MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	AAAAG	2	10	1107	1116	80 %	0 %	20 %	0 %	209808848
2	NC_011313	CTGGG	2	10	1638	1647	0 %	20 %	60 %	20 %	209808848
3	NC_011313	GAATT	2	10	1958	1967	40 %	40 %	20 %	0 %	209808848
4	NC_011313	GGTAG	2	10	3060	3069	20 %	20 %	60 %	0 %	209808848
5	NC_011313	GCCTA	2	10	8062	8071	20 %	20 %	20 %	40 %	209808851
6	NC_011313	ATTGA	2	10	10865	10874	40 %	40 %	20 %	0 %	209808852
7	NC_011313	GATTG	2	10	10987	10996	20 %	40 %	40 %	0 %	209808852
8	NC_011313	GCTTT	2	10	11997	12006	0 %	60 %	20 %	20 %	209808852
9	NC_011313	AGAAA	2	10	15066	15075	80 %	0 %	20 %	0 %	209808855
10	NC_011313	CTGAA	2	10	15596	15605	40 %	20 %	20 %	20 %	209808856
11	NC_011313	TCCAT	2	10	16080	16089	20 %	40 %	0 %	40 %	209808856
12	NC_011313	TTGCA	2	10	16286	16295	20 %	40 %	20 %	20 %	209808856
13	NC_011313	TCAAT	2	10	16759	16768	40 %	40 %	0 %	20 %	209808857
14	NC_011313	GTGCA	2	10	17549	17558	20 %	20 %	40 %	20 %	209808857
15	NC_011313	TTGAA	2	10	20198	20207	40 %	40 %	20 %	0 %	209808859
16	NC_011313	TAGTT	2	10	22611	22620	20 %	60 %	20 %	0 %	209808861
17	NC_011313	TAATT	2	10	27258	27267	40 %	60 %	0 %	0 %	209808861
18	NC_011313	TAATC	2	10	27462	27471	40 %	40 %	0 %	20 %	209808861
19	NC_011313	TTACT	2	10	28475	28484	20 %	60 %	0 %	20 %	209808861
20	NC_011313	AAGCA	2	10	31575	31584	60 %	0 %	20 %	20 %	209808862
21	NC_011313	GAGTC	2	10	33460	33469	20 %	20 %	40 %	20 %	209808863
22	NC_011313	TTTTA	2	10	33593	33602	20 %	80 %	0 %	0 %	209808863
23	NC_011313	CAATA	2	10	33854	33863	60 %	20 %	0 %	20 %	209808864
24	NC_011313	GGAAT	2	10	35477	35486	40 %	20 %	40 %	0 %	209808866
25	NC_011313	TGGAT	2	10	36530	36539	20 %	40 %	40 %	0 %	209808867
26	NC_011313	ACTGG	2	10	36553	36562	20 %	20 %	40 %	20 %	209808867
27	NC_011313	GCATT	2	10	36781	36790	20 %	40 %	20 %	20 %	209808867
28	NC_011313	GCATT	2	10	37001	37010	20 %	40 %	20 %	20 %	209808867
29	NC_011313	GGAAT	2	10	37113	37122	40 %	20 %	40 %	0 %	209808867
30	NC_011313	GAGTC	2	10	42492	42501	20 %	20 %	40 %	20 %	209808868
31	NC_011313	TTTTA	2	10	42625	42634	20 %	80 %	0 %	0 %	209808868
32	NC_011313	CAATA	2	10	42886	42895	60 %	20 %	0 %	20 %	209808869
33	NC_011313	TATTT	2	10	44773	44782	20 %	80 %	0 %	0 %	209808871
34	NC_011313	TGGCT	2	10	45309	45318	0 %	40 %	40 %	20 %	209808871
35	NC_011313	AAAAG	2	10	46852	46861	80 %	0 %	20 %	0 %	209808873
36	NC_011313	AATAA	2	10	46978	46987	80 %	20 %	0 %	0 %	209808873
37	NC_011313	TAATA	2	10	48979	48988	60 %	40 %	0 %	0 %	209808874
38	NC_011313	TGCAA	2	10	49634	49643	40 %	20 %	20 %	20 %	209808874
39	NC_011313	AAACA	2	10	50206	50215	80 %	0 %	0 %	20 %	209808874
40	NC_011313	GTAAC	2	10	51506	51515	40 %	20 %	20 %	20 %	209808875
41	NC_011313	TCGTC	2	10	53920	53929	0 %	40 %	20 %	40 %	209808876
42	NC_011313	TAGGC	2	10	58322	58331	20 %	20 %	40 %	20 %	209808877
43	NC_011313	TGATT	2	10	58428	58437	20 %	60 %	20 %	0 %	209808877
44	NC_011313	GAGTC	2	10	62250	62259	20 %	20 %	40 %	20 %	209808880
45	NC_011313	TTTTA	2	10	62383	62392	20 %	80 %	0 %	0 %	209808880
