MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL43

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011316	AAT	2	6	284	289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538593
2	NC_011316	GCG	2	6	479	484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	215538593
3	NC_011316	ATC	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215538593
4	NC_011316	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538593
5	NC_011316	ATA	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538593
6	NC_011316	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215538593
7	NC_011316	TGA	2	6	604	609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538593
8	NC_011316	TAC	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215538593
9	NC_011316	TTA	2	6	710	715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538593
10	NC_011316	ATT	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538593
11	NC_011316	TGA	2	6	838	843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538593
12	NC_011316	AGT	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538593
13	NC_011316	AAT	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538594
14	NC_011316	AGG	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215538594
15	NC_011316	CAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215538594
16	NC_011316	TAA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538594
17	NC_011316	CCA	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215538594
18	NC_011316	ATA	2	6	1752	1757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538594
19	NC_011316	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538594
20	NC_011316	TTA	2	6	1855	1860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538594
21	NC_011316	AAG	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215538594
22	NC_011316	CCT	2	6	1884	1889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215538594
23	NC_011316	ATT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538594
24	NC_011316	TTG	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215538595
25	NC_011316	CAA	2	6	2437	2442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215538595
26	NC_011316	TGC	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215538595
27	NC_011316	CTG	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215538595
28	NC_011316	TTG	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215538595
29	NC_011316	TTA	2	6	2778	2783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538595
30	NC_011316	GAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215538595
31	NC_011316	TAA	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538595
32	NC_011316	TCG	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215538595
33	NC_011316	AAT	2	6	2899	2904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538595
34	NC_011316	CGA	2	6	2912	2917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215538595
35	NC_011316	ATT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215538595
36	NC_011316	AAC	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215538595
37	NC_011316	AGA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215538595
38	NC_011316	GAT	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538595
39	NC_011316	TAG	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538595
40	NC_011316	GAT	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215538595
41	NC_011316	TAC	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215538595
42	NC_011316	CGT	3	9	3136	3144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215538595
43	NC_011316	GTC	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215538595
44	NC_011316	GCA	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215538595
45	NC_011316	TAA	2	6	3364	3369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215538595

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.