MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 7534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	ATTT	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	209693636
2	NC_011312	AGAA	2	8	825	832	75 %	0 %	25 %	0 %	209693636
3	NC_011312	ATAA	2	8	1271	1278	75 %	25 %	0 %	0 %	209693636
4	NC_011312	ATAA	2	8	1681	1688	75 %	25 %	0 %	0 %	209693636
5	NC_011312	TGTA	2	8	2164	2171	25 %	50 %	25 %	0 %	209693636
6	NC_011312	ACTT	2	8	2275	2282	25 %	50 %	0 %	25 %	209693637
7	NC_011312	GAAT	2	8	2414	2421	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
8	NC_011312	CCAA	2	8	2547	2554	50 %	0 %	0 %	50 %	209693637
9	NC_011312	TCTT	2	8	2665	2672	0 %	75 %	0 %	25 %	209693637
10	NC_011312	TGAA	2	8	2866	2873	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
11	NC_011312	AACC	2	8	2911	2918	50 %	0 %	0 %	50 %	209693637
12	NC_011312	GATA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	25 %	0 %	209693637
13	NC_011312	TATT	2	8	3622	3629	25 %	75 %	0 %	0 %	209693637
14	NC_011312	GCAA	2	8	3871	3878	50 %	0 %	25 %	25 %	209693637
15	NC_011312	GCTT	2	8	4412	4419	0 %	50 %	25 %	25 %	209693638
16	NC_011312	TAGA	2	8	4504	4511	50 %	25 %	25 %	0 %	209693639
17	NC_011312	GAAA	2	8	6039	6046	75 %	0 %	25 %	0 %	209693641
18	NC_011312	TAGC	2	8	6102	6109	25 %	25 %	25 %	25 %	209693641
19	NC_011312	TTTA	2	8	6458	6465	25 %	75 %	0 %	0 %	209693642
20	NC_011312	TACG	2	8	6781	6788	25 %	25 %	25 %	25 %	209693642
21	NC_011312	AGTG	2	8	7091	7098	25 %	25 %	50 %	0 %	209693642
22	NC_011312	GCAA	2	8	7744	7751	50 %	0 %	25 %	25 %	209693643
23	NC_011312	TTGG	2	8	8286	8293	0 %	50 %	50 %	0 %	209693643
24	NC_011312	CTTT	2	8	8394	8401	0 %	75 %	0 %	25 %	209693643
25	NC_011312	GATT	2	8	8494	8501	25 %	50 %	25 %	0 %	209693643
26	NC_011312	GTTC	2	8	9160	9167	0 %	50 %	25 %	25 %	209693644
27	NC_011312	ATAA	2	8	10244	10251	75 %	25 %	0 %	0 %	209693645
28	NC_011312	ATTG	2	8	10397	10404	25 %	50 %	25 %	0 %	209693645
29	NC_011312	AGAT	2	8	10551	10558	50 %	25 %	25 %	0 %	209693645
30	NC_011312	ATCA	2	8	10577	10584	50 %	25 %	0 %	25 %	209693645
31	NC_011312	AAAC	2	8	10952	10959	75 %	0 %	0 %	25 %	209693645
32	NC_011312	GTAT	2	8	11156	11163	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
33	NC_011312	CTTT	2	8	11662	11669	0 %	75 %	0 %	25 %	209693646
34	NC_011312	TATC	2	8	11684	11691	25 %	50 %	0 %	25 %	209693646
35	NC_011312	GCTG	2	8	12309	12316	0 %	25 %	50 %	25 %	209693646
36	NC_011312	ATTG	2	8	12651	12658	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
37	NC_011312	AAAG	2	8	12702	12709	75 %	0 %	25 %	0 %	209693646
38	NC_011312	GTTA	2	8	12984	12991	25 %	50 %	25 %	0 %	209693646
39	NC_011312	TTAA	2	8	13264	13271	50 %	50 %	0 %	0 %	209693646
40	NC_011312	CTGA	2	8	14066	14073	25 %	25 %	25 %	25 %	209693647
41	NC_011312	CTGT	2	8	14377	14384	0 %	50 %	25 %	25 %	209693647
42	NC_011312	TTAT	2	8	16392	16399	25 %	75 %	0 %	0 %	209693648
43	NC_011312	TGAT	2	8	16642	16649	25 %	50 %	25 %	0 %	209693648
