MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	CTA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011314	CTA	2	6	79	84	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011314	ACT	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
4	NC_011314	TCA	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
5	NC_011314	AGT	3	9	468	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967946
6	NC_011314	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
7	NC_011314	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
8	NC_011314	GAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967946
9	NC_011314	TTA	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
10	NC_011314	ATT	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
11	NC_011314	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
12	NC_011314	TCA	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967946
13	NC_011314	TTA	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967946
14	NC_011314	GTT	2	6	736	741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967946
15	NC_011314	AAT	2	6	864	869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967946
16	NC_011314	AAT	3	9	966	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967946
17	NC_011314	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967946
18	NC_011314	TAG	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011314	ACA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011314	ATT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011314	TCA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011314	GTA	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011314	ATG	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
24	NC_011314	CAT	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967947
25	NC_011314	ATG	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
26	NC_011314	ATG	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967947
27	NC_011314	GGC	2	6	1796	1801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967947
28	NC_011314	GGA	2	6	2125	2130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209967948
29	NC_011314	ATC	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967948
30	NC_011314	AGG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209967948
31	NC_011314	AAC	2	6	2480	2485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967949
32	NC_011314	TTC	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967949
33	NC_011314	AAG	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967949
34	NC_011314	CAT	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967949
35	NC_011314	AAC	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011314	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011314	CTT	2	6	3106	3111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967950
38	NC_011314	GTC	2	6	3167	3172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967950
39	NC_011314	AAC	2	6	3384	3389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
40	NC_011314	CAA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
41	NC_011314	ATC	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967950
42	NC_011314	TGT	2	6	3567	3572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967950
43	NC_011314	AAG	2	6	3581	3586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209967950
44	NC_011314	ACA	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967950
45	NC_011314	TAG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967950
46	NC_011314	CTG	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967951
47	NC_011314	CAC	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209967951
48	NC_011314	TAC	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967951
49	NC_011314	TGG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209967951
50	NC_011314	TAT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967951
51	NC_011314	CAA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967952
52	NC_011314	TTA	2	6	4380	4385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
53	NC_011314	ATT	2	6	4508	4513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
54	NC_011314	ATC	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967952
55	NC_011314	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967952
56	NC_011314	GGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967952
57	NC_011314	TGT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967952
58	NC_011314	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967952
59	NC_011314	TCT	2	6	4802	4807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967952
60	NC_011314	TGC	3	9	4830	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967952
61	NC_011314	TAT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
62	NC_011314	CTC	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209967952
63	NC_011314	ATA	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967952
64	NC_011314	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967952
65	NC_011314	AAT	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011314	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011314	AAT	2	6	5217	5222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967953
68	NC_011314	TCA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967953
69	NC_011314	GCA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967954
70	NC_011314	TAA	2	6	5499	5504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967954
71	NC_011314	CCA	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209967954
72	NC_011314	ATG	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967954
73	NC_011314	TCA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967954
74	NC_011314	ATA	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967954
75	NC_011314	ATG	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967954
76	NC_011314	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967954
77	NC_011314	ATT	2	6	6127	6132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011314	GCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011314	TAA	2	6	6202	6207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011314	AAT	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011314	ACG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011314	CAT	2	6	6426	6431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967955
83	NC_011314	TTC	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967955
84	NC_011314	GCT	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967955
85	NC_011314	TTG	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967955
86	NC_011314	ATA	2	6	6632	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967955
87	NC_011314	ATT	2	6	6701	6706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967955
88	NC_011314	ATC	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011314	GTT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011314	GAT	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011314	GTT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011314	TCT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011314	ATT	2	6	7220	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011314	AAC	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011314	ATT	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011314	CAG	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967956
97	NC_011314	ATT	2	6	7553	7558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967956
98	NC_011314	CTT	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967956
99	NC_011314	AAT	2	6	7661	7666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967956
100	NC_011314	CTT	2	6	7759	7764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967956
101	NC_011314	TCT	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967956
102	NC_011314	CCA	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209967956
103	NC_011314	GTC	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209967956
104	NC_011314	ATT	2	6	8012	8017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209967956
105	NC_011314	TTC	2	6	8075	8080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967956
106	NC_011314	GGC	2	6	8109	8114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209967956
107	NC_011314	GCA	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967956
108	NC_011314	ACG	2	6	8144	8149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967956
109	NC_011314	CTT	2	6	8183	8188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209967956
110	NC_011314	TCA	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967956
111	NC_011314	CAA	2	6	8203	8208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967956
112	NC_011314	CAT	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967956
113	NC_011314	TCA	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967956
114	NC_011314	CAA	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011314	GTA	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011314	TAT	2	6	8697	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011314	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011314	TAT	3	9	8715	8723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011314	AAT	2	6	8780	8785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967957
120	NC_011314	ATC	2	6	8792	8797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967957
121	NC_011314	ATC	2	6	8897	8902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967957
122	NC_011314	AAT	2	6	8930	8935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967957
123	NC_011314	TAA	2	6	9085	9090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967957
124	NC_011314	CAG	2	6	9100	9105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209967957
125	NC_011314	TAC	2	6	9134	9139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967957
126	NC_011314	ATC	2	6	9152	9157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209967957
127	NC_011314	ATA	2	6	9214	9219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209967957
128	NC_011314	TTG	2	6	9352	9357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209967957
129	NC_011314	ATT	2	6	9401	9406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011314	ATC	2	6	9475	9480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011314	ATC	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011314	CAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209967958
133	NC_011314	ATC	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011314	ATA	2	6	9840	9845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011314	TGC	2	6	10012	10017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011314	TGA	2	6	10219	10224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209967959
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138	NC_011314	TCT	2	6	10473	10478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011314	TAA	2	6	10493	10498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_011314	TAA	2	6	11355	11360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011314	TTG	2	6	11410	11415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011314	ATT	2	6	11467	11472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011314	ATA	2	6	11505	11510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_011314	CTT	2	6	20383	20388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_011314	TTC	2	6	29945	29950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_011314	TTG	2	6	29971	29976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
391	NC_011314	GAA	2	6	30035	30040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
392	NC_011314	TAA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_011314	TCG	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_011314	AAT	2	6	30131	30136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_011314	CGA	2	6	30144	30149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_011314	ATT	2	6	30237	30242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_011314	AAC	2	6	30259	30264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_011314	GAT	2	6	30292	30297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
400	NC_011314	TAG	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_011314	GAT	2	6	30337	30342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
402	NC_011314	TAC	2	6	30347	30352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_011314	CGT	3	9	30368	30376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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405	NC_011314	GCA	2	6	30590	30595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_011314	TAA	2	6	30596	30601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.