MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 16771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	TGA	3	9	111	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433977
2	NC_011333	GTT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433977
3	NC_011333	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433977
4	NC_011333	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433977
5	NC_011333	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433978
6	NC_011333	TTA	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433978
7	NC_011333	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433978
8	NC_011333	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433978
9	NC_011333	CCG	4	12	1033	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433979
10	NC_011333	CCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433979
11	NC_011333	GCT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
12	NC_011333	GCT	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
13	NC_011333	GGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433979
14	NC_011333	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433979
15	NC_011333	CTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011333	TTC	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
17	NC_011333	GTT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433980
18	NC_011333	TTC	2	6	1974	1979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
19	NC_011333	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433980
20	NC_011333	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433980
21	NC_011333	TGA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433981
22	NC_011333	GTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
23	NC_011333	AGA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433981
24	NC_011333	GTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
25	NC_011333	GCC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433981
26	NC_011333	GCG	2	6	3541	3546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
27	NC_011333	GGT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433982
28	NC_011333	CTA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433982
29	NC_011333	ATT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433982
30	NC_011333	GGC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
31	NC_011333	GGT	2	6	4075	4080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011333	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011333	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011333	TGG	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011333	GTG	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011333	ACC	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011333	GGT	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011333	AAT	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433983
39	NC_011333	TTA	2	6	4809	4814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011333	TGT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011333	TAG	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
42	NC_011333	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
43	NC_011333	TGG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
44	NC_011333	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
45	NC_011333	TTG	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
46	NC_011333	TAA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433984
47	NC_011333	TTA	2	6	5698	5703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
48	NC_011333	GTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
49	NC_011333	CAA	2	6	5835	5840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433984
50	NC_011333	CAG	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433984
51	NC_011333	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
52	NC_011333	TAG	7	21	6389	6409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
53	NC_011333	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
54	NC_011333	CGT	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
55	NC_011333	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
56	NC_011333	GTT	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
57	NC_011333	GCT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
58	NC_011333	GTT	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
59	NC_011333	GGT	2	6	7192	7197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011333	GAT	2	6	7350	7355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011333	CAT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
62	NC_011333	GCC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
63	NC_011333	TCT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
64	NC_011333	AAT	2	6	7542	7547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433985
65	NC_011333	CTT	2	6	7550	7555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
66	NC_011333	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
67	NC_011333	ATG	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
68	NC_011333	TCA	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
69	NC_011333	CCG	2	6	7771	7776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
70	NC_011333	CTT	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
71	NC_011333	CCG	2	6	7799	7804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
72	NC_011333	CAT	2	6	7994	7999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
73	NC_011333	GTG	2	6	8026	8031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433985
74	NC_011333	TTC	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
75	NC_011333	CCG	2	6	8125	8130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
76	NC_011333	CAC	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433985
77	NC_011333	GAT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
78	NC_011333	GGA	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	208433985
79	NC_011333	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
80	NC_011333	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
81	NC_011333	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
82	NC_011333	GCA	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433985
83	NC_011333	CAT	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
84	NC_011333	TAA	4	12	9025	9036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011333	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
86	NC_011333	CTT	2	6	9230	9235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
87	NC_011333	GAT	3	9	9318	9326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433986
88	NC_011333	TCT	2	6	9346	9351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
89	NC_011333	CTA	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433986
90	NC_011333	TTA	2	6	9449	9454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011333	TAA	2	6	9509	9514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011333	ATT	2	6	9528	9533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011333	TTA	2	6	9554	9559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011333	AAG	2	6	9656	9661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011333	GAA	2	6	9668	9673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011333	TTG	2	6	9788	9793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
97	NC_011333	GAA	2	6	9804	9809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
98	NC_011333	TTA	2	6	9983	9988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
99	NC_011333	AGA	2	6	9998	10003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
100	NC_011333	ACC	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433987
101	NC_011333	AAG	2	6	10039	10044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
102	NC_011333	ATT	2	6	10072	10077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
103	NC_011333	CAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433987
104	NC_011333	GTG	2	6	10287	10292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433987
105	NC_011333	ATG	2	6	10567	10572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433987
106	NC_011333	AGG	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	208433987
107	NC_011333	AAC	2	6	10659	10664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433987
108	NC_011333	GAT	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433987
109	NC_011333	AGA	2	6	11045	11050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433987
110	NC_011333	TTG	2	6	11058	11063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
111	NC_011333	GAC	2	6	11145	11150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433987
112	NC_011333	TTA	3	9	11166	11174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433987
113	NC_011333	TTG	2	6	11223	11228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433987
114	NC_011333	TGT	2	6	11409	11414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
115	NC_011333	TGT	2	6	11577	11582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
116	NC_011333	AAG	2	6	11736	11741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
117	NC_011333	GGT	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433988
118	NC_011333	TTG	2	6	11913	11918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433988
119	NC_011333	TGG	3	9	12147	12155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433988
120	NC_011333	GAA	3	9	12164	12172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
121	NC_011333	AGA	2	6	12268	12273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433988
122	NC_011333	AGG	2	6	12491	12496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011333	TTA	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433989
124	NC_011333	GAA	2	6	12595	12600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433989
125	NC_011333	GTT	2	6	12662	12667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433989
126	NC_011333	ATT	2	6	12685	12690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433989
127	NC_011333	CGC	2	6	12837	12842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433989
128	NC_011333	CAA	2	6	12933	12938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433989
129	NC_011333	AAT	2	6	12967	12972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433989
130	NC_011333	ACC	2	6	13061	13066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433989
131	NC_011333	GGT	2	6	13203	13208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433989
132	NC_011333	TTG	2	6	13211	13216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433989
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