MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	TTAT	2	8	179	186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011350	GAAA	2	8	448	455	75 %	0 %	25 %	0 %	209395592
3	NC_011350	GAAA	2	8	699	706	75 %	0 %	25 %	0 %	209395592
4	NC_011350	TAAA	2	8	720	727	75 %	25 %	0 %	0 %	209395598
5	NC_011350	TTCT	2	8	1413	1420	0 %	75 %	0 %	25 %	209395598
6	NC_011350	CTTT	2	8	1631	1638	0 %	75 %	0 %	25 %	209395598
7	NC_011350	GAGC	2	8	1661	1668	25 %	0 %	50 %	25 %	209395598
8	NC_011350	AATG	2	8	1958	1965	50 %	25 %	25 %	0 %	209395598
9	NC_011350	TGCT	2	8	2046	2053	0 %	50 %	25 %	25 %	209395598
10	NC_011350	AGAA	2	8	2341	2348	75 %	0 %	25 %	0 %	209395598
11	NC_011350	AACA	2	8	2480	2487	75 %	0 %	0 %	25 %	209395598
12	NC_011350	TATG	2	8	2674	2681	25 %	50 %	25 %	0 %	209395598
13	NC_011350	TTGC	2	8	3804	3811	0 %	50 %	25 %	25 %	209395565
14	NC_011350	TTGC	2	8	4461	4468	0 %	50 %	25 %	25 %	209395565
15	NC_011350	AATA	2	8	4775	4782	75 %	25 %	0 %	0 %	209395565
16	NC_011350	ATGG	2	8	4937	4944	25 %	25 %	50 %	0 %	209395565
17	NC_011350	TTCT	2	8	6346	6353	0 %	75 %	0 %	25 %	209395593
18	NC_011350	TAAA	2	8	6511	6518	75 %	25 %	0 %	0 %	209395593
19	NC_011350	AGGA	2	8	6580	6587	50 %	0 %	50 %	0 %	209395593
20	NC_011350	ATAC	2	8	6912	6919	50 %	25 %	0 %	25 %	209395593
21	NC_011350	GAAA	2	8	7191	7198	75 %	0 %	25 %	0 %	209395593
22	NC_011350	AAAC	2	8	7398	7405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011350	CATC	2	8	8147	8154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011350	CAAA	2	8	8308	8315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011350	AGTG	2	8	8563	8570	25 %	25 %	50 %	0 %	209395547
26	NC_011350	TGGA	2	8	8682	8689	25 %	25 %	50 %	0 %	209395547
27	NC_011350	GTGC	2	8	8723	8730	0 %	25 %	50 %	25 %	209395547
28	NC_011350	CGCC	2	8	8741	8748	0 %	0 %	25 %	75 %	209395547
29	NC_011350	CGGG	2	8	9109	9116	0 %	0 %	75 %	25 %	209395547
30	NC_011350	CACT	2	8	9373	9380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011350	GACT	2	8	9525	9532	25 %	25 %	25 %	25 %	209395582
32	NC_011350	GAAT	2	8	10151	10158	50 %	25 %	25 %	0 %	209395582
33	NC_011350	CCCA	2	8	10163	10170	25 %	0 %	0 %	75 %	209395582
34	NC_011350	ACTG	2	8	10524	10531	25 %	25 %	25 %	25 %	209395555
35	NC_011350	ACTT	2	8	10597	10604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011350	TCAT	2	8	10748	10755	25 %	50 %	0 %	25 %	209395557
37	NC_011350	CAGA	2	8	11080	11087	50 %	0 %	25 %	25 %	209395541
38	NC_011350	CTTC	2	8	11715	11722	0 %	50 %	0 %	50 %	209395535
39	NC_011350	GGCG	2	8	12078	12085	0 %	0 %	75 %	25 %	209395535
40	NC_011350	ATAC	2	8	12301	12308	50 %	25 %	0 %	25 %	209395568
41	NC_011350	CATA	2	8	12318	12325	50 %	25 %	0 %	25 %	209395568
42	NC_011350	TACA	2	8	12338	12345	50 %	25 %	0 %	25 %	209395568
43	NC_011350	CTCC	2	8	12398	12405	0 %	25 %	0 %	75 %	209395568
44	NC_011350	CCAC	2	8	13162	13169	25 %	0 %	0 %	75 %	209395601
45	NC_011350	ATAC	2	8	13342	13349	50 %	25 %	0 %	25 %	209395601
46	NC_011350	GTAA	2	8	13529	13536	50 %	25 %	25 %	0 %	209395601
47	NC_011350	CCAC	2	8	13543	13550	25 %	0 %	0 %	75 %	209395601
48	NC_011350	AGTG	2	8	14789	14796	25 %	25 %	50 %	0 %	209395611
49	NC_011350	CAGC	2	8	15041	15048	25 %	0 %	25 %	50 %	209395611
50	NC_011350	AGGA	2	8	15104	15111	50 %	0 %	50 %	0 %	209395611
