MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 10162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	GATC	2	8	113	120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011312	CTTA	2	8	173	180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011312	ATTT	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	209693636
4	NC_011312	AGAA	2	8	825	832	75 %	0 %	25 %	0 %	209693636
5	NC_011312	ATAA	2	8	1271	1278	75 %	25 %	0 %	0 %	209693636
6	NC_011312	ATAA	2	8	1681	1688	75 %	25 %	0 %	0 %	209693636
7	NC_011312	TGTA	2	8	2164	2171	25 %	50 %	25 %	0 %	209693636
8	NC_011312	ACTT	2	8	2275	2282	25 %	50 %	0 %	25 %	209693637
9	NC_011312	GAAT	2	8	2414	2421	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
10	NC_011312	CCAA	2	8	2547	2554	50 %	0 %	0 %	50 %	209693637
11	NC_011312	TCTT	2	8	2665	2672	0 %	75 %	0 %	25 %	209693637
12	NC_011312	TGAA	2	8	2866	2873	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
13	NC_011312	AACC	2	8	2911	2918	50 %	0 %	0 %	50 %	209693637
14	NC_011312	GATA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
15	NC_011312	TATT	2	8	3622	3629	25 %	75 %	0 %	0 %	209693637
16	NC_011312	GCAA	2	8	3871	3878	50 %	0 %	25 %	25 %	209693637
17	NC_011312	TGGG	2	8	3931	3938	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011312	GCTT	2	8	4412	4419	0 %	50 %	25 %	25 %	209693638
19	NC_011312	TAGA	2	8	4504	4511	50 %	25 %	25 %	0 %	209693639
20	NC_011312	GAAA	2	8	6039	6046	75 %	0 %	25 %	0 %	209693641
21	NC_011312	TAGC	2	8	6102	6109	25 %	25 %	25 %	25 %	209693641
22	NC_011312	TTTA	2	8	6458	6465	25 %	75 %	0 %	0 %	209693642
23	NC_011312	TACG	2	8	6781	6788	25 %	25 %	25 %	25 %	209693642
24	NC_011312	AGTG	2	8	7091	7098	25 %	25 %	50 %	0 %	209693642
25	NC_011312	TAAG	2	8	7267	7274	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011312	GCAA	2	8	7744	7751	50 %	0 %	25 %	25 %	209693643
27	NC_011312	TTGG	2	8	8286	8293	0 %	50 %	50 %	0 %	209693643
28	NC_011312	CTTT	2	8	8394	8401	0 %	75 %	0 %	25 %	209693643
29	NC_011312	GATT	2	8	8494	8501	25 %	50 %	25 %	0 %	209693643
30	NC_011312	GTTC	2	8	9160	9167	0 %	50 %	25 %	25 %	209693644
31	NC_011312	ATAA	2	8	10244	10251	75 %	25 %	0 %	0 %	209693645
32	NC_011312	ATTG	2	8	10397	10404	25 %	50 %	25 %	0 %	209693645
33	NC_011312	AGAT	2	8	10551	10558	50 %	25 %	25 %	0 %	209693645
34	NC_011312	ATCA	2	8	10577	10584	50 %	25 %	0 %	25 %	209693645
35	NC_011312	AAAC	2	8	10952	10959	75 %	0 %	0 %	25 %	209693645
36	NC_011312	GTAT	2	8	11156	11163	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
37	NC_011312	CTTT	2	8	11662	11669	0 %	75 %	0 %	25 %	209693646
38	NC_011312	TATC	2	8	11684	11691	25 %	50 %	0 %	25 %	209693646
39	NC_011312	GCTG	2	8	12309	12316	0 %	25 %	50 %	25 %	209693646
40	NC_011312	ATTG	2	8	12651	12658	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
41	NC_011312	AAAG	2	8	12702	12709	75 %	0 %	25 %	0 %	209693646
42	NC_011312	GTTA	2	8	12984	12991	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
43	NC_011312	TTAA	2	8	13264	13271	50 %	50 %	0 %	0 %	209693646
44	NC_011312	CTGA	2	8	14066	14073	25 %	25 %	25 %	25 %	209693647
45	NC_011312	CTGT	2	8	14377	14384	0 %	50 %	25 %	25 %	209693647
46	NC_011312	GCAT	2	8	15892	15899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011312	TATT	2	8	16147	16154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011312	AATC	2	8	16253	16260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011312	TTAT	2	8	16392	16399	25 %	75 %	0 %	0 %	209693648