44	NC_011312	TCTT	2	8	17629	17636	0 %	75 %	0 %	25 %	209693650
45	NC_011312	GCCA	2	8	17688	17695	25 %	0 %	25 %	50 %	209693650
46	NC_011312	AGAT	2	8	18405	18412	50 %	25 %	25 %	0 %	209693650
47	NC_011312	CGCC	2	8	18551	18558	0 %	0 %	25 %	75 %	209693650
48	NC_011312	CTGA	2	8	19733	19740	25 %	25 %	25 %	25 %	209693652
49	NC_011312	CTGT	2	8	20044	20051	0 %	50 %	25 %	25 %	209693652
50	NC_011312	TAAA	2	8	21517	21524	75 %	25 %	0 %	0 %	209693653
51	NC_011312	GAAT	2	8	22751	22758	50 %	25 %	25 %	0 %	209693654
52	NC_011312	ATCA	2	8	23133	23140	50 %	25 %	0 %	25 %	209693654
53	NC_011312	ATTG	2	8	23330	23337	25 %	50 %	25 %	0 %	209693654
54	NC_011312	ATTT	2	8	23444	23451	25 %	75 %	0 %	0 %	209693654
55	NC_011312	CAAG	2	8	23466	23473	50 %	0 %	25 %	25 %	209693654
56	NC_011312	CTGA	2	8	23933	23940	25 %	25 %	25 %	25 %	209693655
57	NC_011312	CTGT	2	8	24244	24251	0 %	50 %	25 %	25 %	209693655
58	NC_011312	ATAA	2	8	25516	25523	75 %	25 %	0 %	0 %	209693656
59	NC_011312	GATA	2	8	25773	25780	50 %	25 %	25 %	0 %	209693656
60	NC_011312	ATCT	2	8	25902	25909	25 %	50 %	0 %	25 %	209693656
61	NC_011312	TGAC	2	8	26855	26862	25 %	25 %	25 %	25 %	209693657
62	NC_011312	AAGT	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	209693657
63	NC_011312	TATT	2	8	27404	27411	25 %	75 %	0 %	0 %	209693658
64	NC_011312	AATC	2	8	27634	27641	50 %	25 %	0 %	25 %	209693658
65	NC_011312	ATCA	2	8	27958	27965	50 %	25 %	0 %	25 %	209693659
66	NC_011312	ATTA	2	8	28429	28436	50 %	50 %	0 %	0 %	209693660
67	NC_011312	GCAA	2	8	28486	28493	50 %	0 %	25 %	25 %	209693660
68	NC_011312	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	209693660
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70	NC_011312	TTTC	2	8	30902	30909	0 %	75 %	0 %	25 %	209693662
71	NC_011312	CTGT	2	8	31150	31157	0 %	50 %	25 %	25 %	209693662
72	NC_011312	ACTG	2	8	33459	33466	25 %	25 %	25 %	25 %	209693664
73	NC_011312	GAAT	2	8	33681	33688	50 %	25 %	25 %	0 %	209693664
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75	NC_011312	GTAT	2	8	35327	35334	25 %	50 %	25 %	0 %	209693664
76	NC_011312	TTAA	2	8	35392	35399	50 %	50 %	0 %	0 %	209693664
77	NC_011312	ATGT	2	8	35433	35440	25 %	50 %	25 %	0 %	209693665
78	NC_011312	GTAT	2	8	36052	36059	25 %	50 %	25 %	0 %	209693666
79	NC_011312	AGGC	2	8	36936	36943	25 %	0 %	50 %	25 %	209693667
80	NC_011312	CTGA	2	8	37293	37300	25 %	25 %	25 %	25 %	209693668
81	NC_011312	CTGT	2	8	37604	37611	0 %	50 %	25 %	25 %	209693668
82	NC_011312	GTCA	2	8	40225	40232	25 %	25 %	25 %	25 %	209693669
83	NC_011312	TGAG	2	8	40714	40721	25 %	25 %	50 %	0 %	209693669
84	NC_011312	AAGC	2	8	41342	41349	50 %	0 %	25 %	25 %	209693670
85	NC_011312	TTGG	2	8	41693	41700	0 %	50 %	50 %	0 %	209693670
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89	NC_011312	TAAA	2	8	43098	43105	75 %	25 %	0 %	0 %	209693671
90	NC_011312	TCAG	2	8	43909	43916	25 %	25 %	25 %	25 %	209693671
