MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 3840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	CTTT	2	8	1013	1020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011313	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011313	ATTT	2	8	1154	1161	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
4	NC_011313	AATT	2	8	1454	1461	50 %	50 %	0 %	0 %	209808848
5	NC_011313	GACA	2	8	2274	2281	50 %	0 %	25 %	25 %	209808848
6	NC_011313	TGAG	2	8	2291	2298	25 %	25 %	50 %	0 %	209808848
7	NC_011313	CTCG	2	8	2311	2318	0 %	25 %	25 %	50 %	209808848
8	NC_011313	TTAT	2	8	2398	2405	25 %	75 %	0 %	0 %	209808848
9	NC_011313	ATCA	2	8	3328	3335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011313	AATG	2	8	3650	3657	50 %	25 %	25 %	0 %	209808849
11	NC_011313	ATAA	2	8	3770	3777	75 %	25 %	0 %	0 %	209808849
12	NC_011313	TACT	2	8	3784	3791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011313	TATT	2	8	4713	4720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011313	TGTT	2	8	4979	4986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011313	CAGT	2	8	5141	5148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011313	TTTA	2	8	5306	5313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011313	TTGG	2	8	5368	5375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011313	TTCA	2	8	5480	5487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011313	GCAA	2	8	5701	5708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011313	GTTT	2	8	5960	5967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011313	GAAA	2	8	6202	6209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011313	ATTA	2	8	6354	6361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011313	TCAC	2	8	6452	6459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011313	TGAT	2	8	6656	6663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011313	ATTA	2	8	6812	6819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011313	TGCA	2	8	6997	7004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011313	ATCA	2	8	7682	7689	50 %	25 %	0 %	25 %	209808850
28	NC_011313	GTCA	2	8	7902	7909	25 %	25 %	25 %	25 %	209808851
29	NC_011313	TGAG	2	8	8391	8398	25 %	25 %	50 %	0 %	209808851
30	NC_011313	ATAA	2	8	8939	8946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011313	GATT	2	8	9078	9085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011313	AAAT	2	8	9183	9190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011313	GGCT	2	8	9215	9222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011313	ATGC	2	8	9439	9446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011313	CACG	2	8	10057	10064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011313	AGCG	2	8	10382	10389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011313	CTTG	2	8	10823	10830	0 %	50 %	25 %	25 %	209808852
38	NC_011313	TTTC	2	8	10918	10925	0 %	75 %	0 %	25 %	209808852
39	NC_011313	AATG	2	8	11103	11110	50 %	25 %	25 %	0 %	209808852
40	NC_011313	TTGA	2	8	11193	11200	25 %	50 %	25 %	0 %	209808852
41	NC_011313	TTTC	2	8	11238	11245	0 %	75 %	0 %	25 %	209808852
42	NC_011313	TGCA	2	8	11297	11304	25 %	25 %	25 %	25 %	209808852
43	NC_011313	CAAG	2	8	11384	11391	50 %	0 %	25 %	25 %	209808852
44	NC_011313	CATT	2	8	11431	11438	25 %	50 %	0 %	25 %	209808852
45	NC_011313	ATTT	2	8	12250	12257	25 %	75 %	0 %	0 %	209808852