50	NC_011312	TGAT	2	8	16642	16649	25 %	50 %	25 %	0 %	209693648
51	NC_011312	CAAA	2	8	17130	17137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011312	TCTT	2	8	17629	17636	0 %	75 %	0 %	25 %	209693650
53	NC_011312	GCCA	2	8	17688	17695	25 %	0 %	25 %	50 %	209693650
54	NC_011312	AGAT	2	8	18405	18412	50 %	25 %	25 %	0 %	209693650
55	NC_011312	CGCC	2	8	18551	18558	0 %	0 %	25 %	75 %	209693650
56	NC_011312	CTGA	2	8	19733	19740	25 %	25 %	25 %	25 %	209693652
57	NC_011312	CTGT	2	8	20044	20051	0 %	50 %	25 %	25 %	209693652
58	NC_011312	ACAT	2	8	21209	21216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011312	TAAA	2	8	21517	21524	75 %	25 %	0 %	0 %	209693653
60	NC_011312	CCAT	2	8	21694	21701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011312	GTTA	2	8	21829	21836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011312	CACC	2	8	21916	21923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_011312	GAAT	2	8	22751	22758	50 %	25 %	25 %	0 %	209693654
64	NC_011312	ATCA	2	8	23133	23140	50 %	25 %	0 %	25 %	209693654
65	NC_011312	ATTG	2	8	23330	23337	25 %	50 %	25 %	0 %	209693654
66	NC_011312	ATTT	2	8	23444	23451	25 %	75 %	0 %	0 %	209693654
67	NC_011312	CAAG	2	8	23466	23473	50 %	0 %	25 %	25 %	209693654
68	NC_011312	TAAC	2	8	23555	23562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011312	CTGA	2	8	23933	23940	25 %	25 %	25 %	25 %	209693655
70	NC_011312	CTGT	2	8	24244	24251	0 %	50 %	25 %	25 %	209693655
71	NC_011312	ATAA	2	8	25516	25523	75 %	25 %	0 %	0 %	209693656
72	NC_011312	GATA	2	8	25773	25780	50 %	25 %	25 %	0 %	209693656
73	NC_011312	ATCT	2	8	25902	25909	25 %	50 %	0 %	25 %	209693656
74	NC_011312	TTAA	2	8	26137	26144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011312	TGAC	2	8	26855	26862	25 %	25 %	25 %	25 %	209693657
76	NC_011312	AAGT	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	209693657
77	NC_011312	TTTA	2	8	27005	27012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011312	TTCA	2	8	27085	27092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011312	TATT	2	8	27247	27254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011312	TATT	2	8	27404	27411	25 %	75 %	0 %	0 %	209693658
81	NC_011312	AATC	2	8	27634	27641	50 %	25 %	0 %	25 %	209693658
82	NC_011312	ATCA	2	8	27958	27965	50 %	25 %	0 %	25 %	209693659
83	NC_011312	ATTA	2	8	28429	28436	50 %	50 %	0 %	0 %	209693660
84	NC_011312	GCAA	2	8	28486	28493	50 %	0 %	25 %	25 %	209693660
85	NC_011312	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	209693660
86	NC_011312	TTTG	2	8	29424	29431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011312	AGGC	2	8	29927	29934	25 %	0 %	50 %	25 %	209693661
88	NC_011312	TTTC	2	8	30902	30909	0 %	75 %	0 %	25 %	209693662
89	NC_011312	CTGT	2	8	31150	31157	0 %	50 %	25 %	25 %	209693662
90	NC_011312	GATT	2	8	31880	31887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011312	ATTT	2	8	32140	32147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011312	TTAA	2	8	32700	32707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011312	AAGT	2	8	32709	32716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011312	ACTG	2	8	33459	33466	25 %	25 %	25 %	25 %	209693664
95	NC_011312	GAAT	2	8	33681	33688	50 %	25 %	25 %	0 %	209693664
