MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 1365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	TAAAA	2	10	1591	1600	80 %	20 %	0 %	0 %	208433979
2	NC_011333	GTTTT	2	10	1708	1717	0 %	80 %	20 %	0 %	208433980
3	NC_011333	TATTG	2	10	4132	4141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011333	TTTTA	2	10	4911	4920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011333	AAATT	2	10	7055	7064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011333	TTTCT	2	10	8156	8165	0 %	80 %	0 %	20 %	208433985
7	NC_011333	TCGCT	2	10	10876	10885	0 %	40 %	20 %	40 %	208433987
8	NC_011333	TGCCA	2	10	11630	11639	20 %	20 %	20 %	40 %	208433988
9	NC_011333	TGGTG	2	10	12522	12531	0 %	40 %	60 %	0 %	208433989
10	NC_011333	GCTTT	2	10	13350	13359	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011333	CAAAA	2	10	18393	18402	80 %	0 %	0 %	20 %	208433994
12	NC_011333	CCATG	2	10	23270	23279	20 %	20 %	20 %	40 %	208433998
13	NC_011333	CTCTT	2	10	23300	23309	0 %	60 %	0 %	40 %	208433998
14	NC_011333	CAAGC	2	10	28114	28123	40 %	0 %	20 %	40 %	208434000
15	NC_011333	GCTGG	2	10	28487	28496	0 %	20 %	60 %	20 %	208434000
16	NC_011333	TGATT	2	10	28570	28579	20 %	60 %	20 %	0 %	208434000
17	NC_011333	TTTTA	2	10	29040	29049	20 %	80 %	0 %	0 %	208434001
18	NC_011333	CTTGT	2	10	30609	30618	0 %	60 %	20 %	20 %	208434003
19	NC_011333	TCAAA	2	10	30827	30836	60 %	20 %	0 %	20 %	208434003
20	NC_011333	GTGGG	2	10	33906	33915	0 %	20 %	80 %	0 %	208434006
21	NC_011333	CAAAA	2	10	40653	40662	80 %	0 %	0 %	20 %	208434014
22	NC_011333	CAAAC	2	10	41576	41585	60 %	0 %	0 %	40 %	208434014
23	NC_011333	TTACT	2	10	43088	43097	20 %	60 %	0 %	20 %	208434016
24	NC_011333	CCCTA	2	10	44298	44307	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011333	TTTAT	2	10	44320	44329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011333	TTTCT	2	10	44799	44808	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011333	TTTAG	2	10	46169	46178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011333	TAAAA	2	10	46943	46952	80 %	20 %	0 %	0 %	208434017
29	NC_011333	TCCCA	2	10	47955	47964	20 %	20 %	0 %	60 %	208434018
30	NC_011333	GCTCC	2	10	48276	48285	0 %	20 %	20 %	60 %	208434018
31	NC_011333	AAAAT	2	10	48455	48464	80 %	20 %	0 %	0 %	208434018
32	NC_011333	TCGCA	2	10	48813	48822	20 %	20 %	20 %	40 %	208434018
33	NC_011333	AGGCT	2	10	50693	50702	20 %	20 %	40 %	20 %	208434020
34	NC_011333	GAGAT	2	10	51903	51912	40 %	20 %	40 %	0 %	208434021
35	NC_011333	TAAAA	2	10	53252	53261	80 %	20 %	0 %	0 %	208434022
36	NC_011333	GCTTT	2	10	53352	53361	0 %	60 %	20 %	20 %	208434022
37	NC_011333	GATAA	2	10	53604	53613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011333	CTTGA	2	10	53775	53784	20 %	40 %	20 %	20 %	208434023
39	NC_011333	AAATA	2	10	54596	54605	80 %	20 %	0 %	0 %	208434024
40	NC_011333	CCAAA	2	10	54929	54938	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011333	TAAAA	2	10	56979	56988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011333	ATCAA	2	10	57010	57019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011333	TGAAA	2	10	57743	57752	60 %	20 %	20 %	0 %	208434025
44	NC_011333	TCAAA	2	10	57997	58006	60 %	20 %	0 %	20 %	208434025
45	NC_011333	CAGCA	2	10	58944	58953	40 %	0 %	20 %	40 %	208434026
46	NC_011333	TCAAA	2	10	61752	61761	60 %	20 %	0 %	20 %	208434026
47	NC_011333	TTAAA	2	10	62776	62785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011333	TGTTT	2	10	64309	64318	0 %	80 %	20 %	0 %	208434029
49	NC_011333	TATCC	2	10	66068	66077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011333	TCAAT	2	10	74626	74635	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011333	TTTCT	2	10	75163	75172	0 %	80 %	0 %	20 %	208434036
52	NC_011333	CTTCT	2	10	75480	75489	0 %	60 %	0 %	40 %	208434036
53	NC_011333	TGCCT	2	10	75557	75566	0 %	40 %	20 %	40 %	208434036
