MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 16307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011313	AAC	2	6	120	125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011313	ATA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011313	GAA	3	9	355	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011313	TAA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011313	AAC	2	6	424	429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011313	ATC	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011313	CAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011313	TTC	2	6	761	766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011313	AAT	3	9	998	1006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011313	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011313	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
13	NC_011313	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
14	NC_011313	ATT	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
15	NC_011313	ACA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
16	NC_011313	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
17	NC_011313	CAG	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209808848
18	NC_011313	TGC	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
19	NC_011313	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
20	NC_011313	TGA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
21	NC_011313	CAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
22	NC_011313	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
23	NC_011313	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
24	NC_011313	ATC	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
25	NC_011313	TGA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
26	NC_011313	ATC	3	9	1820	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808848
27	NC_011313	GAT	2	6	1831	1836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
28	NC_011313	AAG	2	6	1909	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
29	NC_011313	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
30	NC_011313	ATG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808848
31	NC_011313	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808848
32	NC_011313	CTT	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
33	NC_011313	CCA	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808848
34	NC_011313	CTT	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209808848
35	NC_011313	GAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
36	NC_011313	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209808848
37	NC_011313	GCC	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209808848
38	NC_011313	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
39	NC_011313	AGA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
40	NC_011313	TGC	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808848
41	NC_011313	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808848
42	NC_011313	TAA	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808848
43	NC_011313	TAA	2	6	3221	3226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011313	TTC	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011313	TTA	2	6	3369	3374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011313	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808849
47	NC_011313	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011313	ATC	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011313	GGT	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011313	GGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011313	AGA	2	6	4077	4082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011313	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011313	ATA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011313	ATC	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011313	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011313	TTA	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011313	AGG	2	6	4344	4349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011313	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011313	AAT	2	6	4417	4422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011313	ATT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011313	AAT	2	6	4486	4491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011313	CAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011313	TGG	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011313	AGA	2	6	4575	4580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011313	TTG	2	6	4607	4612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011313	ATT	2	6	4673	4678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011313	AAG	2	6	4787	4792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011313	GCA	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011313	TGA	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011313	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011313	TGT	2	6	5354	5359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011313	TGA	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011313	TTC	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011313	CTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011313	TAT	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011313	GTT	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011313	TAA	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011313	GTT	2	6	5740	5745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011313	TGA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011313	GAA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011313	TGA	2	6	6264	6269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011313	ATC	2	6	6341	6346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011313	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011313	CAG	2	6	6398	6403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011313	AAG	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011313	AAG	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011313	TCA	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011313	GCA	2	6	6588	6593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011313	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011313	GAT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011313	TAA	2	6	6777	6782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011313	CCA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011313	CGT	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011313	TGG	3	9	6974	6982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011313	TGC	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011313	GAT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011313	GTA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011313	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808850
99	NC_011313	ATC	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808850
100	NC_011313	TTA	2	6	7669	7674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808850
101	NC_011313	ATT	2	6	7764	7769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011313	GAT	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808851
103	NC_011313	TTG	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
104	NC_011313	CTA	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
105	NC_011313	TCA	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
106	NC_011313	TCA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808851
107	NC_011313	TTG	2	6	8130	8135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808851
108	NC_011313	ATT	2	6	8276	8281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808851
109	NC_011313	GAA	2	6	8527	8532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209808851
110	NC_011313	CCA	2	6	8718	8723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011313	TTG	2	6	8781	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011313	AGC	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011313	AAC	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011313	AGG	2	6	9067	9072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011313	TAT	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011313	TCT	2	6	9198	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011313	AGA	3	9	9288	9296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011313	ATC	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011313	ATG	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011313	TTA	2	6	9389	9394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011313	ATT	2	6	9634	9639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011313	ATT	2	6	9706	9711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011313	TAA	2	6	9737	9742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011313	TAA	2	6	9768	9773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011313	AAC	2	6	9797	9802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011313	TGA	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011313	AAC	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011313	CGA	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011313	TTA	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011313	TGA	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011313	GAT	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011313	TAA	2	6	10670	10675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011313	TTA	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209808852
134	NC_011313	TGA	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
135	NC_011313	TCA	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
136	NC_011313	ATC	2	6	11318	11323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209808852
137	NC_011313	ATG	2	6	11424	11429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808852
138	NC_011313	CCA	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209808852
139	NC_011313	CCT	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209808852
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144	NC_011313	TAA	3	9	12008	12016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808852
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152	NC_011313	TTG	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808853
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261	NC_011313	CAA	2	6	19824	19829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_011313	TAA	2	6	20051	20056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808859
267	NC_011313	TGT	2	6	20155	20160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209808859
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269	NC_011313	TGA	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209808859
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271	NC_011313	TAA	2	6	20398	20403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808859
272	NC_011313	TAA	2	6	20506	20511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808859
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282	NC_011313	TGC	2	6	21274	21279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209808860
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285	NC_011313	AAC	2	6	21891	21896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_011313	TAA	2	6	21917	21922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011313	ATA	2	6	22223	22228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011313	ATA	2	6	22234	22239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011313	GCG	2	6	22336	22341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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498	NC_011313	ATA	2	6	35246	35251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209808866
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