MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	AAAAAT	2	12	683	694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011313	AGGGAT	2	12	34416	34427	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011313	TTGCTT	2	12	38784	38795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011313	GATCCG	2	12	56511	56522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011313	TAATCA	2	12	56723	56734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011313	AAATTC	2	12	66289	66300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011313	AGGGAT	2	12	67670	67681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011313	TATTGG	3	18	117986	118003	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011313	TTATCT	2	12	151733	151744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011313	ATAATT	2	12	157432	157443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011313	CTTCAT	2	12	179405	179416	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011313	GTAACT	2	12	184324	184335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011313	ATTGAA	2	12	186066	186077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011313	ACGCAT	2	12	189388	189399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011313	TCTCAA	2	12	190970	190981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011313	TGATAA	2	12	212273	212284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011313	ACAAAA	2	12	213406	213417	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011313	TGACGC	2	12	220714	220725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011313	TTTAAA	2	12	225752	225763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011313	AGCAAA	2	12	230468	230479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011313	TTTTTG	2	12	300320	300331	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011313	CAATAA	2	12	308014	308025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011313	AAAGAA	2	12	318255	318266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011313	TTCTAG	2	12	321852	321863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011313	TAAGAA	2	12	328085	328096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011313	ATTTTT	2	12	342734	342745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011313	TATTTA	2	12	350688	350699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011313	GATATT	2	12	376090	376101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011313	TTTTGT	2	12	385285	385296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011313	AAATAT	2	12	398755	398766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011313	CTTTTT	2	12	428610	428621	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011313	TCTAAT	2	12	431289	431300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011313	ATTTTT	2	12	450908	450919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011313	ATGAGT	2	12	461177	461188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011313	AGGGAT	2	12	479736	479747	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011313	GTTGAG	2	12	503699	503710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011313	TCAATT	2	12	516912	516923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011313	AAATTA	2	12	525351	525362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011313	AGCTTG	2	12	552076	552087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011313	ATTTTG	2	12	552931	552942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011313	CTGATA	2	12	589701	589712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011313	ATTTTA	2	12	608977	608988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011313	TTACAA	2	12	616896	616907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011313	AGAATG	2	12	621011	621022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011313	ATTACG	2	12	683347	683358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011313	ATTACG	2	12	685359	685370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011313	ATCAAG	2	12	693005	693016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011313	TTCTTT	2	12	693131	693142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011313	CTTTAT	2	12	698315	698326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011313	CGAATA	2	12	705755	705766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011313	CTATCG	2	12	705983	705994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011313	TATTTT	2	12	777943	777954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011313	TTTCTT	2	12	778056	778067	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011313	TATTTT	2	12	813761	813772	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011313	AGAAAT	2	12	814108	814119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011313	TATCTA	2	12	822663	822674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011313	AACTAA	2	12	823018	823029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011313	TTATCC	2	12	823103	823114	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011313	CTTTTC	2	12	875882	875893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011313	TCTTGT	2	12	875896	875907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011313	CAAAAA	2	12	910947	910958	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011313	ATTTCA	2	12	915650	915661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011313	AGTGTC	2	12	919266	919277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011313	CAATAG	2	12	929464	929475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011313	TTTACT	2	12	933226	933237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011313	CTCTAT	6	36	937848	937883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011313	TTTTTA	2	12	946571	946582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011313	CAAATT	2	12	956952	956963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011313	AATTAA	2	12	963324	963335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011313	TCTTAA	2	12	978727	978738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011313	GTTATT	2	12	982833	982844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011313	GTGAAG	2	12	982915	982926	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011313	CTTTAA	2	12	1005298	1005309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011313	TGTATG	2	12	1010748	1010759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011313	CTCAAA	2	12	1011153	1011164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011313	AATTAT	2	12	1013209	1013220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011313	CTTTGC	3	18	1030630	1030647	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011313	CTTGAT	2	12	1032651	1032662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011313	CAGATT	2	12	1034637	1034648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011313	TACATA	2	12	1045627	1045638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011313	TATTAA	2	12	1074835	1074846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011313	AAAGTA	2	12	1096245	1096256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011313	AATGAA	2	12	1111957	1111968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011313	TTACTT	2	12	1131746	1131757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011313	CATGGG	2	12	1142497	1142508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011313	AGGGAT	2	12	1187873	1187884	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011313	TTGCTT	2	12	1192241	1192252	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.