MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 plasmid pO157

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011350	AT	3	6	42	47	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011350	GA	3	6	75	80	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011350	TA	3	6	147	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011350	CT	3	6	326	331	0 %	50 %	0 %	50 %	209395592
5	NC_011350	AT	3	6	399	404	50 %	50 %	0 %	0 %	209395592
6	NC_011350	TA	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	209395592
7	NC_011350	TC	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	209395598
8	NC_011350	AT	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
9	NC_011350	CT	3	6	2035	2040	0 %	50 %	0 %	50 %	209395598
10	NC_011350	AT	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
11	NC_011350	AT	3	6	2368	2373	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
12	NC_011350	TA	3	6	2657	2662	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
13	NC_011350	AT	3	6	2877	2882	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
14	NC_011350	TA	3	6	2960	2965	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
15	NC_011350	AG	3	6	3309	3314	50 %	0 %	50 %	0 %	209395598
16	NC_011350	GA	3	6	3471	3476	50 %	0 %	50 %	0 %	209395598
17	NC_011350	TA	3	6	3521	3526	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
18	NC_011350	TA	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	209395598
19	NC_011350	CA	3	6	3676	3681	50 %	0 %	0 %	50 %	209395598
20	NC_011350	CA	4	8	3867	3874	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
21	NC_011350	TA	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	209395565
22	NC_011350	TC	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	209395565
23	NC_011350	GA	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	209395565
24	NC_011350	GA	3	6	4966	4971	50 %	0 %	50 %	0 %	209395565
25	NC_011350	TA	3	6	5313	5318	50 %	50 %	0 %	0 %	209395565
26	NC_011350	CA	3	6	5740	5745	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
27	NC_011350	CA	3	6	5813	5818	50 %	0 %	0 %	50 %	209395565
28	NC_011350	CA	3	6	5961	5966	50 %	0 %	0 %	50 %	209395593
29	NC_011350	GA	3	6	5981	5986	50 %	0 %	50 %	0 %	209395593
30	NC_011350	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011350	AT	3	6	7564	7569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011350	AT	3	6	7696	7701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011350	AT	3	6	7829	7834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011350	TA	3	6	7953	7958	50 %	50 %	0 %	0 %	209395570
35	NC_011350	TA	3	6	9175	9180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011350	TA	3	6	9223	9228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011350	CT	3	6	9785	9790	0 %	50 %	0 %	50 %	209395582
38	NC_011350	CA	3	6	10083	10088	50 %	0 %	0 %	50 %	209395582
39	NC_011350	GT	3	6	10505	10510	0 %	50 %	50 %	0 %	209395555
40	NC_011350	TC	4	8	11462	11469	0 %	50 %	0 %	50 %	209395541
41	NC_011350	CG	3	6	11812	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
42	NC_011350	CG	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
43	NC_011350	CG	3	6	12091	12096	0 %	0 %	50 %	50 %	209395535
44	NC_011350	GC	3	6	12711	12716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011350	AT	3	6	12736	12741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011350	GC	3	6	13679	13684	0 %	0 %	50 %	50 %	209395601
47	NC_011350	TC	4	8	13783	13790	0 %	50 %	0 %	50 %	209395601
48	NC_011350	CA	3	6	14120	14125	50 %	0 %	0 %	50 %	209395583
49	NC_011350	AG	4	8	14343	14350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011350	CT	3	6	15021	15026	0 %	50 %	0 %	50 %	209395611
51	NC_011350	TA	3	6	15855	15860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011350	AC	3	6	15869	15874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011350	TC	4	8	16879	16886	0 %	50 %	0 %	50 %	209395591
54	NC_011350	CA	3	6	17417	17422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011350	TC	3	6	17529	17534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011350	TC	3	6	17981	17986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011350	GT	3	6	18472	18477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011350	GC	3	6	19507	19512	0 %	0 %	50 %	50 %	209395633
59	NC_011350	GC	3	6	20051	20056	0 %	0 %	50 %	50 %	209395635
60	NC_011350	TC	3	6	21004	21009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011350	GT	3	6	21437	21442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011350	AC	3	6	21846	21851	50 %	0 %	0 %	50 %	209395534
63	NC_011350	TG	3	6	22034	22039	0 %	50 %	50 %	0 %	209395534
64	NC_011350	TG	3	6	22051	22056	0 %	50 %	50 %	0 %	209395534
65	NC_011350	CA	3	6	23382	23387	50 %	0 %	0 %	50 %	209395564
66	NC_011350	TG	3	6	23434	23439	0 %	50 %	50 %	0 %	209395564
67	NC_011350	TG	3	6	23645	23650	0 %	50 %	50 %	0 %	209395625
68	NC_011350	GC	3	6	23978	23983	0 %	0 %	50 %	50 %	209395554
69	NC_011350	CA	3	6	24238	24243	50 %	0 %	0 %	50 %	209395554
70	NC_011350	TC	3	6	25543	25548	0 %	50 %	0 %	50 %	209395626
71	NC_011350	CG	3	6	26612	26617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011350	CA	3	6	27072	27077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011350	GT	3	6	27210	27215	0 %	50 %	50 %	0 %	209395630
