MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 36761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	TTA	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693635
2	NC_011312	TGT	2	6	322	327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693635
3	NC_011312	CAG	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693635
4	NC_011312	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693635
5	NC_011312	CAG	2	6	443	448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693635
6	NC_011312	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693635
7	NC_011312	CTT	2	6	521	526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693635
8	NC_011312	TGT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693635
9	NC_011312	TCT	2	6	664	669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693635
10	NC_011312	CAG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693635
11	NC_011312	TAA	2	6	725	730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693635
12	NC_011312	TAA	2	6	847	852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693636
13	NC_011312	TCA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693636
14	NC_011312	GTT	2	6	891	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693636
15	NC_011312	TTC	2	6	910	915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693636
16	NC_011312	GTT	2	6	948	953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693636
17	NC_011312	CTT	2	6	1026	1031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693636
18	NC_011312	TGT	3	9	1252	1260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693636
19	NC_011312	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693636
20	NC_011312	AGA	2	6	1478	1483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693636
21	NC_011312	CTT	2	6	1557	1562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693636
22	NC_011312	AAT	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693636
23	NC_011312	CAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693636
24	NC_011312	TCT	3	9	1637	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693636
25	NC_011312	TGC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693636
26	NC_011312	TTC	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693636
27	NC_011312	ATC	2	6	2014	2019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693636
28	NC_011312	TTG	2	6	2083	2088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693636
29	NC_011312	ATG	2	6	2111	2116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693636
30	NC_011312	CGC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693636
31	NC_011312	ACG	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693637
32	NC_011312	AAG	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693637
33	NC_011312	TCT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693637
34	NC_011312	TGT	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693637
35	NC_011312	GTA	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693637
36	NC_011312	GAA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693637
37	NC_011312	ACC	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693637
38	NC_011312	CAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693637
39	NC_011312	TGC	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693637
40	NC_011312	CAC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693637
41	NC_011312	TCT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693637
42	NC_011312	GTC	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693637
43	NC_011312	AAT	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693637
44	NC_011312	TCA	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693637
45	NC_011312	CAC	3	9	3245	3253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693637
46	NC_011312	GTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693637
47	NC_011312	CAT	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693637
48	NC_011312	AAG	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693637
49	NC_011312	AAT	2	6	3642	3647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693637
50	NC_011312	TGC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693637
51	NC_011312	TTG	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693637
52	NC_011312	CAG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693638
53	NC_011312	CTT	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693638
54	NC_011312	TCA	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693638
55	NC_011312	ACG	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693639
56	NC_011312	CTT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693640
57	NC_011312	TCA	2	6	5064	5069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693640
58	NC_011312	GTT	3	9	5119	5127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693640
59	NC_011312	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209693640
60	NC_011312	ATC	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693640
61	NC_011312	TGT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693640
62	NC_011312	TTA	2	6	5239	5244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693640
63	NC_011312	TCG	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693640
64	NC_011312	CAT	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693640
65	NC_011312	AGC	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693640
66	NC_011312	TTA	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693640
67	NC_011312	ATC	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693640
68	NC_011312	AAT	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693641
69	NC_011312	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693641
70	NC_011312	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693641
71	NC_011312	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693641
72	NC_011312	GAA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693641
73	NC_011312	GCA	2	6	5915	5920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693641
74	NC_011312	CAG	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693641
75	NC_011312	CAA	2	6	5967	5972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693641
76	NC_011312	ATA	2	6	5998	6003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693641
77	NC_011312	AAG	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693641
78	NC_011312	ATG	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693641
79	NC_011312	CTT	2	6	6466	6471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693642
80	NC_011312	GCA	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693642
81	NC_011312	ACA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693642
82	NC_011312	TAA	2	6	6896	6901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693642
83	NC_011312	ACG	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693642
84	NC_011312	GGC	2	6	7061	7066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693642
85	NC_011312	AAG	2	6	7467	7472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
