MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	T	8	8	316	323	0 %	100 %	0 %	0 %	209967945
2	NC_011314	A	7	7	647	653	100 %	0 %	0 %	0 %	209967946
3	NC_011314	T	7	7	894	900	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
4	NC_011314	T	8	8	1120	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	209967946
5	NC_011314	A	6	6	1671	1676	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
6	NC_011314	A	6	6	1912	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	209967947
7	NC_011314	T	6	6	2171	2176	0 %	100 %	0 %	0 %	209967948
8	NC_011314	A	8	8	2226	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	209967948
9	NC_011314	T	6	6	3523	3528	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
10	NC_011314	T	7	7	3654	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	209967950
11	NC_011314	A	7	7	4545	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
12	NC_011314	A	6	6	4938	4943	100 %	0 %	0 %	0 %	209967952
13	NC_011314	T	6	6	5761	5766	0 %	100 %	0 %	0 %	209967954
14	NC_011314	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	209967956
15	NC_011314	T	6	6	8279	8284	0 %	100 %	0 %	0 %	209967956
16	NC_011314	A	6	6	9197	9202	100 %	0 %	0 %	0 %	209967957
17	NC_011314	A	6	6	9668	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	209967958
18	NC_011314	A	7	7	10207	10213	100 %	0 %	0 %	0 %	209967959
19	NC_011314	T	6	6	12391	12396	0 %	100 %	0 %	0 %	209967961
20	NC_011314	T	6	6	13352	13357	0 %	100 %	0 %	0 %	209967962
21	NC_011314	G	6	6	14415	14420	0 %	0 %	100 %	0 %	209967963
22	NC_011314	A	7	7	14521	14527	100 %	0 %	0 %	0 %	209967963
23	NC_011314	A	6	6	14538	14543	100 %	0 %	0 %	0 %	209967963
24	NC_011314	A	6	6	15640	15645	100 %	0 %	0 %	0 %	209967965
25	NC_011314	T	6	6	16324	16329	0 %	100 %	0 %	0 %	209967966
26	NC_011314	T	7	7	16518	16524	0 %	100 %	0 %	0 %	209967966
27	NC_011314	A	6	6	17120	17125	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
28	NC_011314	A	6	6	17400	17405	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
29	NC_011314	A	6	6	17650	17655	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
30	NC_011314	A	6	6	18001	18006	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
31	NC_011314	T	6	6	18307	18312	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
32	NC_011314	A	7	7	18489	18495	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
33	NC_011314	A	6	6	18662	18667	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
34	NC_011314	A	7	7	18733	18739	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
35	NC_011314	T	6	6	19094	19099	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
36	NC_011314	A	6	6	19360	19365	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
37	NC_011314	A	6	6	19420	19425	100 %	0 %	0 %	0 %	209967967
38	NC_011314	T	6	6	19524	19529	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
39	NC_011314	T	6	6	19621	19626	0 %	100 %	0 %	0 %	209967967
40	NC_011314	A	6	6	21354	21359	100 %	0 %	0 %	0 %	209967968
41	NC_011314	A	6	6	22854	22859	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
42	NC_011314	T	6	6	22873	22878	0 %	100 %	0 %	0 %	209967969
43	NC_011314	A	6	6	23060	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
44	NC_011314	T	6	6	23094	23099	0 %	100 %	0 %	0 %	209967969
45	NC_011314	A	6	6	23657	23662	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
46	NC_011314	A	6	6	23892	23897	100 %	0 %	0 %	0 %	209967969
47	NC_011314	T	7	7	24412	24418	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
48	NC_011314	T	6	6	24751	24756	0 %	100 %	0 %	0 %	209967970
49	NC_011314	G	6	6	25326	25331	0 %	0 %	100 %	0 %	209967971
50	NC_011314	T	6	6	27213	27218	0 %	100 %	0 %	0 %	209967973

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.