MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	TTAT	2	8	179	186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011350	AAAC	2	8	7398	7405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011350	CATC	2	8	8147	8154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011350	CAAA	2	8	8308	8315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011350	CACT	2	8	9373	9380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011350	ACTT	2	8	10597	10604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011350	ATCA	2	8	17458	17465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011350	GGCA	2	8	17687	17694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011350	GAAG	2	8	17712	17719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011350	TCCA	2	8	17802	17809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011350	TTCC	2	8	18159	18166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011350	TCGC	2	8	18574	18581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011350	GCGG	2	8	24271	24278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011350	ACGG	2	8	25925	25932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011350	TGCC	2	8	27058	27065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011350	ACTG	2	8	27127	27134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011350	ATTT	2	8	27359	27366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011350	CTGT	2	8	30091	30098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011350	TGCC	2	8	30352	30359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011350	GACT	2	8	31137	31144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011350	GGCG	2	8	35095	35102	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011350	TAAG	2	8	38108	38115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011350	TATC	2	8	38326	38333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011350	CGTA	2	8	38457	38464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011350	GGCT	2	8	38542	38549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011350	CATC	2	8	38666	38673	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011350	GATG	2	8	49133	49140	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011350	CCTC	2	8	53636	53643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011350	TCAT	2	8	54697	54704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011350	TAAT	2	8	54946	54953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011350	TGGC	2	8	55873	55880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011350	GCTC	2	8	56072	56079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011350	CCCT	2	8	57438	57445	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011350	ATCA	2	8	57722	57729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011350	CTGC	2	8	58795	58802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011350	CCTC	2	8	62673	62680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_011350	TGCC	2	8	68254	68261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011350	AATA	2	8	69083	69090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011350	AAAT	2	8	69508	69515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011350	GCTT	2	8	78373	78380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011350	AACA	2	8	89864	89871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011350	GCAG	2	8	94010	94017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011350	GTAA	2	8	94331	94338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011350	ATCA	2	8	94626	94633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.