96	NC_011312	TGAG	2	8	33872	33879	25 %	25 %	50 %	0 %	209693664
97	NC_011312	GTAT	2	8	35327	35334	25 %	50 %	25 %	0 %	209693664
98	NC_011312	TTAA	2	8	35392	35399	50 %	50 %	0 %	0 %	209693664
99	NC_011312	ATGT	2	8	35433	35440	25 %	50 %	25 %	0 %	209693665
100	NC_011312	CTTT	2	8	35835	35842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011312	GTAT	2	8	36052	36059	25 %	50 %	25 %	0 %	209693666
102	NC_011312	AGGC	2	8	36936	36943	25 %	0 %	50 %	25 %	209693667
103	NC_011312	CTGA	2	8	37293	37300	25 %	25 %	25 %	25 %	209693668
104	NC_011312	CTGT	2	8	37604	37611	0 %	50 %	25 %	25 %	209693668
105	NC_011312	AATG	2	8	38561	38568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011312	TTCA	2	8	39322	39329	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011312	TAGA	2	8	39480	39487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011312	TGAA	2	8	39593	39600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011312	GTCA	2	8	40225	40232	25 %	25 %	25 %	25 %	209693669
110	NC_011312	TGAG	2	8	40714	40721	25 %	25 %	50 %	0 %	209693669
111	NC_011312	CCAT	2	8	41045	41052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011312	GAAC	2	8	41158	41165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011312	GTTC	2	8	41169	41176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011312	AAGC	2	8	41342	41349	50 %	0 %	25 %	25 %	209693670
115	NC_011312	TTGG	2	8	41693	41700	0 %	50 %	50 %	0 %	209693670
116	NC_011312	GATG	2	8	41771	41778	25 %	25 %	50 %	0 %	209693670
117	NC_011312	ACAG	2	8	41901	41908	50 %	0 %	25 %	25 %	209693670
118	NC_011312	ACAG	2	8	42077	42084	50 %	0 %	25 %	25 %	209693670
119	NC_011312	TGGA	2	8	42518	42525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011312	TAAA	2	8	43098	43105	75 %	25 %	0 %	0 %	209693671
121	NC_011312	TCAG	2	8	43909	43916	25 %	25 %	25 %	25 %	209693671
122	NC_011312	GTGA	2	8	44479	44486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011312	CTCA	2	8	44600	44607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011312	TGGT	2	8	45309	45316	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
125	NC_011312	TTTA	2	8	45388	45395	25 %	75 %	0 %	0 %	209693672
126	NC_011312	AGCG	2	8	45471	45478	25 %	0 %	50 %	25 %	209693672
127	NC_011312	TGGT	2	8	45705	45712	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
128	NC_011312	TTGG	2	8	45890	45897	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
129	NC_011312	CTTG	2	8	45994	46001	0 %	50 %	25 %	25 %	209693672
130	NC_011312	AAAG	2	8	46091	46098	75 %	0 %	25 %	0 %	209693672
131	NC_011312	TATT	2	8	46745	46752	25 %	75 %	0 %	0 %	209693673
132	NC_011312	GAAA	2	8	47308	47315	75 %	0 %	25 %	0 %	209693673
133	NC_011312	ATGA	2	8	47778	47785	50 %	25 %	25 %	0 %	209693674
134	NC_011312	AGAA	2	8	47875	47882	75 %	0 %	25 %	0 %	209693674
135	NC_011312	TGTT	2	8	48044	48051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011312	AACT	2	8	48324	48331	50 %	25 %	0 %	25 %	209693675
137	NC_011312	GAAT	2	8	48551	48558	50 %	25 %	25 %	0 %	209693675
138	NC_011312	ATTT	2	8	48777	48784	25 %	75 %	0 %	0 %	209693675
139	NC_011312	TTTA	2	8	49336	49343	25 %	75 %	0 %	0 %	209693676
140	NC_011312	TCAA	2	8	49367	49374	50 %	25 %	0 %	25 %	209693676
141	NC_011312	CAAA	2	8	49846	49853	75 %	0 %	0 %	25 %	209693676
142	NC_011312	CATC	2	8	49864	49871	25 %	25 %	0 %	50 %	209693676
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