74	NC_011350	CG	3	6	27916	27921	0 %	0 %	50 %	50 %	209395615
75	NC_011350	GA	3	6	28091	28096	50 %	0 %	50 %	0 %	209395615
76	NC_011350	GC	3	6	29299	29304	0 %	0 %	50 %	50 %	209395595
77	NC_011350	TG	3	6	29490	29495	0 %	50 %	50 %	0 %	209395595
78	NC_011350	CG	3	6	29882	29887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011350	GC	3	6	30905	30910	0 %	0 %	50 %	50 %	209395627
80	NC_011350	GA	3	6	31180	31185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011350	AG	3	6	31424	31429	50 %	0 %	50 %	0 %	209395632
82	NC_011350	CG	3	6	32107	32112	0 %	0 %	50 %	50 %	209395612
83	NC_011350	GT	4	8	32663	32670	0 %	50 %	50 %	0 %	209395612
84	NC_011350	TG	3	6	33384	33389	0 %	50 %	50 %	0 %	209395612
85	NC_011350	AC	3	6	33599	33604	50 %	0 %	0 %	50 %	209395620
86	NC_011350	TG	3	6	34809	34814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011350	CT	3	6	34944	34949	0 %	50 %	0 %	50 %	209395606
88	NC_011350	GT	4	8	34956	34963	0 %	50 %	50 %	0 %	209395606
89	NC_011350	GT	3	6	34969	34974	0 %	50 %	50 %	0 %	209395606
90	NC_011350	AT	3	6	35254	35259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011350	GT	3	6	35769	35774	0 %	50 %	50 %	0 %	209395548
92	NC_011350	AT	3	6	36240	36245	50 %	50 %	0 %	0 %	209395548
93	NC_011350	GC	4	8	36379	36386	0 %	0 %	50 %	50 %	209395548
94	NC_011350	TG	3	6	36875	36880	0 %	50 %	50 %	0 %	209395548
95	NC_011350	AT	3	6	37144	37149	50 %	50 %	0 %	0 %	209395548
96	NC_011350	AT	3	6	37340	37345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011350	AT	3	6	38228	38233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011350	AG	3	6	38863	38868	50 %	0 %	50 %	0 %	209395603
99	NC_011350	GA	3	6	39249	39254	50 %	0 %	50 %	0 %	209395603
100	NC_011350	TA	3	6	39454	39459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_011350	AT	3	6	40387	40392	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
103	NC_011350	GA	3	6	40912	40917	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
104	NC_011350	AT	3	6	41025	41030	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
105	NC_011350	AT	3	6	41640	41645	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
106	NC_011350	TA	3	6	42386	42391	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
107	NC_011350	AT	3	6	42520	42525	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
108	NC_011350	AG	3	6	42529	42534	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
109	NC_011350	TA	3	6	42553	42558	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
110	NC_011350	AT	3	6	42727	42732	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
111	NC_011350	AT	3	6	42810	42815	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
112	NC_011350	AT	3	6	43044	43049	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
113	NC_011350	TA	4	8	43351	43358	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
114	NC_011350	GA	3	6	43400	43405	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
115	NC_011350	AT	3	6	44384	44389	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
116	NC_011350	TA	3	6	44570	44575	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
117	NC_011350	TA	3	6	45150	45155	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
118	NC_011350	GT	3	6	45212	45217	0 %	50 %	50 %	0 %	209395580
119	NC_011350	CA	3	6	45349	45354	50 %	0 %	0 %	50 %	209395580
120	NC_011350	AT	4	8	45361	45368	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
121	NC_011350	GA	3	6	45652	45657	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
122	NC_011350	AG	3	6	45734	45739	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
123	NC_011350	TA	3	6	46495	46500	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
124	NC_011350	AT	5	10	46559	46568	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
125	NC_011350	AG	3	6	46652	46657	50 %	0 %	50 %	0 %	209395580
126	NC_011350	AT	3	6	47285	47290	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
127	NC_011350	AT	4	8	48000	48007	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
128	NC_011350	AT	3	6	48047	48052	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
129	NC_011350	AT	3	6	48655	48660	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
130	NC_011350	TA	3	6	48715	48720	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
131	NC_011350	AT	4	8	48855	48862	50 %	50 %	0 %	0 %	209395580
132	NC_011350	TC	3	6	48980	48985	0 %	50 %	0 %	50 %	209395580
133	NC_011350	CA	3	6	49252	49257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011350	TG	3	6	49341	49346	0 %	50 %	50 %	0 %	209395637
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136	NC_011350	CA	3	6	49688	49693	50 %	0 %	0 %	50 %	209395637
137	NC_011350	GA	3	6	50749	50754	50 %	0 %	50 %	0 %	209395617
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139	NC_011350	GA	3	6	52527	52532	50 %	0 %	50 %	0 %	209395578
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141	NC_011350	AG	3	6	52747	52752	50 %	0 %	50 %	0 %	209395578
142	NC_011350	GA	3	6	53118	53123	50 %	0 %	50 %	0 %	209395563
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145	NC_011350	GT	3	6	54155	54160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011350	AT	3	6	54227	54232	50 %	50 %	0 %	0 %	209395616
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.