MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL54

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011315	GGC	2	6	41	46	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011315	ACA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011315	CTA	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011315	AGT	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011315	AAG	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809833
6	NC_011315	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809833
7	NC_011315	CAC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209809833
8	NC_011315	ATG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809833
9	NC_011315	ACG	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809833
10	NC_011315	ACG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809833
11	NC_011315	GCT	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809833
12	NC_011315	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809833
13	NC_011315	TCT	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011315	TTA	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011315	AAT	2	6	1658	1663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809834
16	NC_011315	CAT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809834
17	NC_011315	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
18	NC_011315	ACG	2	6	1898	1903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809834
19	NC_011315	CTA	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809834
20	NC_011315	ATA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809834
21	NC_011315	TGT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809834
22	NC_011315	TTC	2	6	2197	2202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
23	NC_011315	CTT	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809834
24	NC_011315	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809834
25	NC_011315	TTA	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809834
26	NC_011315	CCA	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011315	TTC	2	6	2525	2530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011315	TGA	2	6	2632	2637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011315	CTT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011315	ATT	2	6	3134	3139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011315	GCA	2	6	3361	3366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011315	GGT	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809835
33	NC_011315	TGA	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
34	NC_011315	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
35	NC_011315	AAT	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
36	NC_011315	TAG	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
37	NC_011315	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
38	NC_011315	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
39	NC_011315	CAA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
40	NC_011315	TCT	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209809835
41	NC_011315	CAA	2	6	4012	4017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
42	NC_011315	ATG	3	9	4029	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
43	NC_011315	TTG	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
44	NC_011315	CAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209809835
45	NC_011315	TAA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
46	NC_011315	TGT	3	9	4298	4306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
47	NC_011315	GTT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
48	NC_011315	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209809835
49	NC_011315	ATG	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
50	NC_011315	ATG	3	9	4600	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835
51	NC_011315	CAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209809835
52	NC_011315	TTA	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
53	NC_011315	ATC	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809835
54	NC_011315	GCT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209809835
55	NC_011315	ATA	2	6	4930	4935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209809835
56	NC_011315	TGT	3	9	5021	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209809835
57	NC_011315	TAT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
58	NC_011315	CTA	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209809835
59	NC_011315	AGA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209809835
60	NC_011315	TTA	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209809835
61	NC_011315	TGA	3	9	5288	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209809835

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.