MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	AAACAC	2	12	18078	18089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011333	TTTCTT	2	12	22729	22740	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011333	CTTTTT	2	12	55101	55112	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011333	ATTTGC	2	12	57224	57235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011333	AGCCAA	2	12	65443	65454	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011333	CCAACA	2	12	67323	67334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011333	AGAAAA	2	12	69364	69375	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011333	ACAGAA	2	12	69721	69732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011333	AGCGGG	2	12	71522	71533	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011333	AATATT	2	12	86237	86248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011333	TACAAA	2	12	96518	96529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011333	GTTTTA	2	12	134363	134374	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011333	TATTTG	2	12	138037	138048	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011333	TTAAAA	2	12	142859	142870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011333	TTGTTT	2	12	155994	156005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011333	CTTGGG	2	12	156665	156676	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011333	TTGGGT	2	12	161440	161451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011333	TAAAAA	2	12	170522	170533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011333	TTCTTT	2	12	177583	177594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011333	CAAAAC	2	12	226091	226102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011333	ATTAAA	2	12	227598	227609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011333	TGTTTT	2	12	228834	228845	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011333	CCCTAA	2	12	228973	228984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011333	ATTTTA	2	12	250687	250698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011333	AAATTT	2	12	266369	266380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011333	AAAGCG	2	12	328777	328788	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011333	TGGCTA	2	12	347878	347889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011333	AGCAAG	2	12	349966	349977	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011333	TTATTT	2	12	382526	382537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011333	TTGAAT	2	12	401233	401244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011333	AAAATA	2	12	440678	440689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011333	TAAAAA	2	12	454775	454786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011333	TTTAAT	2	12	508303	508314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011333	TTGTAA	2	12	528095	528106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011333	CTTGAT	2	12	548126	548137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011333	TTTAAA	2	12	555001	555012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011333	CATTAC	2	12	566073	566084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011333	AGGCTT	2	12	581680	581691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011333	CTCAAT	2	12	646080	646091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011333	TAAAGA	2	12	678882	678893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011333	AAAAAT	2	12	703789	703800	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011333	GGTGCG	2	12	713317	713328	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011333	TTGCGC	2	12	713784	713795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011333	CTTTTT	2	12	717393	717404	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011333	TCCCGC	2	12	725424	725435	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011333	TATTGA	2	12	725496	725507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011333	CCCAAA	2	12	726478	726489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011333	CTTTAT	2	12	738023	738034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011333	AAATTA	2	12	740290	740301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011333	ATTTTT	2	12	895887	895898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011333	AAAGCG	2	12	915052	915063	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011333	TGAAAT	2	12	944033	944044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011333	ATTTTT	2	12	967042	967053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011333	TTAAAA	2	12	995425	995436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011333	CTAAGT	2	12	1014589	1014600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011333	TGATTG	2	12	1015537	1015548	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011333	ACTTAG	2	12	1024180	1024191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011333	CAAAAC	2	12	1024441	1024452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011333	TAAAAT	2	12	1057356	1057367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011333	CTAAAA	2	12	1085838	1085849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011333	ACAAAA	2	12	1159632	1159643	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011333	AATATC	2	12	1164021	1164032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011333	TTAACA	2	12	1165731	1165742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011333	TAGGGG	2	12	1206971	1206982	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011333	AAAAAT	2	12	1228567	1228578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011333	AAATCA	2	12	1234380	1234391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011333	ATTAAA	2	12	1234529	1234540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011333	ATCCTT	2	12	1247575	1247586	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011333	CTAGCG	2	12	1248553	1248564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011333	TTGTAT	2	12	1249996	1250007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011333	ACTTAA	2	12	1268373	1268384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011333	AAACTT	2	12	1290694	1290705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011333	TGTTAT	2	12	1300130	1300141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011333	AAAGAG	2	12	1305566	1305577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011333	TGCATT	2	12	1307947	1307958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011333	ATTTTT	2	12	1321918	1321929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011333	ATTTTA	2	12	1334432	1334443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011333	TTTAGG	2	12	1347982	1347993	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011333	AGTTTT	2	12	1438569	1438580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011333	TAAAAA	2	12	1440952	1440963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011333	AGCGGG	2	12	1449631	1449642	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011333	TTTGAT	2	12	1452004	1452015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011333	TAAAGA	2	12	1452936	1452947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011333	GTTTTA	2	12	1459728	1459739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011333	CTTTAG	2	12	1467012	1467023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011333	CTAAGT	2	12	1471586	1471597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011333	ACCAAA	2	12	1474501	1474512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011333	TGTTTA	2	12	1480441	1480452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011333	TTCTAA	2	12	1541131	1541142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011333	TGGCAA	2	12	1542476	1542487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011333	TTGATT	2	12	1562388	1562399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011333	AAACCC	2	12	1562589	1562600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011333	CAAAAT	2	12	1562770	1562781	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011333	TTTTTC	2	12	1562978	1562989	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011333	TTTGAC	2	12	1563467	1563478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011333	TATCAA	2	12	1595993	1596004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.