20 %	20 %	60 %	0 %	209395628
61	NC_011350	GCTGA	2	10	80333	80342	20 %	20 %	40 %	20 %	209395628
62	NC_011350	GTTTT	2	10	81560	81569	0 %	80 %	20 %	0 %	209395545
63	NC_011350	GTCAG	2	10	85372	85381	20 %	20 %	40 %	20 %	209395608
64	NC_011350	CCCTT	2	10	86303	86312	0 %	40 %	0 %	60 %	209395613
65	NC_011350	GAGGT	2	10	87805	87814	20 %	20 %	60 %	0 %	209395586
66	NC_011350	GAGGT	2	10	90260	90269	20 %	20 %	60 %	0 %	209395546
67	NC_011350	AGTGG	2	10	91220	91229	20 %	20 %	60 %	0 %	209395623
68	NC_011350	CGCTT	2	10	91547	91556	0 %	40 %	20 %	40 %	209395623
69	NC_011350	TTTCG	2	10	92223	92232	0 %	60 %	20 %	20 %	209395581
70	NC_011350	GGTTA	2	10	92248	92257	20 %	40 %	40 %	0 %	209395581

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.