86	NC_011312	TTA	2	6	7610	7615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693643
87	NC_011312	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693643
88	NC_011312	CAC	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693643
89	NC_011312	CGG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693643
90	NC_011312	GCT	2	6	7715	7720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693643
91	NC_011312	TGA	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693643
92	NC_011312	GCT	3	9	7883	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693643
93	NC_011312	GGC	2	6	7943	7948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693643
94	NC_011312	GAA	2	6	8087	8092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
95	NC_011312	TTA	2	6	8101	8106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693643
96	NC_011312	GAT	2	6	8132	8137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693643
97	NC_011312	TAA	2	6	8152	8157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693643
98	NC_011312	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
99	NC_011312	TTC	2	6	8177	8182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693643
100	NC_011312	CAA	2	6	8213	8218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693643
101	NC_011312	AGA	2	6	8263	8268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
102	NC_011312	ACC	2	6	8314	8319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209693643
103	NC_011312	TGA	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693643
104	NC_011312	AGA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
105	NC_011312	TCA	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693643
106	NC_011312	TTA	2	6	8525	8530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693643
107	NC_011312	ATA	2	6	8559	8564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693643
108	NC_011312	TGG	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209693643
109	NC_011312	GAA	2	6	8774	8779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
110	NC_011312	AGA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693643
111	NC_011312	ATC	2	6	8824	8829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693643
112	NC_011312	TAT	2	6	8862	8867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693644
113	NC_011312	TTA	2	6	8893	8898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693644
114	NC_011312	CAA	2	6	8908	8913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693644
115	NC_011312	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693644
116	NC_011312	TTA	2	6	9023	9028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693644
117	NC_011312	TTA	2	6	9321	9326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693644
118	NC_011312	ATG	2	6	9337	9342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693644
119	NC_011312	CAA	2	6	9436	9441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693644
120	NC_011312	CTT	2	6	9481	9486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693644
121	NC_011312	TTG	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693644
122	NC_011312	TAA	2	6	9621	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693644
123	NC_011312	TGC	2	6	9672	9677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693644
124	NC_011312	AAC	2	6	9724	9729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693644
125	NC_011312	AAC	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693644
126	NC_011312	AAG	3	9	9761	9769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693644
127	NC_011312	AGA	2	6	9771	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209693644
128	NC_011312	ACA	2	6	9895	9900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693644
129	NC_011312	TGT	2	6	9951	9956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693644
130	NC_011312	ATT	2	6	10007	10012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693645
131	NC_011312	ATT	2	6	10166	10171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693645
132	NC_011312	TAC	2	6	10210	10215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693645
133	NC_011312	CGT	2	6	10385	10390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693645
134	NC_011312	AAC	2	6	10467	10472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693645
135	NC_011312	TTA	2	6	10481	10486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693645
136	NC_011312	CAA	2	6	10601	10606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693645
137	NC_011312	TAC	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693645
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139	NC_011312	CGG	2	6	10735	10740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209693645
140	NC_011312	CCG	2	6	10924	10929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209693645
141	NC_011312	TTA	2	6	10974	10979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693645
142	NC_011312	CTG	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693645
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144	NC_011312	CGA	2	6	11175	11180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693646
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151	NC_011312	TGA	2	6	11397	11402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693646
152	NC_011312	CAA	2	6	11509	11514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209693646
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161	NC_011312	GTT	2	6	12055	12060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693646
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163	NC_011312	CTG	2	6	12371	12376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693646
164	NC_011312	TCT	2	6	12478	12483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693646
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253	NC_011312	TGT	2	6	18922	18927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209693651
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255	NC_011312	TCT	2	6	18961	18966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693651
256	NC_011312	AAT	2	6	19070	19075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209693651
257	NC_011312	TTA	2	6	19713	19718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209693652
258	NC_011312	TGC	2	6	19719	19724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209693652
259	NC_011312	GAC	2	6	19802	19807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693652
260	NC_011312	ACG	3	9	19938	19946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209693652
261	NC_011312	GTA	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209693652
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263	NC_011312	CTA	2	6	20003	20008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693652
264	NC_011312	ATC	2	6	20017	20022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209693652
265	NC_011312	TCT	2	6	20023	20028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209693652
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