51	NC_011350	GCTG	2	8	15503	15510	0 %	25 %	50 %	25 %	209395589
52	NC_011350	CCAC	2	8	16258	16265	25 %	0 %	0 %	75 %	209395591
53	NC_011350	GATG	2	8	16465	16472	25 %	25 %	50 %	0 %	209395591
54	NC_011350	GACG	2	8	16479	16486	25 %	0 %	50 %	25 %	209395591
55	NC_011350	GTAA	2	8	16625	16632	50 %	25 %	25 %	0 %	209395591
56	NC_011350	CCAC	2	8	16639	16646	25 %	0 %	0 %	75 %	209395591
57	NC_011350	TTCC	2	8	16804	16811	0 %	50 %	0 %	50 %	209395591
58	NC_011350	ATCA	2	8	17458	17465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011350	GGCA	2	8	17687	17694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011350	GAAG	2	8	17712	17719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011350	TCCA	2	8	17802	17809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011350	TTCC	2	8	18159	18166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011350	TCGC	2	8	18574	18581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011350	TGGA	2	8	19722	19729	25 %	25 %	50 %	0 %	209395633
65	NC_011350	ACTG	2	8	20239	20246	25 %	25 %	25 %	25 %	209395635
66	NC_011350	GAAT	2	8	20464	20471	50 %	25 %	25 %	0 %	209395635
67	NC_011350	GCTG	2	8	20491	20498	0 %	25 %	50 %	25 %	209395635
68	NC_011350	GTAT	2	8	21613	21620	25 %	50 %	25 %	0 %	209395534
69	NC_011350	GCTG	2	8	21838	21845	0 %	25 %	50 %	25 %	209395534
70	NC_011350	TTCA	2	8	22251	22258	25 %	50 %	0 %	25 %	209395534
71	NC_011350	TGGC	2	8	22373	22380	0 %	25 %	50 %	25 %	209395534
72	NC_011350	CGGG	2	8	22531	22538	0 %	0 %	75 %	25 %	209395540
73	NC_011350	CCGG	2	8	22645	22652	0 %	0 %	50 %	50 %	209395540
74	NC_011350	TGCG	2	8	22927	22934	0 %	25 %	50 %	25 %	209395564
75	NC_011350	GCAG	2	8	23416	23423	25 %	0 %	50 %	25 %	209395564
76	NC_011350	GCGG	2	8	24271	24278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011350	CAGT	2	8	24559	24566	25 %	25 %	25 %	25 %	209395636
78	NC_011350	GCGG	2	8	25220	25227	0 %	0 %	75 %	25 %	209395542
79	NC_011350	ACGG	2	8	25925	25932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011350	GGCA	2	8	26258	26265	25 %	0 %	50 %	25 %	209395597
81	NC_011350	TGCC	2	8	27058	27065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011350	ACTG	2	8	27127	27134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011350	ATTT	2	8	27359	27366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011350	GTCA	2	8	27398	27405	25 %	25 %	25 %	25 %	209395533
85	NC_011350	CGCT	2	8	28115	28122	0 %	25 %	25 %	50 %	209395615
86	NC_011350	CCCG	2	8	28227	28234	0 %	0 %	25 %	75 %	209395615
87	NC_011350	GCCA	2	8	28987	28994	25 %	0 %	25 %	50 %	209395615
88	NC_011350	CAGT	2	8	29269	29276	25 %	25 %	25 %	25 %	209395595
89	NC_011350	GTCT	2	8	29702	29709	0 %	50 %	25 %	25 %	209395595
90	NC_011350	CTGT	2	8	30091	30098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011350	TGCC	2	8	30352	30359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011350	CAGA	2	8	30835	30842	50 %	0 %	25 %	25 %	209395627
93	NC_011350	GACT	2	8	31137	31144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011350	ACTA	2	8	31483	31490	50 %	25 %	0 %	25 %	209395612
95	NC_011350	GAAC	2	8	32500	32507	50 %	0 %	25 %	25 %	209395612
96	NC_011350	TCTG	2	8	32868	32875	0 %	50 %	25 %	25 %	209395612