54	NC_011333	TCCAA	2	10	75969	75978	40 %	20 %	0 %	40 %	208434037
55	NC_011333	TTTTG	2	10	79260	79269	0 %	80 %	20 %	0 %	208434040
56	NC_011333	ACGCC	2	10	79566	79575	20 %	0 %	20 %	60 %	208434040
57	NC_011333	AAAGC	2	10	80332	80341	60 %	0 %	20 %	20 %	208434041
58	NC_011333	TTACA	2	10	81114	81123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011333	TTTTG	2	10	83918	83927	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011333	GATTT	2	10	83929	83938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011333	CCTCA	2	10	86294	86303	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011333	ATCTT	2	10	87392	87401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011333	TGGCT	2	10	87933	87942	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011333	ATGCC	2	10	88351	88360	20 %	20 %	20 %	40 %	208434046
65	NC_011333	TTGAT	2	10	89398	89407	20 %	60 %	20 %	0 %	208434048
66	NC_011333	GGCGT	2	10	91212	91221	0 %	20 %	60 %	20 %	208434050
67	NC_011333	TCAAT	2	10	93797	93806	40 %	40 %	0 %	20 %	208434051
68	NC_011333	AGATA	2	10	94426	94435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011333	TAAAA	2	10	94495	94504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011333	CTTTC	2	10	94779	94788	0 %	60 %	0 %	40 %	208434052
71	NC_011333	TGATT	2	10	97572	97581	20 %	60 %	20 %	0 %	208434055
72	NC_011333	TCTTT	2	10	97781	97790	0 %	80 %	0 %	20 %	208434055
73	NC_011333	GGCTT	2	10	98897	98906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011333	ACGAT	2	10	103901	103910	40 %	20 %	20 %	20 %	208434060
75	NC_011333	GAATT	2	10	105742	105751	40 %	40 %	20 %	0 %	208434061
76	NC_011333	TCGTT	2	10	107643	107652	0 %	60 %	20 %	20 %	208434062
77	NC_011333	AAAAT	2	10	110242	110251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011333	TTTTA	2	10	110355	110364	20 %	80 %	0 %	0 %	208434065
79	NC_011333	TCTTT	2	10	110952	110961	0 %	80 %	0 %	20 %	208434065
80	NC_011333	AAAGC	2	10	113719	113728	60 %	0 %	20 %	20 %	208434067
81	NC_011333	CAAAT	2	10	116080	116089	60 %	20 %	0 %	20 %	208434070
82	NC_011333	ACCCT	2	10	117509	117518	20 %	20 %	0 %	60 %	208434071
83	NC_011333	ATGCC	2	10	117641	117650	20 %	20 %	20 %	40 %	208434071
84	NC_011333	ATTTA	2	10	119030	119039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011333	GATCT	2	10	119040	119049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011333	TGATT	2	10	119806	119815	20 %	60 %	20 %	0 %	208434073
87	NC_011333	AGCAG	2	10	120006	120015	40 %	0 %	40 %	20 %	208434074
88	NC_011333	ATCTT	2	10	120899	120908	20 %	60 %	0 %	20 %	208434075
89	NC_011333	AAGCC	2	10	126206	126215	40 %	0 %	20 %	40 %	208434078
90	NC_011333	TTGAT	2	10	128079	128088	20 %	60 %	20 %	0 %	208434079
91	NC_011333	AAATT	2	10	128459	128468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011333	TTTGA	2	10	129331	129340	20 %	60 %	20 %	0 %	208434080
93	NC_011333	GACTT	2	10	129865	129874	20 %	40 %	20 %	20 %	208434080
94	NC_011333	ATCTC	2	10	130616	130625	20 %	40 %	0 %	40 %	208434080
95	NC_011333	CGCTT	2	10	130774	130783	0 %	40 %	20 %	40 %	208434080
96	NC_011333	TGCGT	2	10	133163	133172	0 %	40 %	40 %	20 %	208434082
97	NC_011333	GAAAA	2	10	133324	133333	80 %	0 %	20 %	0 %	208434082
98	NC_011333	GAAAA	2	10	133642	133651	80 %	0 %	20 %	0 %	208434082
99	NC_011333	ATTTT	2	10	136604	136613	20 %	80 %	0 %	0 %	208434088
100	NC_011333	ATGTT	2	10	136686	136695	20 %	60 %	20 %	0 %	208434088
101	NC_011333	AAAAG	2	10	137098	137107	80 %	0 %	20 %	0 %	208434088
102	NC_011333	CAAAA	2	10	137815	137824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011333	AAATC	2	10	139134	139143	60 %	20 %	0 %	20 %	208434089
104	NC_011333	AAAAT	2	10	140606	140615	80 %	20 %	0 %	0 %	208434090
105	NC_011333	ATAAA	2	10	142382	142391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011333	TTTTC	2	10	143164	143173	0 %	80 %	0 %	20 %	208434092
107	NC_011333	GTAAA	2	10	143716	143725	60 %	20 %	20 %	0 %	208434093
