MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	T	8	8	316	323	0 %	100 %	0 %	0 %	209967945
2	NC_011314	A	7	7	647	653	100 %	0 %	0 %	0 %	209967946
3	NC_011314	T	7	7	894	900	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
4	NC_011314	T	8	8	1120	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
5	NC_011314	A	6	6	1671	1676	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
6	NC_011314	A	6	6	1912	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
7	NC_011314	T	6	6	2171	2176	0 %	100 %	0 %	0 %	209967948
8	NC_011314	A	8	8	2226	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	209967948
9	NC_011314	T	6	6	2645	2650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011314	T	6	6	3523	3528	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
11	NC_011314	T	7	7	3654	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
12	NC_011314	A	7	7	4545	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
13	NC_011314	A	6	6	4938	4943	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
14	NC_011314	T	7	7	5155	5161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011314	T	6	6	5761	5766	0 %	100 %	0 %	0 %	209967954
16	NC_011314	A	7	7	6002	6008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011314	T	8	8	7296	7303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011314	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	209967956
19	NC_011314	T	6	6	8279	8284	0 %	100 %	0 %	0 %	209967956
20	NC_011314	A	7	7	8547	8553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011314	T	6	6	8578	8583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011314	A	6	6	8629	8634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011314	A	6	6	9197	9202	100 %	0 %	0 %	0 %	209967957
24	NC_011314	T	6	6	9394	9399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011314	T	6	6	9412	9417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011314	A	6	6	9668	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	209967958
27	NC_011314	T	6	6	9712	9717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011314	T	6	6	9933	9938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011314	A	6	6	9966	9971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011314	A	7	7	10207	10213	100 %	0 %	0 %	0 %	209967959
31	NC_011314	T	6	6	12391	12396	0 %	100 %	0 %	0 %	209967961
32	NC_011314	A	7	7	12725	12731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011314	T	6	6	12751	12756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011314	A	6	6	12927	12932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011314	A	6	6	13113	13118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011314	T	6	6	13352	13357	0 %	100 %	0 %	0 %	209967962
37	NC_011314	G	6	6	14415	14420	0 %	0 %	100 %	0 %	209967963
38	NC_011314	A	7	7	14521	14527	100 %	0 %	0 %	0 %	209967963
39	NC_011314	A	6	6	14538	14543	100 %	0 %	0 %	0 %	209967963
40	NC_011314	A	6	6	14686	14691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011314	A	7	7	14909	14915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011314	A	6	6	15640	15645	100 %	0 %	0 %	0 %	209967965
43	NC_011314	T	6	6	16324	16329	0 %	100 %	0 %	0 %	209967966
44	NC_011314	T	7	7	16518	16524	0 %	100 %	0 %	0 %	209967966
45	NC_011314	A	6	6	17120	17125	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
46	NC_011314	A	6	6	17400	17405	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
47	NC_011314	A	6	6	17650	17655	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
48	NC_011314	A	6	6	18001	18006	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
49	NC_011314	T	6	6	18307	18312	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
50	NC_011314	A	7	7	18489	18495	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
51	NC_011314	A	6	6	18662	18667	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
52	NC_011314	A	7	7	18733	18739	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
53	NC_011314	T	6	6	19094	19099	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
54	NC_011314	A	6	6	19360	19365	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
55	NC_011314	A	6	6	19420	19425	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
56	NC_011314	T	6	6	19524	19529	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
57	NC_011314	T	6	6	19621	19626	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
58	NC_011314	T	6	6	19994	19999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011314	A	6	6	20430	20435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011314	T	6	6	20885	20890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011314	A	6	6	20994	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011314	T	7	7	21019	21025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011314	A	6	6	21354	21359	100 %	0 %	0 %	0 %	209967968
64	NC_011314	T	6	6	22571	22576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011314	T	6	6	22700	22705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011314	G	12	12	22761	22772	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011314	A	6	6	22854	22859	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
68	NC_011314	T	6	6	22873	22878	0 %	100 %	0 %	0 %	209967969
69	NC_011314	A	6	6	23060	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
70	NC_011314	T	6	6	23094	23099	0 %	100 %	0 %	0 %	209967969
71	NC_011314	A	6	6	23657	23662	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
72	NC_011314	A	6	6	23892	23897	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
73	NC_011314	T	7	7	24412	24418	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
74	NC_011314	T	6	6	24751	24756	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
75	NC_011314	G	6	6	25326	25331	0 %	0 %	100 %	0 %	209967971
76	NC_011314	T	6	6	27213	27218	0 %	100 %	0 %	0 %	209967973
77	NC_011314	C	7	7	28641	28647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_011314	A	9	9	28865	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011314	T	7	7	29837	29843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011314	G	6	6	29908	29913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011314	T	6	6	30355	30360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011314	A	7	7	30689	30695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011314	T	6	6	30715	30720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.