97	NC_011350	GAAG	2	8	32965	32972	50 %	0 %	50 %	0 %	209395612
98	NC_011350	GGAT	2	8	33028	33035	25 %	25 %	50 %	0 %	209395612
99	NC_011350	TCAG	2	8	33066	33073	25 %	25 %	25 %	25 %	209395612
100	NC_011350	CTGG	2	8	33375	33382	0 %	25 %	50 %	25 %	209395612
101	NC_011350	GAGG	2	8	34332	34339	25 %	0 %	75 %	0 %	209395549
102	NC_011350	GGCG	2	8	35095	35102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011350	GTTC	2	8	35418	35425	0 %	50 %	25 %	25 %	209395548
104	NC_011350	TCAG	2	8	35496	35503	25 %	25 %	25 %	25 %	209395548
105	NC_011350	CCGG	2	8	35551	35558	0 %	0 %	50 %	50 %	209395548
106	NC_011350	ATGG	2	8	35692	35699	25 %	25 %	50 %	0 %	209395548
107	NC_011350	TTGA	2	8	36020	36027	25 %	50 %	25 %	0 %	209395548
108	NC_011350	CGGG	2	8	36039	36046	0 %	0 %	75 %	25 %	209395548
109	NC_011350	GCAG	2	8	36208	36215	25 %	0 %	50 %	25 %	209395548
110	NC_011350	GAAG	2	8	36583	36590	50 %	0 %	50 %	0 %	209395548
111	NC_011350	GTGG	2	8	36643	36650	0 %	25 %	75 %	0 %	209395548
112	NC_011350	TAAG	2	8	38108	38115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011350	TATC	2	8	38326	38333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011350	CGTA	2	8	38457	38464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011350	GGCT	2	8	38542	38549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011350	CATC	2	8	38666	38673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011350	GAAC	2	8	38944	38951	50 %	0 %	25 %	25 %	209395603
118	NC_011350	GTAA	2	8	39794	39801	50 %	25 %	25 %	0 %	209395580
119	NC_011350	TAAT	2	8	40074	40081	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
120	NC_011350	TACC	2	8	40423	40430	25 %	25 %	0 %	50 %	209395580
121	NC_011350	ATGA	2	8	40550	40557	50 %	25 %	25 %	0 %	209395580
122	NC_011350	TAAC	2	8	40785	40792	50 %	25 %	0 %	25 %	209395580
123	NC_011350	GTTT	2	8	41583	41590	0 %	75 %	25 %	0 %	209395580
124	NC_011350	AGTG	2	8	41806	41813	25 %	25 %	50 %	0 %	209395580
125	NC_011350	ATAA	2	8	41873	41880	75 %	25 %	0 %	0 %	209395580
126	NC_011350	CTAC	2	8	41921	41928	25 %	25 %	0 %	50 %	209395580
127	NC_011350	AATT	2	8	42205	42212	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
128	NC_011350	TTAT	2	8	42213	42220	25 %	75 %	0 %	0 %	209395580
129	NC_011350	CAAA	2	8	43937	43944	75 %	0 %	0 %	25 %	209395580
130	NC_011350	TTTA	2	8	44462	44469	25 %	75 %	0 %	0 %	209395580
131	NC_011350	AAAT	2	8	44544	44551	75 %	25 %	0 %	0 %	209395580
132	NC_011350	AGAA	2	8	44730	44737	75 %	0 %	25 %	0 %	209395580
133	NC_011350	ATGA	2	8	45044	45051	50 %	25 %	25 %	0 %	209395580
134	NC_011350	ATTT	2	8	45638	45645	25 %	75 %	0 %	0 %	209395580
135	NC_011350	TGAC	2	8	45726	45733	25 %	25 %	25 %	25 %	209395580
136	NC_011350	TGCA	2	8	45766	45773	25 %	25 %	25 %	25 %	209395580
137	NC_011350	AGGG	2	8	46197	46204	25 %	0 %	75 %	0 %	209395580
138	NC_011350	TGGT	2	8	46215	46222	0 %	50 %	50 %	0 %	209395580
139	NC_011350	CTAT	2	8	46619	46626	25 %	50 %	0 %	25 %	209395580
140	NC_011350	ACAG	2	8	46750	46757	50 %	0 %	25 %	25 %	209395580
141	NC_011350	CTGT	2	8	46799	46806	0 %	50 %	25 %	25 %	209395580
142	NC_011350	TAGT	2	8	48210	48217	25 %	50 %	25 %	0 %	209395580
143	NC_011350	AATA	2	8	48436	48443	75 %	25 %	0 %	0 %	209395580
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.