MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori G27 plasmid pHPG27

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011334	CTTG	2	8	892	899	0 %	50 %	25 %	25 %	208435471
2	NC_011334	TGTT	2	8	1707	1714	0 %	75 %	25 %	0 %	208435471
3	NC_011334	CCTG	2	8	2349	2356	0 %	25 %	25 %	50 %	208435472
4	NC_011334	CATG	2	8	2655	2662	25 %	25 %	25 %	25 %	208435472
5	NC_011334	GAAA	2	8	2757	2764	75 %	0 %	25 %	0 %	208435472
6	NC_011334	ATGC	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	208435473
7	NC_011334	GAAA	2	8	2882	2889	75 %	0 %	25 %	0 %	208435473
8	NC_011334	ATCA	2	8	3062	3069	50 %	25 %	0 %	25 %	208435473
9	NC_011334	CTTG	2	8	3088	3095	0 %	50 %	25 %	25 %	208435473
10	NC_011334	GTTG	2	8	3626	3633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011334	TATG	2	8	3891	3898	25 %	50 %	25 %	0 %	208435474
12	NC_011334	AATG	2	8	4431	4438	50 %	25 %	25 %	0 %	208435474
13	NC_011334	CAAA	2	8	5275	5282	75 %	0 %	0 %	25 %	208435475
14	NC_011334	ATGA	2	8	5658	5665	50 %	25 %	25 %	0 %	208435475
15	NC_011334	TCAT	2	8	5742	5749	25 %	50 %	0 %	25 %	208435475
16	NC_011334	TAAC	2	8	5917	5924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011334	TTGG	2	8	6944	6951	0 %	50 %	50 %	0 %	208435477
18	NC_011334	TTAG	2	8	8033	8040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011334	TGAT	2	8	8668	8675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011334	AAGA	2	8	8831	8838	75 %	0 %	25 %	0 %	208435479
21	NC_011334	GAAT	2	8	9278	9285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011334	GTAG	2	8	9495	9502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011334	GTTG	2	8	9529	9536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.