46	NC_011313	CAAA	2	8	12259	12266	75 %	0 %	0 %	25 %	209808852
47	NC_011313	AAAG	2	8	12555	12562	75 %	0 %	25 %	0 %	209808853
48	NC_011313	ACTG	2	8	13185	13192	25 %	25 %	25 %	25 %	209808853
49	NC_011313	ATGA	2	8	13533	13540	50 %	25 %	25 %	0 %	209808853
50	NC_011313	TGGT	2	8	13749	13756	0 %	50 %	50 %	0 %	209808853
51	NC_011313	GTAA	2	8	13927	13934	50 %	25 %	25 %	0 %	209808853
52	NC_011313	TTTG	2	8	14466	14473	0 %	75 %	25 %	0 %	209808854
53	NC_011313	CTTC	2	8	14650	14657	0 %	50 %	0 %	50 %	209808854
54	NC_011313	TAAT	2	8	15292	15299	50 %	50 %	0 %	0 %	209808855
55	NC_011313	AATC	2	8	15638	15645	50 %	25 %	0 %	25 %	209808856
56	NC_011313	AAGA	2	8	16324	16331	75 %	0 %	25 %	0 %	209808856
57	NC_011313	TCTT	2	8	17130	17137	0 %	75 %	0 %	25 %	209808857
58	NC_011313	AAGT	2	8	17183	17190	50 %	25 %	25 %	0 %	209808857
59	NC_011313	GATT	2	8	17394	17401	25 %	50 %	25 %	0 %	209808857
60	NC_011313	ACTC	2	8	17815	17822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011313	CTGA	2	8	18625	18632	25 %	25 %	25 %	25 %	209808858
62	NC_011313	CTGT	2	8	18936	18943	0 %	50 %	25 %	25 %	209808858
63	NC_011313	TAAT	2	8	20103	20110	50 %	50 %	0 %	0 %	209808859
64	NC_011313	TGCA	2	8	20620	20627	25 %	25 %	25 %	25 %	209808860
65	NC_011313	TTCT	2	8	20803	20810	0 %	75 %	0 %	25 %	209808860
66	NC_011313	CTTC	2	8	20996	21003	0 %	50 %	0 %	50 %	209808860
67	NC_011313	GCTC	2	8	21146	21153	0 %	25 %	25 %	50 %	209808860
68	NC_011313	AAAT	2	8	21259	21266	75 %	25 %	0 %	0 %	209808860
69	NC_011313	GTAA	2	8	21681	21688	50 %	25 %	25 %	0 %	209808860
70	NC_011313	TTGC	2	8	21780	21787	0 %	50 %	25 %	25 %	209808860
71	NC_011313	AATC	2	8	22041	22048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011313	ACAA	2	8	22064	22071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011313	TATT	2	8	22342	22349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011313	ACAA	2	8	22421	22428	75 %	0 %	0 %	25 %	209808861
75	NC_011313	TGAT	2	8	22436	22443	25 %	50 %	25 %	0 %	209808861
76	NC_011313	AATA	2	8	22821	22828	75 %	25 %	0 %	0 %	209808861
77	NC_011313	GGCG	2	8	23163	23170	0 %	0 %	75 %	25 %	209808861
78	NC_011313	ACTC	2	8	23410	23417	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
79	NC_011313	ACTC	2	8	23749	23756	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
80	NC_011313	ACTC	2	8	24088	24095	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
81	NC_011313	ACTC	2	8	24766	24773	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
82	NC_011313	ATTT	2	8	26051	26058	25 %	75 %	0 %	0 %	209808861
83	NC_011313	ACTC	2	8	26122	26129	25 %	25 %	0 %	50 %	209808861
84	NC_011313	AATG	2	8	27048	27055	50 %	25 %	25 %	0 %	209808861
85	NC_011313	CATT	2	8	27068	27075	25 %	50 %	0 %	25 %	209808861
86	NC_011313	ATCA	2	8	27284	27291	50 %	25 %	0 %	25 %	209808861
87	NC_011313	GCTA	2	8	27762	27769	25 %	25 %	25 %	25 %	209808861
88	NC_011313	GTGA	2	8	28267	28274	25 %	25 %	50 %	0 %	209808861
89	NC_011313	GACA	2	8	28293	28300	50 %	0 %	25 %	25 %	209808861
90	NC_011313	AATT	2	8	28655	28662	50 %	50 %	0 %	0 %	209808861
91	NC_011313	TGGT	2	8	28826	28833	0 %	50 %	50 %	0 %	209808861
92	NC_011313	GACA	2	8	29247	29254	50 %	0 %	25 %	25 %	209808861
93	NC_011313	ATTA	2	8	29413	29420	50 %	50 %	0 %	0 %	209808861
94	NC_011313	ACGA	2	8	29983	29990	50 %	0 %	25 %	25 %	209808861
95	NC_011313	CAAT	2	8	30363	30370	50 %	25 %	0 %	25 %	209808861
