MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 4421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011312	AG	3	6	621	626	50 %	0 %	50 %	0 %	209693635
3	NC_011312	CG	3	6	1309	1314	0 %	0 %	50 %	50 %	209693636
4	NC_011312	CT	3	6	1405	1410	0 %	50 %	0 %	50 %	209693636
5	NC_011312	TG	3	6	3776	3781	0 %	50 %	50 %	0 %	209693637
6	NC_011312	GA	3	6	4464	4469	50 %	0 %	50 %	0 %	209693638
7	NC_011312	AG	3	6	5135	5140	50 %	0 %	50 %	0 %	209693640
8	NC_011312	TC	3	6	5473	5478	0 %	50 %	0 %	50 %	209693640
9	NC_011312	AG	3	6	5504	5509	50 %	0 %	50 %	0 %	209693640
10	NC_011312	CT	3	6	6230	6235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011312	TA	3	6	6275	6280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011312	GT	3	6	7282	7287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011312	TA	3	6	8850	8855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011312	AG	3	6	10254	10259	50 %	0 %	50 %	0 %	209693645
15	NC_011312	GA	5	10	10664	10673	50 %	0 %	50 %	0 %	209693645
16	NC_011312	CA	3	6	12602	12607	50 %	0 %	0 %	50 %	209693646
17	NC_011312	GT	3	6	13286	13291	0 %	50 %	50 %	0 %	209693646
18	NC_011312	GT	3	6	13714	13719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011312	AT	3	6	15046	15051	50 %	50 %	0 %	0 %	209693647
20	NC_011312	TG	3	6	16015	16020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011312	TA	3	6	16233	16238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011312	AT	3	6	20716	20721	50 %	50 %	0 %	0 %	209693652
23	NC_011312	TA	3	6	21098	21103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011312	AT	3	6	22035	22040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011312	TG	3	6	22355	22360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011312	GA	4	8	23066	23073	50 %	0 %	50 %	0 %	209693654
27	NC_011312	AT	3	6	24916	24921	50 %	50 %	0 %	0 %	209693655
28	NC_011312	TC	3	6	25580	25585	0 %	50 %	0 %	50 %	209693656
29	NC_011312	TA	3	6	26277	26282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011312	TG	3	6	27433	27438	0 %	50 %	50 %	0 %	209693658
31	NC_011312	TG	4	8	29095	29102	0 %	50 %	50 %	0 %	209693660
32	NC_011312	AG	3	6	29207	29212	50 %	0 %	50 %	0 %	209693660
33	NC_011312	AT	3	6	29242	29247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011312	TC	3	6	29321	29326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011312	AT	3	6	30234	30239	50 %	50 %	0 %	0 %	209693661
36	NC_011312	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	209693661
37	NC_011312	GA	3	6	30880	30885	50 %	0 %	50 %	0 %	209693662
38	NC_011312	AG	3	6	31322	31327	50 %	0 %	50 %	0 %	209693662
39	NC_011312	CG	3	6	32525	32530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011312	TG	3	6	32608	32613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011312	CT	3	6	33694	33699	0 %	50 %	0 %	50 %	209693664
42	NC_011312	TC	3	6	33821	33826	0 %	50 %	0 %	50 %	209693664
43	NC_011312	GA	4	8	33963	33970	50 %	0 %	50 %	0 %	209693664
44	NC_011312	TG	3	6	34164	34169	0 %	50 %	50 %	0 %	209693664
45	NC_011312	TG	3	6	34416	34421	0 %	50 %	50 %	0 %	209693664
46	NC_011312	AT	3	6	38273	38278	50 %	50 %	0 %	0 %	209693668
47	NC_011312	TA	3	6	39917	39922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011312	AT	3	6	40135	40140	50 %	50 %	0 %	0 %	209693669
49	NC_011312	GA	3	6	40209	40214	50 %	0 %	50 %	0 %	209693669
50	NC_011312	TG	3	6	40405	40410	0 %	50 %	50 %	0 %	209693669
51	NC_011312	TC	3	6	40858	40863	0 %	50 %	0 %	50 %	209693669
52	NC_011312	AT	3	6	41065	41070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011312	TG	3	6	41404	41409	0 %	50 %	50 %	0 %	209693670
54	NC_011312	AG	3	6	42489	42494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011312	AT	3	6	42928	42933	50 %	50 %	0 %	0 %	209693671
56	NC_011312	TA	4	8	44805	44812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011312	AG	3	6	46126	46131	50 %	0 %	50 %	0 %	209693672
58	NC_011312	GA	3	6	46411	46416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011312	CT	3	6	49760	49765	0 %	50 %	0 %	50 %	209693676
60	NC_011312	TA	3	6	50553	50558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011312	AT	3	6	50597	50602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011312	GT	3	6	50676	50681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011312	CG	3	6	50763	50768	0 %	0 %	50 %	50 %	209693677
64	NC_011312	TG	3	6	53020	53025	0 %	50 %	50 %	0 %	209693679
65	NC_011312	AG	3	6	53102	53107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011312	AT	3	6	54364	54369	50 %	50 %	0 %	0 %	209693680
