MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	TAT	3	9	45	53	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011350	TGT	2	6	60	65	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011350	CTT	2	6	113	118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011350	AGG	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011350	AGG	2	6	3738	3743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011350	AAT	2	6	7367	7372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011350	TTA	2	6	7471	7476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011350	CAA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011350	TCT	2	6	7520	7525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011350	TTA	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011350	GTA	2	6	7770	7775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011350	GAT	2	6	7870	7875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011350	CTG	2	6	8252	8257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011350	AAT	2	6	8292	8297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011350	CAG	2	6	9190	9195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011350	ATA	2	6	9388	9393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011350	ATA	2	6	12693	12698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011350	ATT	2	6	15571	15576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011350	AGT	2	6	15608	15613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011350	ATG	2	6	15755	15760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011350	AGT	2	6	15783	15788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011350	CGC	2	6	15792	15797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011350	ATT	2	6	15932	15937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011350	TCT	2	6	15955	15960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011350	AGA	2	6	16029	16034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011350	GGC	2	6	17517	17522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011350	TGT	2	6	17628	17633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011350	CTT	2	6	17850	17855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011350	CCG	3	9	18051	18059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011350	CAG	2	6	18090	18095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011350	GCC	2	6	18134	18139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011350	GAC	2	6	18141	18146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011350	GAC	2	6	18183	18188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011350	GGT	2	6	18224	18229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011350	TCA	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011350	TGA	2	6	18424	18429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011350	TTA	2	6	18447	18452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011350	TCT	2	6	18512	18517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011350	TTC	2	6	18551	18556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011350	GCG	2	6	18601	18606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011350	ATA	2	6	18617	18622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011350	CTT	2	6	18642	18647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011350	TCG	2	6	21032	21037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011350	TCG	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011350	ATT	2	6	21086	21091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011350	GTC	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011350	CTG	2	6	21319	21324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011350	TGC	2	6	21330	21335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011350	CCT	2	6	21455	21460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011350	TCG	2	6	21475	21480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011350	TCC	3	9	21482	21490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011350	GAG	2	6	21578	21583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011350	CGC	2	6	24263	24268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011350	CGC	2	6	25143	25148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011350	GGC	2	6	25933	25938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011350	GCC	2	6	25942	25947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011350	GCC	2	6	26598	26603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011350	CGT	2	6	26670	26675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011350	TTC	3	9	26756	26764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011350	TCC	2	6	26781	26786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011350	TCT	2	6	26787	26792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011350	GCC	2	6	26986	26991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011350	CGT	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011350	GCG	2	6	27039	27044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011350	GCC	2	6	27813	27818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011350	GGC	2	6	27827	27832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011350	GGA	2	6	29844	29849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011350	CGC	2	6	29918	29923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011350	CTG	2	6	29945	29950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011350	TGA	2	6	29990	29995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011350	TGT	3	9	29996	30004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011350	TTC	2	6	30064	30069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011350	CTG	2	6	30076	30081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011350	TGT	2	6	30101	30106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011350	CGC	2	6	30242	30247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011350	GCC	2	6	30291	30296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011350	CGT	2	6	30337	30342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011350	GCG	2	6	30344	30349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011350	GTT	2	6	30361	30366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011350	ATT	2	6	31462	31467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011350	GCA	2	6	33483	33488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011350	ATG	2	6	34748	34753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011350	GGT	2	6	34791	34796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011350	ACA	2	6	34877	34882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011350	GAA	2	6	34917	34922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011350	GCT	2	6	35163	35168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011350	GAG	2	6	37245	37250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011350	GAG	2	6	37332	37337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011350	GAT	2	6	37467	37472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011350	TGA	2	6	37529	37534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011350	CAG	2	6	37651	37656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011350	CAA	2	6	37682	37687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011350	AGA	2	6	37766	37771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011350	AAT	2	6	38164	38169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011350	TGG	2	6	38262	38267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011350	ACA	2	6	38285	38290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011350	GAC	2	6	38397	38402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011350	AAT	2	6	38414	38419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011350	CAG	2	6	38523	38528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011350	TGT	2	6	38813	38818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011350	TAA	2	6	39303	39308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011350	CTA	2	6	39420	39425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011350	CAC	2	6	39434	39439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011350	ACA	2	6	39460	39465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011350	ATT	2	6	39499	39504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011350	CAG	2	6	49090	49095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011350	CTG	2	6	49278	49283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011350	CAG	2	6	49910	49915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011350	TTA	2	6	52075	52080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011350	ACA	2	6	52085	52090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011350	ATT	2	6	53716	53721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011350	ATA	2	6	53729	53734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011350	AAT	2	6	54017	54022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011350	TTA	2	6	54148	54153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011350	GTA	2	6	55503	55508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011350	GAG	2	6	55540	55545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011350	AGA	2	6	55832	55837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011350	CAA	2	6	56009	56014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011350	CTT	2	6	56061	56066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011350	CCT	2	6	56972	56977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011350	AAT	2	6	56981	56986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011350	CCG	2	6	57022	57027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011350	GCC	2	6	57205	57210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011350	ACT	2	6	57263	57268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011350	TGT	2	6	57510	57515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011350	CAT	3	9	57523	57531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011350	TCT	2	6	57541	57546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011350	TCG	2	6	57629	57634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011350	CGG	2	6	57751	57756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011350	ATT	2	6	57813	57818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011350	ATT	2	6	58488	58493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011350	AAT	2	6	58511	58516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011350	CCG	2	6	58817	58822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011350	AAG	2	6	60266	60271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011350	GCA	2	6	60289	60294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011350	GTA	2	6	60345	60350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011350	ACA	2	6	60404	60409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011350	TGA	2	6	62658	62663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011350	TCA	2	6	68517	68522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011350	CCA	2	6	68553	68558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011350	TCA	2	6	68625	68630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011350	TTC	2	6	68885	68890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011350	TAT	2	6	68970	68975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_011350	TGT	2	6	70339	70344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011350	ATT	2	6	70380	70385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.