96	NC_011313	AATC	2	8	30982	30989	50 %	25 %	0 %	25 %	209808861
97	NC_011313	GAAA	2	8	31544	31551	75 %	0 %	25 %	0 %	209808862
98	NC_011313	GATT	2	8	31694	31701	25 %	50 %	25 %	0 %	209808862
99	NC_011313	GATC	2	8	31778	31785	25 %	25 %	25 %	25 %	209808862
100	NC_011313	CGCT	2	8	32336	32343	0 %	25 %	25 %	50 %	209808863
101	NC_011313	TCTG	2	8	32511	32518	0 %	50 %	25 %	25 %	209808863
102	NC_011313	CGTG	2	8	32661	32668	0 %	25 %	50 %	25 %	209808863
103	NC_011313	GCAT	2	8	33279	33286	25 %	25 %	25 %	25 %	209808863
104	NC_011313	AGCC	2	8	33503	33510	25 %	0 %	25 %	50 %	209808863
105	NC_011313	TATT	2	8	33534	33541	25 %	75 %	0 %	0 %	209808863
106	NC_011313	AATC	2	8	33640	33647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011313	TTAT	2	8	33779	33786	25 %	75 %	0 %	0 %	209808864
108	NC_011313	TGAT	2	8	34029	34036	25 %	50 %	25 %	0 %	209808864
109	NC_011313	GATA	2	8	34364	34371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011313	TTTC	2	8	34593	34600	0 %	75 %	0 %	25 %	209808865
111	NC_011313	CTTT	2	8	34690	34697	0 %	75 %	0 %	25 %	209808865
112	NC_011313	TATC	2	8	34933	34940	25 %	50 %	0 %	25 %	209808865
113	NC_011313	GTTA	2	8	35189	35196	25 %	50 %	25 %	0 %	209808866
114	NC_011313	ATTT	2	8	35208	35215	25 %	75 %	0 %	0 %	209808866
115	NC_011313	TAGA	2	8	35219	35226	50 %	25 %	25 %	0 %	209808866
116	NC_011313	CAAT	2	8	35571	35578	50 %	25 %	0 %	25 %	209808866
117	NC_011313	CATT	2	8	36252	36259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011313	CAAA	2	8	36379	36386	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011313	AATG	2	8	36392	36399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011313	AAAG	2	8	36614	36621	75 %	0 %	25 %	0 %	209808867
121	NC_011313	TATT	2	8	37052	37059	25 %	75 %	0 %	0 %	209808867
122	NC_011313	CAAA	2	8	37660	37667	75 %	0 %	0 %	25 %	209808867
123	NC_011313	GATG	2	8	37668	37675	25 %	25 %	50 %	0 %	209808867
124	NC_011313	AATT	2	8	38482	38489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011313	CAAT	2	8	38757	38764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011313	TTGT	2	8	39114	39121	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011313	TAAA	2	8	40511	40518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011313	CGCT	2	8	41368	41375	0 %	25 %	25 %	50 %	209808868
129	NC_011313	TCTG	2	8	41543	41550	0 %	50 %	25 %	25 %	209808868
130	NC_011313	CGTG	2	8	41693	41700	0 %	25 %	50 %	25 %	209808868
131	NC_011313	GCAT	2	8	42311	42318	25 %	25 %	25 %	25 %	209808868
132	NC_011313	AGCC	2	8	42535	42542	25 %	0 %	25 %	50 %	209808868
133	NC_011313	TATT	2	8	42566	42573	25 %	75 %	0 %	0 %	209808868
134	NC_011313	AATC	2	8	42672	42679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011313	TTAT	2	8	42811	42818	25 %	75 %	0 %	0 %	209808869
136	NC_011313	TGAT	2	8	43061	43068	25 %	50 %	25 %	0 %	209808869
137	NC_011313	TCAG	2	8	43645	43652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011313	GATT	2	8	43857	43864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011313	CTGC	2	8	43943	43950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011313	ATCA	2	8	45172	45179	50 %	25 %	0 %	25 %	209808871
141	NC_011313	AATT	2	8	45211	45218	50 %	50 %	0 %	0 %	209808871
142	NC_011313	CATT	2	8	45483	45490	25 %	50 %	0 %	25 %	209808871
143	NC_011313	GAAC	2	8	45518	45525	50 %	0 %	25 %	25 %	209808871
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