46	NC_011313	CAATA	2	10	62644	62653	60 %	20 %	0 %	20 %	209808881
47	NC_011313	CATGC	2	10	63929	63938	20 %	20 %	20 %	40 %	209808883
48	NC_011313	CGTTA	2	10	65643	65652	20 %	40 %	20 %	20 %	209808883
49	NC_011313	GCTGG	2	10	66820	66829	0 %	20 %	60 %	20 %	209808884
50	NC_011313	ACCAT	2	10	69235	69244	40 %	20 %	0 %	40 %	209808886
51	NC_011313	AGAAA	2	10	69876	69885	80 %	0 %	20 %	0 %	209808886
52	NC_011313	ATTCA	2	10	70821	70830	40 %	40 %	0 %	20 %	209808886
53	NC_011313	ATTTC	2	10	71098	71107	20 %	60 %	0 %	20 %	209808886
54	NC_011313	TAATT	2	10	71160	71169	40 %	60 %	0 %	0 %	209808886
55	NC_011313	AATTG	2	10	71278	71287	40 %	40 %	20 %	0 %	209808886
56	NC_011313	GATAA	2	10	73126	73135	60 %	20 %	20 %	0 %	209808887
57	NC_011313	TTCAC	2	10	74566	74575	20 %	40 %	0 %	40 %	209808887
58	NC_011313	CAAAT	2	10	75720	75729	60 %	20 %	0 %	20 %	209808887
59	NC_011313	TTGGT	2	10	79205	79214	0 %	60 %	40 %	0 %	209808889
60	NC_011313	ATATC	2	10	80275	80284	40 %	40 %	0 %	20 %	209808889
61	NC_011313	TCTCA	2	10	83609	83618	20 %	40 %	0 %	40 %	209808891
62	NC_011313	ATCGA	2	10	83919	83928	40 %	20 %	20 %	20 %	209808891
63	NC_011313	GAAAA	2	10	84249	84258	80 %	0 %	20 %	0 %	209808892
64	NC_011313	CAAAA	2	10	84515	84524	80 %	0 %	0 %	20 %	209808892
65	NC_011313	GGAAT	2	10	86235	86244	40 %	20 %	40 %	0 %	209808893
66	NC_011313	TTCAA	2	10	86651	86660	40 %	40 %	0 %	20 %	209808893
67	NC_011313	ACGGT	2	10	87298	87307	20 %	20 %	40 %	20 %	209808893
68	NC_011313	ACTCA	2	10	88352	88361	40 %	20 %	0 %	40 %	209808894
69	NC_011313	TTTAT	2	10	91992	92001	20 %	80 %	0 %	0 %	209808897
70	NC_011313	TTATT	2	10	93370	93379	20 %	80 %	0 %	0 %	209808898
71	NC_011313	GAAAA	2	10	93893	93902	80 %	0 %	20 %	0 %	209808899
72	NC_011313	GAGTC	2	10	96157	96166	20 %	20 %	40 %	20 %	209808902
73	NC_011313	TTTTA	2	10	96290	96299	20 %	80 %	0 %	0 %	209808902
74	NC_011313	CAATA	2	10	96551	96560	60 %	20 %	0 %	20 %	209808903
75	NC_011313	TTGAT	2	10	103454	103463	20 %	60 %	20 %	0 %	209808909
76	NC_011313	TGCAA	2	10	103686	103695	40 %	20 %	20 %	20 %	209808909
77	NC_011313	GAGTC	2	10	107220	107229	20 %	20 %	40 %	20 %	209808911
78	NC_011313	TTTTA	2	10	107353	107362	20 %	80 %	0 %	0 %	209808911
79	NC_011313	CAATA	2	10	107614	107623	60 %	20 %	0 %	20 %	209808912
80	NC_011313	TGTGC	2	10	108646	108655	0 %	40 %	40 %	20 %	209808913
81	NC_011313	TTTGC	2	10	108670	108679	0 %	60 %	20 %	20 %	209808913
82	NC_011313	AAACA	2	10	113466	113475	80 %	0 %	0 %	20 %	209808920
83	NC_011313	AAACT	2	10	115489	115498	60 %	20 %	0 %	20 %	209808922
84	NC_011313	TGGTT	2	10	117401	117410	0 %	60 %	40 %	0 %	209808923
85	NC_011313	GCCTA	2	10	119581	119590	20 %	20 %	20 %	40 %	209808926
86	NC_011313	ATAAA	2	10	120244	120253	80 %	20 %	0 %	0 %	209808927
87	NC_011313	GACTC	2	10	120378	120387	20 %	20 %	20 %	40 %	209808927
88	NC_011313	TAATA	2	10	123727	123736	60 %	40 %	0 %	0 %	209808929
89	NC_011313	GTTAC	2	10	126904	126913	20 %	40 %	20 %	20 %	209808931
90	NC_011313	GCAAC	2	10	135319	135328	40 %	0 %	20 %	40 %	209808936
91	NC_011313	TTTAC	2	10	135588	135597	20 %	60 %	0 %	20 %	209808936