108	NC_011333	TTCTT	2	10	145120	145129	0 %	80 %	0 %	20 %	208434094
109	NC_011333	TCTTT	2	10	145615	145624	0 %	80 %	0 %	20 %	208434095
110	NC_011333	TTTTG	2	10	146788	146797	0 %	80 %	20 %	0 %	208434096
111	NC_011333	GCGAT	2	10	147581	147590	20 %	20 %	40 %	20 %	208434096
112	NC_011333	GCTTG	2	10	147837	147846	0 %	40 %	40 %	20 %	208434096
113	NC_011333	GTCCA	2	10	148441	148450	20 %	20 %	20 %	40 %	208434097
114	NC_011333	TTTTG	2	10	148489	148498	0 %	80 %	20 %	0 %	208434097
115	NC_011333	CCAAA	2	10	150329	150338	60 %	0 %	0 %	40 %	208434098
116	NC_011333	ACGCC	2	10	153851	153860	20 %	0 %	20 %	60 %	208434100
117	NC_011333	TTATT	2	10	155747	155756	20 %	80 %	0 %	0 %	208434104
118	NC_011333	GCGTT	2	10	156114	156123	0 %	40 %	40 %	20 %	208434105
119	NC_011333	ATTTG	2	10	157089	157098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011333	CAAAT	2	10	158986	158995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011333	GGGGA	2	10	159810	159819	20 %	0 %	80 %	0 %	208434108
122	NC_011333	AGATT	2	10	161609	161618	40 %	40 %	20 %	0 %	208434110
123	NC_011333	AAGCC	2	10	162946	162955	40 %	0 %	20 %	40 %	208434113
124	NC_011333	GTTTT	2	10	164699	164708	0 %	80 %	20 %	0 %	208434114
125	NC_011333	ATTTT	2	10	164983	164992	20 %	80 %	0 %	0 %	208434115
126	NC_011333	GGGTG	2	10	165339	165348	0 %	20 %	80 %	0 %	208434115
127	NC_011333	AACAA	2	10	166251	166260	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011333	AATAA	2	10	166273	166282	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011333	ATTCA	2	10	166745	166754	40 %	40 %	0 %	20 %	208434116
130	NC_011333	CACTT	2	10	166949	166958	20 %	40 %	0 %	40 %	208434116
131	NC_011333	ATCTT	2	10	170147	170156	20 %	60 %	0 %	20 %	208434119
132	NC_011333	TAATT	2	10	174641	174650	40 %	60 %	0 %	0 %	208434125
133	NC_011333	CCGCA	2	10	178063	178072	20 %	0 %	20 %	60 %	208434128
134	NC_011333	ATTTG	2	10	179550	179559	20 %	60 %	20 %	0 %	208434129
135	NC_011333	AATTG	2	10	179706	179715	40 %	40 %	20 %	0 %	208434130
136	NC_011333	AAATC	2	10	179789	179798	60 %	20 %	0 %	20 %	208434130
137	NC_011333	AAATC	2	10	180811	180820	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011333	AAATG	2	10	181212	181221	60 %	20 %	20 %	0 %	208434131
139	NC_011333	TGTAA	2	10	182001	182010	40 %	40 %	20 %	0 %	208434132
140	NC_011333	AGCTT	2	10	183039	183048	20 %	40 %	20 %	20 %	208434133
141	NC_011333	ATAAA	2	10	183497	183506	80 %	20 %	0 %	0 %	208434133
142	NC_011333	TTTAA	2	10	183860	183869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011333	AAAAG	2	10	184653	184662	80 %	0 %	20 %	0 %	208434135
144	NC_011333	ACCCC	2	10	184718	184727	20 %	0 %	0 %	80 %	208434135
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147	NC_011333	CCTTA	2	10	188009	188018	20 %	40 %	0 %	40 %	208434138
148	NC_011333	GGTTG	2	10	189987	189996	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011333	AGAGG	2	10	190376	190385	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011333	ATTCA	2	10	192151	192160	40 %	40 %	0 %	20 %	208434141
151	NC_011333	AATCC	2	10	192828	192837	40 %	20 %	0 %	40 %	208434141
152	NC_011333	TTCAA	2	10	196982	196991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_011333	TATTG	2	10	197436	197445	20 %	60 %	20 %	0 %	208434145
154	NC_011333	TCATT	2	10	197767	197776	20 %	60 %	0 %	20 %	208434145
155	NC_011333	CTATT	2	10	198656	198665	20 %	60 %	0 %	20 %	208434147
156	NC_011333	TTTTC	2	10	199716	199725	0 %	80 %	0 %	20 %	208434148
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159	NC_011333	TTTCA	2	10	204133	204142	20 %	60 %	0 %	20 %	208434153
160	NC_011333	TGAAT	2	10	207123	207132	40 %	40 %	20 %	0 %	208434155
161	NC_011333	ATTTA	2	10	208393	208402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011333	AAACA	2	10	208415	208424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_011333	TGGGG	2	10	211151	211160	0 %	20 %	80 %	0 %	208434158