67	NC_011312	GA	3	6	55202	55207	50 %	0 %	50 %	0 %	209693682
68	NC_011312	TC	3	6	55295	55300	0 %	50 %	0 %	50 %	209693682
69	NC_011312	CA	3	6	55311	55316	50 %	0 %	0 %	50 %	209693682
70	NC_011312	AT	3	6	55605	55610	50 %	50 %	0 %	0 %	209693682
71	NC_011312	AT	3	6	55967	55972	50 %	50 %	0 %	0 %	209693682
72	NC_011312	AT	3	6	56193	56198	50 %	50 %	0 %	0 %	209693682
73	NC_011312	AT	3	6	60035	60040	50 %	50 %	0 %	0 %	209693685
74	NC_011312	AT	4	8	61702	61709	50 %	50 %	0 %	0 %	209693686
75	NC_011312	TA	4	8	61854	61861	50 %	50 %	0 %	0 %	209693686
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79	NC_011312	AT	3	6	65116	65121	50 %	50 %	0 %	0 %	209693690
80	NC_011312	CG	3	6	65537	65542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011312	AT	3	6	65814	65819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_011312	AT	3	6	69866	69871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011312	TC	3	6	70044	70049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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89	NC_011312	TA	3	6	72654	72659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011312	AG	3	6	75161	75166	50 %	0 %	50 %	0 %	209693696
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92	NC_011312	AG	4	8	77518	77525	50 %	0 %	50 %	0 %	209693697
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94	NC_011312	CT	3	6	79432	79437	0 %	50 %	0 %	50 %	209693700
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100	NC_011312	AT	3	6	84188	84193	50 %	50 %	0 %	0 %	209693705
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103	NC_011312	TA	3	6	86174	86179	50 %	50 %	0 %	0 %	209693709
104	NC_011312	TG	3	6	86394	86399	0 %	50 %	50 %	0 %	209693709
105	NC_011312	TA	3	6	86540	86545	50 %	50 %	0 %	0 %	209693709
106	NC_011312	CT	3	6	86742	86747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011312	TG	3	6	86949	86954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011312	AC	3	6	88343	88348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011312	AC	3	6	88512	88517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011312	CA	3	6	88689	88694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011312	AC	3	6	89921	89926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011312	GA	3	6	90627	90632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011312	CT	3	6	90708	90713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011312	GT	3	6	91822	91827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011312	TG	3	6	92326	92331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011312	AC	3	6	93720	93725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011312	AC	3	6	93889	93894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011312	CA	3	6	94066	94071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011312	AC	3	6	95500	95505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011312	GA	3	6	96203	96208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011312	CT	3	6	96284	96289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011312	GT	3	6	97398	97403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011312	TG	3	6	97902	97907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_011312	AC	3	6	99465	99470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011312	CA	3	6	99642	99647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011312	AC	3	6	101170	101175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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129	NC_011312	CT	3	6	101957	101962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011312	GT	3	6	103071	103076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011312	TG	3	6	103575	103580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011312	AC	3	6	104969	104974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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134	NC_011312	CA	3	6	105315	105320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011312	AC	3	6	106943	106948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011312	GA	3	6	107649	107654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_011312	AT	3	6	109267	109272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011312	TG	3	6	109348	109353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011312	AC	3	6	110742	110747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_011312	AT	3	6	115732	115737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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