MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori G27 plasmid pHPG27

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011334	A	6	6	578	583	100 %	0 %	0 %	0 %	208435471
2	NC_011334	A	6	6	1125	1130	100 %	0 %	0 %	0 %	208435471
3	NC_011334	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	208435471
4	NC_011334	A	6	6	2401	2406	100 %	0 %	0 %	0 %	208435472
5	NC_011334	A	6	6	2498	2503	100 %	0 %	0 %	0 %	208435472
6	NC_011334	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	208435472
7	NC_011334	A	6	6	2714	2719	100 %	0 %	0 %	0 %	208435472
8	NC_011334	A	6	6	2788	2793	100 %	0 %	0 %	0 %	208435472
9	NC_011334	A	7	7	3021	3027	100 %	0 %	0 %	0 %	208435473
10	NC_011334	A	6	6	3188	3193	100 %	0 %	0 %	0 %	208435473
11	NC_011334	T	6	6	3581	3586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011334	T	6	6	3613	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011334	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	208435474
14	NC_011334	A	6	6	4143	4148	100 %	0 %	0 %	0 %	208435474
15	NC_011334	T	7	7	4255	4261	0 %	100 %	0 %	0 %	208435474
16	NC_011334	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	208435474
17	NC_011334	A	7	7	4574	4580	100 %	0 %	0 %	0 %	208435474
18	NC_011334	A	6	6	5028	5033	100 %	0 %	0 %	0 %	208435475
19	NC_011334	T	6	6	5093	5098	0 %	100 %	0 %	0 %	208435475
20	NC_011334	A	7	7	5221	5227	100 %	0 %	0 %	0 %	208435475
21	NC_011334	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	208435475
22	NC_011334	A	6	6	5302	5307	100 %	0 %	0 %	0 %	208435475
23	NC_011334	T	7	7	5486	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	208435475
24	NC_011334	T	7	7	6061	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011334	T	6	6	6096	6101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011334	A	6	6	6158	6163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011334	T	6	6	6167	6172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011334	T	6	6	6917	6922	0 %	100 %	0 %	0 %	208435476
29	NC_011334	A	6	6	7559	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011334	T	6	6	8327	8332	0 %	100 %	0 %	0 %	208435478
31	NC_011334	T	7	7	8400	8406	0 %	100 %	0 %	0 %	208435478
32	NC_011334	T	8	8	8470	8477	0 %	100 %	0 %	0 %	208435478
33	NC_011334	T	7	7	8496	8502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011334	G	7	7	8527	8533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011334	G	6	6	8538	8543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011334	A	6	6	9000	9005	100 %	0 %	0 %	0 %	208435480
37	NC_011334	A	6	6	9024	9029	100 %	0 %	0 %	0 %	208435480
38	NC_011334	A	6	6	9044	9049	100 %	0 %	0 %	0 %	208435480
39	NC_011334	T	6	6	9455	9460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011334	T	6	6	9484	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011334	T	6	6	9516	9521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011334	A	6	6	9555	9560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011334	A	7	7	9593	9599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011334	A	6	6	9891	9896	100 %	0 %	0 %	0 %	208435481
45	NC_011334	T	6	6	9979	9984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011334	G	6	6	10019	10024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.