91	NC_011312	TGGT	2	8	45309	45316	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
92	NC_011312	TTTA	2	8	45388	45395	25 %	75 %	0 %	0 %	209693672
93	NC_011312	AGCG	2	8	45471	45478	25 %	0 %	50 %	25 %	209693672
94	NC_011312	TGGT	2	8	45705	45712	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
95	NC_011312	TTGG	2	8	45890	45897	0 %	50 %	50 %	0 %	209693672
96	NC_011312	CTTG	2	8	45994	46001	0 %	50 %	25 %	25 %	209693672
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99	NC_011312	GAAA	2	8	47308	47315	75 %	0 %	25 %	0 %	209693673
100	NC_011312	ATGA	2	8	47778	47785	50 %	25 %	25 %	0 %	209693674
101	NC_011312	AGAA	2	8	47875	47882	75 %	0 %	25 %	0 %	209693674
102	NC_011312	AACT	2	8	48324	48331	50 %	25 %	0 %	25 %	209693675
103	NC_011312	GAAT	2	8	48551	48558	50 %	25 %	25 %	0 %	209693675
104	NC_011312	ATTT	2	8	48777	48784	25 %	75 %	0 %	0 %	209693675
105	NC_011312	TTTA	2	8	49336	49343	25 %	75 %	0 %	0 %	209693676
106	NC_011312	TCAA	2	8	49367	49374	50 %	25 %	0 %	25 %	209693676
107	NC_011312	CAAA	2	8	49846	49853	75 %	0 %	0 %	25 %	209693676
108	NC_011312	CATC	2	8	49864	49871	25 %	25 %	0 %	50 %	209693676
109	NC_011312	ACCA	2	8	50370	50377	50 %	0 %	0 %	50 %	209693676
110	NC_011312	ATGA	2	8	50974	50981	50 %	25 %	25 %	0 %	209693677
111	NC_011312	TGCT	2	8	51774	51781	0 %	50 %	25 %	25 %	209693678
112	NC_011312	GGTT	2	8	52852	52859	0 %	50 %	50 %	0 %	209693679
113	NC_011312	TGTT	2	8	53003	53010	0 %	75 %	25 %	0 %	209693679
114	NC_011312	TATT	2	8	53040	53047	25 %	75 %	0 %	0 %	209693679
115	NC_011312	CTGA	2	8	53381	53388	25 %	25 %	25 %	25 %	209693680
116	NC_011312	CTGT	2	8	53692	53699	0 %	50 %	25 %	25 %	209693680
117	NC_011312	GAAA	2	8	54765	54772	75 %	0 %	25 %	0 %	209693681
118	NC_011312	ATGA	2	8	55552	55559	50 %	25 %	25 %	0 %	209693682
119	NC_011312	AGTA	2	8	57041	57048	50 %	25 %	25 %	0 %	209693683
120	NC_011312	AGAA	2	8	57299	57306	75 %	0 %	25 %	0 %	209693683
121	NC_011312	TTAG	2	8	57462	57469	25 %	50 %	25 %	0 %	209693683
122	NC_011312	AGCA	2	8	57524	57531	50 %	0 %	25 %	25 %	209693683
123	NC_011312	ATAC	2	8	57837	57844	50 %	25 %	0 %	25 %	209693683
124	NC_011312	TGAA	2	8	58063	58070	50 %	25 %	25 %	0 %	209693683
125	NC_011312	TGAT	2	8	58357	58364	25 %	50 %	25 %	0 %	209693684
126	NC_011312	TAAA	2	8	60205	60212	75 %	25 %	0 %	0 %	209693685
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128	NC_011312	ATTA	2	8	61758	61765	50 %	50 %	0 %	0 %	209693686
129	NC_011312	GTTG	2	8	62546	62553	0 %	50 %	50 %	0 %	209693687
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131	NC_011312	TATT	2	8	62827	62834	25 %	75 %	0 %	0 %	209693687
132	NC_011312	CCTG	2	8	64157	64164	0 %	25 %	25 %	50 %	209693688
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135	NC_011312	CTTT	2	8	64493	64500	0 %	75 %	0 %	25 %	209693689
136	NC_011312	CAAG	2	8	64565	64572	50 %	0 %	25 %	25 %	209693689
137	NC_011312	TGCT	2	8	65922	65929	0 %	50 %	25 %	25 %	209693691
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