MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	GAAAA	2	10	908	917	80 %	0 %	20 %	0 %	209967946
2	NC_011314	GGTTA	2	10	1186	1195	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011314	CCTAA	2	10	2242	2251	40 %	20 %	0 %	40 %	209967948
4	NC_011314	CTTCA	2	10	2802	2811	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011314	GGCGA	2	10	13085	13094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011314	CATGC	2	10	13404	13413	20 %	20 %	20 %	40 %	209967962
7	NC_011314	CATTT	2	10	14032	14041	20 %	60 %	0 %	20 %	209967962
8	NC_011314	TAAAA	2	10	15812	15821	80 %	20 %	0 %	0 %	209967965
9	NC_011314	TAGCT	2	10	16737	16746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011314	AAATT	2	10	17224	17233	60 %	40 %	0 %	0 %	209967967
11	NC_011314	CGGTT	2	10	19800	19809	0 %	40 %	40 %	20 %	209967967
12	NC_011314	ATTAT	2	10	22864	22873	40 %	60 %	0 %	0 %	209967969
13	NC_011314	TAAGT	2	10	23210	23219	40 %	40 %	20 %	0 %	209967969
14	NC_011314	AACAA	2	10	23863	23872	80 %	0 %	0 %	20 %	209967969
15	NC_011314	ATGTG	2	10	25373	25382	20 %	40 %	40 %	0 %	209967971
16	NC_011314	AAGGC	2	10	27375	27384	40 %	0 %	40 %	20 %	209967973
17	NC_011314	CTGGA	2	10	28760	28769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011314	CCTTA	2	10	30756	30765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.