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169	NC_011333	CCACC	2	10	219920	219929	20 %	0 %	0 %	80 %	208434163
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173	NC_011333	GGTTC	2	10	224693	224702	0 %	40 %	40 %	20 %	208434169
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176	NC_011333	TGGGG	2	10	226447	226456	0 %	20 %	80 %	0 %	208434171
177	NC_011333	GATTG	2	10	226566	226575	20 %	40 %	40 %	0 %	208434171
178	NC_011333	TGAAA	2	10	226948	226957	60 %	20 %	20 %	0 %	208434171
179	NC_011333	ATTTT	2	10	228899	228908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011333	ATTGT	2	10	231461	231470	20 %	60 %	20 %	0 %	208434174
181	NC_011333	CTTAA	2	10	232288	232297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_011333	GGCGT	2	10	232557	232566	0 %	20 %	60 %	20 %	208434175
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187	NC_011333	CTAAC	2	10	240039	240048	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
188	NC_011333	CAAAA	2	10	241376	241385	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_011333	ATAAA	2	10	246906	246915	80 %	20 %	0 %	0 %	208434188
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195	NC_011333	AAATT	2	10	250727	250736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_011333	TTTTG	2	10	253556	253565	0 %	80 %	20 %	0 %	208434196
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205	NC_011333	AAAAG	2	10	261417	261426	80 %	0 %	20 %	0 %	208434202
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214	NC_011333	ATTTT	2	10	276507	276516	20 %	80 %	0 %	0 %	208434217
215	NC_011333	ATAGG	2	10	278041	278050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
216	NC_011333	GTCAT	2	10	280532	280541	20 %	40 %	20 %	20 %	208434223
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239	NC_011333	TTTAA	2	10	308217	308226	40 %	60 %	0 %	0 %	208434241
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249	NC_011333	TTTAT	2	10	323766	323775	20 %	80 %	0 %	0 %	208434257
250	NC_011333	CAATA	2	10	324124	324133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_011333	TGCGT	2	10	324614	324623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_011333	TGTGC	2	10	325406	325415	0 %	40 %	40 %	20 %	208434258
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254	NC_011333	AAGGA	2	10	327149	327158	60 %	0 %	40 %	0 %	208434260
255	NC_011333	TTATA	2	10	327711	327720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_011333	ATTAA	2	10	328632	328641	60 %	40 %	0 %	0 %	208434263
257	NC_011333	ATAAG	2	10	328715	328724	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_011333	CAAAA	2	10	328926	328935	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_011333	GCGTA	2	10	333947	333956	20 %	20 %	40 %	20 %	208434266
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261	NC_011333	GTTTT	2	10	335017	335026	0 %	80 %	20 %	0 %	208434269
262	NC_011333	TTATT	2	10	336423	336432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011333	ATCCA	2	10	338580	338589	40 %	20 %	0 %	40 %	208434272
264	NC_011333	GGGGT	2	10	339757	339766	0 %	20 %	80 %	0 %	208434274
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267	NC_011333	TGAAA	2	10	345421	345430	60 %	20 %	20 %	0 %	208434281
268	NC_011333	CGTGT	2	10	346425	346434	0 %	40 %	40 %	20 %	208434283
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403	NC_011333	GCATC	2	10	503310	503319	20 %	20 %	20 %	40 %	208434430
404	NC_011333	TACTA	2	10	505375	505384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
405	NC_011333	TTCAA	2	10	505496	505505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
406	NC_011333	GACCT	2	10	506259	506268	20 %	20 %	20 %	40 %	208434434
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498	NC_011333	AGCCA	2	10	611932	611941	40 %	0 %	20 %	40 %	208434528
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