MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome 2

Total Repeats: 479

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011313	AG	3	6	111	116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011313	TC	3	6	3142	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011313	CT	3	6	4290	4295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011313	AT	3	6	4335	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011313	GT	3	6	4559	4564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011313	TC	3	6	5975	5980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011313	AG	3	6	6582	6587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011313	GT	3	6	6918	6923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011313	GT	3	6	6954	6959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011313	TA	3	6	9100	9105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011313	AC	3	6	9317	9322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011313	TC	3	6	12409	12414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011313	GA	3	6	12442	12447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011313	AT	3	6	21983	21988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011313	TC	3	6	22058	22063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011313	TA	3	6	22327	22332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011313	TA	3	6	33620	33625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011313	AT	3	6	40341	40346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011313	TA	3	6	42652	42657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011313	TA	3	6	47515	47520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011313	AT	3	6	55847	55852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011313	AC	3	6	56280	56285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011313	GT	3	6	57340	57345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011313	TA	3	6	59412	59417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011313	AC	3	6	59629	59634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011313	AT	3	6	60099	60104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011313	TA	3	6	62410	62415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011313	AG	3	6	71404	71409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011313	AC	3	6	78536	78541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011313	TG	3	6	90062	90067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011313	AT	3	6	93239	93244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011313	TA	3	6	96317	96322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011313	TA	3	6	97328	97333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011313	AG	3	6	97404	97409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011313	AT	3	6	99269	99274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011313	TC	3	6	101462	101467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011313	AG	3	6	103294	103299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011313	TA	3	6	107380	107385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011313	AT	3	6	108196	108201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011313	AT	3	6	117297	117302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011313	TA	3	6	119215	119220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011313	TA	3	6	120222	120227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011313	AG	3	6	123521	123526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011313	TC	3	6	124095	124100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011313	AT	3	6	124508	124513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011313	TG	3	6	128007	128012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011313	TG	3	6	151848	151853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011313	AT	3	6	152212	152217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011313	TG	3	6	155035	155040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011313	TA	3	6	155253	155258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011313	TG	3	6	157415	157420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011313	GA	3	6	161054	161059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011313	GA	3	6	162601	162606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011313	TC	3	6	163470	163475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011313	AT	3	6	165103	165108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011313	AC	3	6	184529	184534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011313	AC	3	6	186029	186034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011313	AC	3	6	188793	188798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011313	CA	3	6	189044	189049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011313	AC	3	6	189144	189149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011313	CA	3	6	189333	189338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011313	GA	3	6	190016	190021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011313	CA	3	6	191162	191167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011313	AT	3	6	191319	191324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011313	AT	3	6	191394	191399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011313	AC	3	6	195147	195152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011313	AT	3	6	197581	197586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011313	TA	3	6	199121	199126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011313	AG	3	6	202925	202930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011313	TA	3	6	205630	205635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011313	AC	4	8	207373	207380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011313	TC	3	6	208411	208416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011313	AT	3	6	211321	211326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011313	TC	3	6	212934	212939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011313	TG	3	6	216446	216451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011313	TA	3	6	216664	216669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011313	AG	3	6	220683	220688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011313	GT	3	6	224801	224806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011313	AG	3	6	227526	227531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011313	AG	3	6	227544	227549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011313	TC	3	6	227583	227588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011313	TA	3	6	228226	228231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011313	AT	3	6	228526	228531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011313	AC	3	6	230239	230244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011313	GT	3	6	232287	232292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011313	AT	3	6	237171	237176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011313	TC	3	6	242573	242578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011313	TA	3	6	245929	245934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011313	TA	4	8	246891	246898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011313	AG	3	6	248612	248617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011313	TA	3	6	250914	250919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011313	TA	5	10	253872	253881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011313	AC	3	6	255050	255055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011313	AT	3	6	257386	257391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011313	TA	3	6	258489	258494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011313	AT	3	6	260914	260919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011313	TA	3	6	265323	265328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011313	GA	3	6	267308	267313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011313	AT	3	6	278515	278520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011313	AT	3	6	278537	278542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011313	TA	3	6	280153	280158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011313	TA	3	6	281770	281775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011313	TG	3	6	285967	285972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011313	TC	3	6	286056	286061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011313	TG	3	6	286126	286131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011313	AC	3	6	286179	286184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011313	AT	3	6	286210	286215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011313	TG	3	6	287600	287605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011313	TA	3	6	287818	287823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011313	CT	3	6	289637	289642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011313	TG	3	6	293728	293733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011313	TA	3	6	294750	294755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011313	TC	3	6	295906	295911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011313	AG	3	6	296902	296907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011313	TA	3	6	301884	301889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011313	AG	3	6	302801	302806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011313	AG	3	6	302937	302942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011313	CG	3	6	303096	303101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011313	AG	4	8	303182	303189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011313	GA	3	6	304046	304051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011313	TA	3	6	306036	306041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011313	AT	3	6	306782	306787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011313	AT	3	6	306790	306795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011313	AT	3	6	311778	311783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011313	AT	3	6	313354	313359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011313	AG	3	6	313748	313753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011313	CG	3	6	314666	314671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011313	AC	3	6	315108	315113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011313	TA	3	6	322054	322059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011313	AT	3	6	322192	322197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011313	TC	3	6	325355	325360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011313	TG	4	8	345055	345062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011313	TA	3	6	350675	350680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011313	AT	3	6	359804	359809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011313	AG	3	6	362653	362658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011313	AG	3	6	375610	375615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011313	TA	3	6	376960	376965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011313	TA	3	6	378505	378510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011313	TG	3	6	378726	378731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011313	TA	3	6	379156	379161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011313	TA	3	6	379173	379178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011313	TA	3	6	379219	379224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011313	TA	3	6	382466	382471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011313	TA	4	8	385925	385932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011313	CA	3	6	389129	389134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011313	TA	3	6	389861	389866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011313	AT	3	6	390953	390958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011313	AT	3	6	390961	390966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011313	AT	3	6	401198	401203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011313	CT	3	6	404076	404081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011313	TA	3	6	406534	406539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011313	TA	4	8	406589	406596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011313	TA	3	6	409181	409186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011313	AG	3	6	420723	420728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.