92	NC_011313	GGGCA	2	10	138637	138646	20 %	0 %	60 %	20 %	209808938
93	NC_011313	GAATT	2	10	141723	141732	40 %	40 %	20 %	0 %	209808942
94	NC_011313	TAAAG	2	10	145052	145061	60 %	20 %	20 %	0 %	209808946
95	NC_011313	GAATC	2	10	146025	146034	40 %	20 %	20 %	20 %	209808947
96	NC_011313	GCTTA	2	10	146870	146879	20 %	40 %	20 %	20 %	209808949
97	NC_011313	TTTTA	2	10	147562	147571	20 %	80 %	0 %	0 %	209808949
98	NC_011313	CTTTG	2	10	148788	148797	0 %	60 %	20 %	20 %	209808951
99	NC_011313	CCTTG	2	10	148857	148866	0 %	40 %	20 %	40 %	209808951
100	NC_011313	CAATA	2	10	155487	155496	60 %	20 %	0 %	20 %	209808956
101	NC_011313	TCACT	2	10	160704	160713	20 %	40 %	0 %	40 %	209808961
102	NC_011313	ATTGT	2	10	161840	161849	20 %	60 %	20 %	0 %	209808963
103	NC_011313	GCGTA	2	10	162510	162519	20 %	20 %	40 %	20 %	209808964
104	NC_011313	CCAAT	2	10	163616	163625	40 %	20 %	0 %	40 %	209808966
105	NC_011313	GAAGG	2	10	163649	163658	40 %	0 %	60 %	0 %	209808966
106	NC_011313	TGAAA	2	10	164668	164677	60 %	20 %	20 %	0 %	209808966
107	NC_011313	AGATT	2	10	164690	164699	40 %	40 %	20 %	0 %	209808966
108	NC_011313	CAAAG	2	10	164710	164719	60 %	0 %	20 %	20 %	209808966
109	NC_011313	AAAAT	2	10	166018	166027	80 %	20 %	0 %	0 %	209808967
110	NC_011313	GTCAT	2	10	166341	166350	20 %	40 %	20 %	20 %	209808967
111	NC_011313	GTGTT	2	10	166378	166387	0 %	60 %	40 %	0 %	209808967
112	NC_011313	ATCAG	2	10	167408	167417	40 %	20 %	20 %	20 %	209808968
113	NC_011313	TTTTA	2	10	167705	167714	20 %	80 %	0 %	0 %	209808968
114	NC_011313	TTTTA	2	10	167771	167780	20 %	80 %	0 %	0 %	209808968
115	NC_011313	ACCAA	2	10	168131	168140	60 %	0 %	0 %	40 %	209808968
116	NC_011313	AGATA	2	10	168179	168188	60 %	20 %	20 %	0 %	209808968
117	NC_011313	TTATC	2	10	168883	168892	20 %	60 %	0 %	20 %	209808969
118	NC_011313	GCTGT	2	10	169584	169593	0 %	40 %	40 %	20 %	209808969
119	NC_011313	TATTT	2	10	169610	169619	20 %	80 %	0 %	0 %	209808969
120	NC_011313	AAGAA	2	10	174913	174922	80 %	0 %	20 %	0 %	209808973
121	NC_011313	CTTAG	2	10	176179	176188	20 %	40 %	20 %	20 %	209808975
122	NC_011313	GCATG	2	10	176665	176674	20 %	20 %	40 %	20 %	209808975
123	NC_011313	ATTTT	2	10	180087	180096	20 %	80 %	0 %	0 %	209808977
124	NC_011313	GTATT	2	10	181045	181054	20 %	60 %	20 %	0 %	209808978
125	NC_011313	TTCAC	2	10	182016	182025	20 %	40 %	0 %	40 %	209808979
126	NC_011313	GCATT	2	10	182875	182884	20 %	40 %	20 %	20 %	209808980
127	NC_011313	GCCTA	2	10	185092	185101	20 %	20 %	20 %	40 %	209808981
128	NC_011313	AAATA	2	10	187199	187208	80 %	20 %	0 %	0 %	209808983
129	NC_011313	TAAGA	2	10	187309	187318	60 %	20 %	20 %	0 %	209808983
130	NC_011313	TTCAT	2	10	187936	187945	20 %	60 %	0 %	20 %	209808984
131	NC_011313	CAGTG	2	10	190826	190835	20 %	20 %	40 %	20 %	209808985
132	NC_011313	AATAA	2	10	193508	193517	80 %	20 %	0 %	0 %	209808988
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134	NC_011313	TGATT	2	10	194302	194311	20 %	60 %	20 %	0 %	209808990
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